MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	CT	3	6	315	320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011260	CT	4	8	436	443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011260	CT	4	8	446	453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011260	TC	3	6	457	462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011260	TC	3	6	478	483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011260	CT	3	6	595	600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011260	AT	3	6	649	654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011260	TA	3	6	830	835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011260	TA	3	6	1398	1403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011260	AT	3	6	1564	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011260	TA	4	8	1638	1645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011260	AT	3	6	2507	2512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011260	CA	3	6	2586	2591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011260	AT	3	6	2704	2709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011260	AT	3	6	3247	3252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011260	AG	3	6	3477	3482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011260	AT	3	6	3837	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011260	TA	3	6	4004	4009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011260	AT	4	8	4112	4119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011260	TA	4	8	7635	7642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011260	AT	3	6	8097	8102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011260	AG	3	6	8136	8141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011260	TA	3	6	9065	9070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011260	AG	3	6	9314	9319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011260	AG	3	6	9430	9435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011260	AT	3	6	11712	11717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011260	TA	4	8	12355	12362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011260	AC	3	6	13244	13249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011260	AT	3	6	13302	13307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011260	AT	3	6	13527	13532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011260	AT	3	6	13673	13678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011260	AT	3	6	14036	14041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011260	AT	3	6	14273	14278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011260	AT	3	6	15166	15171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011260	TA	3	6	15397	15402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011260	AG	3	6	18772	18777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011260	AT	3	6	18885	18890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011260	AT	3	6	18951	18956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011260	TA	3	6	19052	19057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011260	TA	4	8	19165	19172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011260	AT	3	6	19853	19858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011260	AT	3	6	20044	20049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011260	TA	3	6	20076	20081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011260	TC	3	6	20948	20953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011260	GA	3	6	21122	21127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011260	TC	3	6	21130	21135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011260	AT	3	6	21748	21753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011260	TA	3	6	22113	22118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011260	AT	3	6	22346	22351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011260	AT	3	6	22359	22364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011260	AT	3	6	22493	22498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011260	AT	3	6	22569	22574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011260	AT	4	8	23191	23198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011260	CT	3	6	24989	24994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011260	AG	3	6	25135	25140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011260	AG	3	6	25152	25157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011260	GA	3	6	25161	25166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011260	GA	3	6	25168	25173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011260	AT	3	6	26346	26351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011260	AT	3	6	26423	26428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011260	TG	3	6	26531	26536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011260	CT	3	6	27298	27303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011260	CT	3	6	27414	27419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011260	TC	3	6	28530	28535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011260	TC	4	8	28554	28561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011260	TC	3	6	28587	28592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011260	TA	3	6	28700	28705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011260	TG	3	6	29946	29951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011260	TC	3	6	31620	31625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011260	AC	3	6	32951	32956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011260	AT	3	6	33404	33409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011260	CT	3	6	33629	33634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011260	AT	3	6	33663	33668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011260	AT	3	6	33712	33717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011260	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011260	AG	3	6	38049	38054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011260	CT	3	6	38063	38068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011260	AT	3	6	38193	38198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011260	AG	4	8	38522	38529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011260	AG	3	6	38533	38538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011260	TA	3	6	39206	39211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011260	CT	3	6	40640	40645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011260	TA	3	6	40672	40677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011260	AG	3	6	40790	40795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011260	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011260	AT	3	6	41490	41495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011260	TA	3	6	42822	42827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011260	AG	3	6	42859	42864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011260	CT	3	6	42873	42878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011260	TA	3	6	42906	42911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011260	AG	3	6	44139	44144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011260	CT	3	6	44156	44161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011260	AG	3	6	44259	44264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011260	AG	3	6	44292	44297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011260	AG	4	8	44302	44309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011260	AG	5	10	44313	44322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011260	GT	3	6	45057	45062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011260	AT	3	6	45072	45077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011260	AT	3	6	45234	45239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011260	AT	3	6	45321	45326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011260	TA	3	6	45352	45357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011260	TC	3	6	46324	46329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011260	GA	3	6	46352	46357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011260	AG	3	6	47428	47433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011260	GA	3	6	48947	48952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011260	AT	3	6	49013	49018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011260	CT	3	6	49060	49065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011260	TA	3	6	49092	49097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011260	TA	3	6	49108	49113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011260	GA	3	6	49224	49229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011260	AT	3	6	49784	49789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011260	GA	3	6	50132	50137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011260	AG	3	6	50208	50213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011260	CT	3	6	50223	50228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011260	AG	3	6	50489	50494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011260	TA	3	6	51881	51886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011260	TA	4	8	51890	51897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011260	TA	3	6	52445	52450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.