MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	T	6	6	1200	1205	0 %	100 %	0 %	0 %	203288437
2	NC_011260	A	7	7	4314	4320	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
3	NC_011260	A	6	6	4378	4383	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
4	NC_011260	A	6	6	4462	4467	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
5	NC_011260	A	8	8	4504	4511	100 %	0 %	0 %	0 %	203288438
6	NC_011260	T	6	6	5092	5097	0 %	100 %	0 %	0 %	203288439
7	NC_011260	A	6	6	5181	5186	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
8	NC_011260	A	8	8	5337	5344	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
9	NC_011260	A	6	6	5357	5362	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
10	NC_011260	A	6	6	5420	5425	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
11	NC_011260	A	7	7	5442	5448	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
12	NC_011260	A	7	7	5528	5534	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
13	NC_011260	A	6	6	5560	5565	100 %	0 %	0 %	0 %	203288439
14	NC_011260	A	8	8	5705	5712	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
15	NC_011260	A	6	6	5801	5806	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
16	NC_011260	A	7	7	5808	5814	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
17	NC_011260	A	7	7	6073	6079	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
18	NC_011260	A	10	10	6081	6090	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
19	NC_011260	A	8	8	6135	6142	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
20	NC_011260	G	6	6	6175	6180	0 %	0 %	100 %	0 %	203288440
21	NC_011260	A	7	7	6201	6207	100 %	0 %	0 %	0 %	203288440
22	NC_011260	T	7	7	6268	6274	0 %	100 %	0 %	0 %	203288441
23	NC_011260	T	6	6	6348	6353	0 %	100 %	0 %	0 %	203288441
24	NC_011260	A	7	7	6705	6711	100 %	0 %	0 %	0 %	203288441
25	NC_011260	T	6	6	6863	6868	0 %	100 %	0 %	0 %	203288441
26	NC_011260	A	7	7	7344	7350	100 %	0 %	0 %	0 %	203288442
27	NC_011260	A	7	7	7371	7377	100 %	0 %	0 %	0 %	203288442
28	NC_011260	A	6	6	7522	7527	100 %	0 %	0 %	0 %	203288442
29	NC_011260	A	6	6	8666	8671	100 %	0 %	0 %	0 %	203288443
30	NC_011260	A	7	7	8692	8698	100 %	0 %	0 %	0 %	203288443
31	NC_011260	T	6	6	10783	10788	0 %	100 %	0 %	0 %	203288444
32	NC_011260	T	6	6	16014	16019	0 %	100 %	0 %	0 %	203288446
33	NC_011260	A	6	6	16290	16295	100 %	0 %	0 %	0 %	203288447
34	NC_011260	T	6	6	16686	16691	0 %	100 %	0 %	0 %	203288447
35	NC_011260	T	7	7	16892	16898	0 %	100 %	0 %	0 %	203288447
36	NC_011260	T	6	6	16957	16962	0 %	100 %	0 %	0 %	203288448
37	NC_011260	T	7	7	17012	17018	0 %	100 %	0 %	0 %	203288448
38	NC_011260	T	6	6	17020	17025	0 %	100 %	0 %	0 %	203288448
39	NC_011260	T	6	6	17068	17073	0 %	100 %	0 %	0 %	203288448
40	NC_011260	T	6	6	17151	17156	0 %	100 %	0 %	0 %	203288448
41	NC_011260	A	6	6	17178	17183	100 %	0 %	0 %	0 %	203288448
42	NC_011260	T	7	7	17235	17241	0 %	100 %	0 %	0 %	203288448
43	NC_011260	A	6	6	17269	17274	100 %	0 %	0 %	0 %	203288448
44	NC_011260	T	9	9	17406	17414	0 %	100 %	0 %	0 %	203288448
45	NC_011260	T	6	6	17463	17468	0 %	100 %	0 %	0 %	203288449
46	NC_011260	T	6	6	17680	17685	0 %	100 %	0 %	0 %	203288449
47	NC_011260	T	6	6	17689	17694	0 %	100 %	0 %	0 %	203288449
48	NC_011260	T	7	7	17842	17848	0 %	100 %	0 %	0 %	203288449
49	NC_011260	T	6	6	18078	18083	0 %	100 %	0 %	0 %	203288449
50	NC_011260	T	6	6	18226	18231	0 %	100 %	0 %	0 %	203288449
51	NC_011260	T	6	6	18268	18273	0 %	100 %	0 %	0 %	203288449
52	NC_011260	T	8	8	18400	18407	0 %	100 %	0 %	0 %	203288449
53	NC_011260	T	6	6	20376	20381	0 %	100 %	0 %	0 %	203288450
54	NC_011260	T	6	6	20504	20509	0 %	100 %	0 %	0 %	203288450
55	NC_011260	A	6	6	21517	21522	100 %	0 %	0 %	0 %	203288451
56	NC_011260	T	6	6	21578	21583	0 %	100 %	0 %	0 %	203288451
57	NC_011260	T	6	6	29277	29282	0 %	100 %	0 %	0 %	203288453
58	NC_011260	T	6	6	30657	30662	0 %	100 %	0 %	0 %	203288454
59	NC_011260	A	6	6	31846	31851	100 %	0 %	0 %	0 %	203288455
60	NC_011260	A	7	7	34167	34173	100 %	0 %	0 %	0 %	203288456
61	NC_011260	A	7	7	34340	34346	100 %	0 %	0 %	0 %	203288456
62	NC_011260	T	6	6	34616	34621	0 %	100 %	0 %	0 %	203288457
63	NC_011260	T	6	6	34894	34899	0 %	100 %	0 %	0 %	203288457
64	NC_011260	T	6	6	34962	34967	0 %	100 %	0 %	0 %	203288457
65	NC_011260	T	6	6	35129	35134	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
66	NC_011260	T	6	6	35138	35143	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
67	NC_011260	T	7	7	35181	35187	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
68	NC_011260	T	6	6	35243	35248	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
69	NC_011260	T	7	7	35283	35289	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
70	NC_011260	T	6	6	35299	35304	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
71	NC_011260	T	8	8	35306	35313	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
72	NC_011260	T	6	6	35315	35320	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
73	NC_011260	T	6	6	35396	35401	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
74	NC_011260	T	8	8	35421	35428	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
75	NC_011260	T	7	7	35568	35574	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
76	NC_011260	A	6	6	35654	35659	100 %	0 %	0 %	0 %	203288458
77	NC_011260	T	7	7	35758	35764	0 %	100 %	0 %	0 %	203288458
78	NC_011260	A	6	6	37262	37267	100 %	0 %	0 %	0 %	203288459
79	NC_011260	A	6	6	37337	37342	100 %	0 %	0 %	0 %	203288459
80	NC_011260	A	6	6	38789	38794	100 %	0 %	0 %	0 %	203288460
81	NC_011260	A	7	7	38981	38987	100 %	0 %	0 %	0 %	203288460
82	NC_011260	A	7	7	39712	39718	100 %	0 %	0 %	0 %	203288461
83	NC_011260	A	6	6	39750	39755	100 %	0 %	0 %	0 %	203288461
84	NC_011260	A	6	6	39878	39883	100 %	0 %	0 %	0 %	203288461
85	NC_011260	A	6	6	40012	40017	100 %	0 %	0 %	0 %	203288461
86	NC_011260	A	6	6	40459	40464	100 %	0 %	0 %	0 %	203288461
87	NC_011260	A	7	7	43049	43055	100 %	0 %	0 %	0 %	203288463
88	NC_011260	A	6	6	44767	44772	100 %	0 %	0 %	0 %	203288464

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.