MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23b

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011259	TCTTT	2	10	531	540	0 %	80 %	0 %	20 %	203288820
2	NC_011259	TATTT	2	10	1729	1738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011259	AAAAT	2	10	4856	4865	80 %	20 %	0 %	0 %	203288823
4	NC_011259	ATTTT	2	10	6044	6053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011259	TATTT	2	10	6668	6677	20 %	80 %	0 %	0 %	203288824
6	NC_011259	TAATA	2	10	8606	8615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011259	TTTAA	2	10	8804	8813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011259	AAGTA	2	10	8823	8832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011259	GATAA	2	10	9972	9981	60 %	20 %	20 %	0 %	203288826
10	NC_011259	AGATA	2	10	10676	10685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011259	GAAGT	2	10	11979	11988	40 %	20 %	40 %	0 %	203288827
12	NC_011259	ATTAT	2	10	13267	13276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011259	TAAAG	2	10	15227	15236	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011259	TTTTA	2	10	15263	15272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011259	ATTTT	2	10	15547	15556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011259	TAATT	2	10	17228	17237	40 %	60 %	0 %	0 %	203288829
17	NC_011259	TTTTC	2	10	18253	18262	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011259	TTCTT	2	10	18423	18432	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011259	AGATA	2	10	20276	20285	60 %	20 %	20 %	0 %	203288831
20	NC_011259	TATCT	2	10	21539	21548	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011259	ATTAT	2	10	22742	22751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.