MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23b

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011259	TCTT	2	8	257	264	0 %	75 %	0 %	25 %	203288820
2	NC_011259	TGCT	2	8	406	413	0 %	50 %	25 %	25 %	203288820
3	NC_011259	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	203288820
4	NC_011259	ATTG	2	8	1335	1342	25 %	50 %	25 %	0 %	203288820
5	NC_011259	TATT	2	8	1363	1370	25 %	75 %	0 %	0 %	203288820
6	NC_011259	ATTT	2	8	1508	1515	25 %	75 %	0 %	0 %	203288820
7	NC_011259	TATT	2	8	1793	1800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011259	TCTT	2	8	1955	1962	0 %	75 %	0 %	25 %	203288821
9	NC_011259	TTTA	2	8	2562	2569	25 %	75 %	0 %	0 %	203288821
10	NC_011259	TGTT	2	8	2615	2622	0 %	75 %	25 %	0 %	203288821
11	NC_011259	ACTT	2	8	2813	2820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011259	AAGA	2	8	3061	3068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011259	ATGT	2	8	3302	3309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011259	GATA	2	8	3603	3610	50 %	25 %	25 %	0 %	203288822
15	NC_011259	AACA	2	8	3834	3841	75 %	0 %	0 %	25 %	203288822
16	NC_011259	TTGC	2	8	4025	4032	0 %	50 %	25 %	25 %	203288822
17	NC_011259	TAAA	2	8	4038	4045	75 %	25 %	0 %	0 %	203288822
18	NC_011259	ATAA	2	8	4514	4521	75 %	25 %	0 %	0 %	203288822
19	NC_011259	GAAG	2	8	4558	4565	50 %	0 %	50 %	0 %	203288822
20	NC_011259	ATTT	2	8	4759	4766	25 %	75 %	0 %	0 %	203288823
21	NC_011259	TTTA	2	8	4820	4827	25 %	75 %	0 %	0 %	203288823
22	NC_011259	TTGT	2	8	4902	4909	0 %	75 %	25 %	0 %	203288823
23	NC_011259	ATTA	2	8	5111	5118	50 %	50 %	0 %	0 %	203288823
24	NC_011259	ATTT	2	8	5497	5504	25 %	75 %	0 %	0 %	203288823
25	NC_011259	AATT	2	8	6236	6243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011259	TTTG	2	8	6282	6289	0 %	75 %	25 %	0 %	203288824
27	NC_011259	AAAG	2	8	6462	6469	75 %	0 %	25 %	0 %	203288824
28	NC_011259	TAAT	2	8	6814	6821	50 %	50 %	0 %	0 %	203288824
29	NC_011259	TTTG	2	8	7233	7240	0 %	75 %	25 %	0 %	203288825
30	NC_011259	ATCA	2	8	7357	7364	50 %	25 %	0 %	25 %	203288825
31	NC_011259	TTGT	2	8	7685	7692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011259	AAAT	2	8	8071	8078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011259	TTAA	2	8	8177	8184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011259	AGAT	2	8	8189	8196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011259	ATTA	2	8	8203	8210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011259	TTTA	2	8	8268	8275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011259	TTGT	2	8	8838	8845	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011259	ATTT	2	8	9043	9050	25 %	75 %	0 %	0 %	203288826
39	NC_011259	GATA	2	8	9092	9099	50 %	25 %	25 %	0 %	203288826
40	NC_011259	ATTA	2	8	9647	9654	50 %	50 %	0 %	0 %	203288826
41	NC_011259	AATT	2	8	10039	10046	50 %	50 %	0 %	0 %	203288826
42	NC_011259	TTTA	2	8	10316	10323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011259	AATT	2	8	10482	10489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011259	ATAA	2	8	10542	10549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011259	TTAT	2	8	10607	10614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011259	TATT	3	12	10619	10630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011259	ATTA	2	8	10637	10644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011259	TGCT	2	8	11322	11329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011259	AAAG	2	8	11524	11531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011259	ATTA	2	8	11558	11565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011259	GTTT	2	8	11676	11683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011259	AATT	2	8	12144	12151	50 %	50 %	0 %	0 %	203288827
53	NC_011259	TGAT	2	8	12444	12451	25 %	50 %	25 %	0 %	203288827
54	NC_011259	TAAT	2	8	12830	12837	50 %	50 %	0 %	0 %	203288827
55	NC_011259	ATTT	2	8	13257	13264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011259	GAAG	2	8	13517	13524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011259	AAAG	2	8	13631	13638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011259	AAAG	2	8	14060	14067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011259	TAAT	2	8	14309	14316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011259	AGGA	2	8	14599	14606	50 %	0 %	50 %	0 %	203288828
61	NC_011259	GAAA	2	8	14755	14762	75 %	0 %	25 %	0 %	203288828
62	NC_011259	GGAA	2	8	14879	14886	50 %	0 %	50 %	0 %	203288828
63	NC_011259	TAAA	2	8	14944	14951	75 %	25 %	0 %	0 %	203288828
64	NC_011259	ATAG	2	8	15015	15022	50 %	25 %	25 %	0 %	203288828
65	NC_011259	TAAA	2	8	15215	15222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011259	ACAA	2	8	15330	15337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011259	TGAG	2	8	15794	15801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011259	TAAG	2	8	16027	16034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011259	AAGT	2	8	16295	16302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011259	AGTG	2	8	16317	16324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011259	AAAG	2	8	16470	16477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011259	AAGG	2	8	16519	16526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011259	TTTG	2	8	17510	17517	0 %	75 %	25 %	0 %	203288829
74	NC_011259	TGAA	2	8	17572	17579	50 %	25 %	25 %	0 %	203288829
75	NC_011259	TTTG	3	12	18301	18312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011259	TGTT	2	8	18483	18490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011259	TAGG	2	8	18615	18622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011259	TGAG	2	8	18788	18795	25 %	25 %	50 %	0 %	203288830
79	NC_011259	TAAG	2	8	19022	19029	50 %	25 %	25 %	0 %	203288830
80	NC_011259	AAAG	2	8	19482	19489	75 %	0 %	25 %	0 %	203288830
81	NC_011259	ATAA	2	8	19678	19685	75 %	25 %	0 %	0 %	203288830
82	NC_011259	TTAT	2	8	19863	19870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011259	TGAG	2	8	20041	20048	25 %	25 %	50 %	0 %	203288831
84	NC_011259	TGAA	2	8	20431	20438	50 %	25 %	25 %	0 %	203288831
85	NC_011259	AGTA	2	8	20995	21002	50 %	25 %	25 %	0 %	203288831
86	NC_011259	AATT	2	8	21061	21068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011259	TTAG	2	8	21080	21087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011259	TCAT	3	12	21151	21162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011259	TAAA	2	8	21214	21221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011259	CTTT	2	8	21638	21645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011259	GAGG	2	8	21798	21805	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011259	TGAT	2	8	21833	21840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011259	AAAT	2	8	22131	22138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011259	GTAT	2	8	22229	22236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011259	AATA	2	8	22396	22403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011259	AAAT	2	8	22499	22506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011259	GTAA	2	8	22573	22580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011259	ATTT	2	8	22732	22739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011259	TAAA	2	8	22831	22838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.