MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23b

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011259	TCTT	2	8	257	264	0 %	75 %	0 %	25 %	203288820
2	NC_011259	TGCT	2	8	406	413	0 %	50 %	25 %	25 %	203288820
3	NC_011259	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	203288820
4	NC_011259	ATTG	2	8	1335	1342	25 %	50 %	25 %	0 %	203288820
5	NC_011259	TATT	2	8	1363	1370	25 %	75 %	0 %	0 %	203288820
6	NC_011259	ATTT	2	8	1508	1515	25 %	75 %	0 %	0 %	203288820
7	NC_011259	TCTT	2	8	1955	1962	0 %	75 %	0 %	25 %	203288821
8	NC_011259	TTTA	2	8	2562	2569	25 %	75 %	0 %	0 %	203288821
9	NC_011259	TGTT	2	8	2615	2622	0 %	75 %	25 %	0 %	203288821
10	NC_011259	GATA	2	8	3603	3610	50 %	25 %	25 %	0 %	203288822
11	NC_011259	AACA	2	8	3834	3841	75 %	0 %	0 %	25 %	203288822
12	NC_011259	TTGC	2	8	4025	4032	0 %	50 %	25 %	25 %	203288822
13	NC_011259	TAAA	2	8	4038	4045	75 %	25 %	0 %	0 %	203288822
14	NC_011259	ATAA	2	8	4514	4521	75 %	25 %	0 %	0 %	203288822
15	NC_011259	GAAG	2	8	4558	4565	50 %	0 %	50 %	0 %	203288822
16	NC_011259	ATTT	2	8	4759	4766	25 %	75 %	0 %	0 %	203288823
17	NC_011259	TTTA	2	8	4820	4827	25 %	75 %	0 %	0 %	203288823
18	NC_011259	TTGT	2	8	4902	4909	0 %	75 %	25 %	0 %	203288823
19	NC_011259	ATTA	2	8	5111	5118	50 %	50 %	0 %	0 %	203288823
20	NC_011259	ATTT	2	8	5497	5504	25 %	75 %	0 %	0 %	203288823
21	NC_011259	TTTG	2	8	6282	6289	0 %	75 %	25 %	0 %	203288824
22	NC_011259	AAAG	2	8	6462	6469	75 %	0 %	25 %	0 %	203288824
23	NC_011259	TAAT	2	8	6814	6821	50 %	50 %	0 %	0 %	203288824
24	NC_011259	TTTG	2	8	7233	7240	0 %	75 %	25 %	0 %	203288825
25	NC_011259	ATCA	2	8	7357	7364	50 %	25 %	0 %	25 %	203288825
26	NC_011259	ATTT	2	8	9043	9050	25 %	75 %	0 %	0 %	203288826
27	NC_011259	GATA	2	8	9092	9099	50 %	25 %	25 %	0 %	203288826
28	NC_011259	ATTA	2	8	9647	9654	50 %	50 %	0 %	0 %	203288826
29	NC_011259	AATT	2	8	10039	10046	50 %	50 %	0 %	0 %	203288826
30	NC_011259	AATT	2	8	12144	12151	50 %	50 %	0 %	0 %	203288827
31	NC_011259	TGAT	2	8	12444	12451	25 %	50 %	25 %	0 %	203288827
32	NC_011259	TAAT	2	8	12830	12837	50 %	50 %	0 %	0 %	203288827
33	NC_011259	AGGA	2	8	14599	14606	50 %	0 %	50 %	0 %	203288828
34	NC_011259	GAAA	2	8	14755	14762	75 %	0 %	25 %	0 %	203288828
35	NC_011259	GGAA	2	8	14879	14886	50 %	0 %	50 %	0 %	203288828
36	NC_011259	TAAA	2	8	14944	14951	75 %	25 %	0 %	0 %	203288828
37	NC_011259	ATAG	2	8	15015	15022	50 %	25 %	25 %	0 %	203288828
38	NC_011259	TTTG	2	8	17510	17517	0 %	75 %	25 %	0 %	203288829
39	NC_011259	TGAA	2	8	17572	17579	50 %	25 %	25 %	0 %	203288829
40	NC_011259	TGAG	2	8	18788	18795	25 %	25 %	50 %	0 %	203288830
41	NC_011259	TAAG	2	8	19022	19029	50 %	25 %	25 %	0 %	203288830
42	NC_011259	AAAG	2	8	19482	19489	75 %	0 %	25 %	0 %	203288830
43	NC_011259	ATAA	2	8	19678	19685	75 %	25 %	0 %	0 %	203288830
44	NC_011259	TGAG	2	8	20041	20048	25 %	25 %	50 %	0 %	203288831
45	NC_011259	TGAA	2	8	20431	20438	50 %	25 %	25 %	0 %	203288831
46	NC_011259	AGTA	2	8	20995	21002	50 %	25 %	25 %	0 %	203288831

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.