MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23b

Total Repeats: 401

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011259	CGG	2	6	83	88	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	203288820
2	NC_011259	ATC	2	6	146	151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288820
3	NC_011259	TCT	2	6	195	200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288820
4	NC_011259	TCT	3	9	228	236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288820
5	NC_011259	TTC	2	6	266	271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288820
6	NC_011259	TTG	2	6	299	304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288820
7	NC_011259	CTT	3	9	358	366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288820
8	NC_011259	GTC	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288820
9	NC_011259	TTA	2	6	520	525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288820
10	NC_011259	TCA	3	9	541	549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288820
11	NC_011259	GTT	2	6	683	688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288820
12	NC_011259	TAA	2	6	895	900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288820
13	NC_011259	GTT	2	6	949	954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288820
14	NC_011259	GTT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288820
15	NC_011259	TAA	2	6	982	987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288820
16	NC_011259	ATA	2	6	1151	1156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288820
17	NC_011259	TAG	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288820
18	NC_011259	TAA	2	6	1280	1285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288820
19	NC_011259	TTC	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288820
20	NC_011259	ATT	2	6	1386	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288820
21	NC_011259	ATT	2	6	1416	1421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288820
22	NC_011259	TAT	2	6	1456	1461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288820
23	NC_011259	TAT	3	9	1543	1551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288820
24	NC_011259	AAT	2	6	1713	1718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011259	TAA	2	6	1759	1764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011259	TTA	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011259	GAT	2	6	1963	1968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288821
28	NC_011259	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288821
29	NC_011259	TTA	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288821
30	NC_011259	TAT	2	6	2068	2073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288821
31	NC_011259	TAG	2	6	2079	2084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288821
32	NC_011259	GAA	2	6	2131	2136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288821
33	NC_011259	AAC	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288821
34	NC_011259	GCT	2	6	2185	2190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288821
35	NC_011259	TGA	2	6	2192	2197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288821
36	NC_011259	TAT	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288821
37	NC_011259	TCA	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288821
38	NC_011259	CTG	2	6	2360	2365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288821
39	NC_011259	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288821
40	NC_011259	GTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288821
41	NC_011259	ATT	2	6	2776	2781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011259	ATT	2	6	2797	2802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011259	AGT	2	6	2825	2830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011259	TGA	2	6	2872	2877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011259	TAA	2	6	2923	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011259	AAT	2	6	2973	2978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011259	TAT	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011259	AAT	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011259	TTG	2	6	3052	3057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011259	TAA	2	6	3177	3182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011259	AAC	2	6	3227	3232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011259	ATT	3	9	3244	3252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011259	ATT	2	6	3291	3296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011259	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011259	AAT	2	6	3336	3341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011259	ATA	2	6	3419	3424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011259	AAT	2	6	3530	3535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011259	TAA	2	6	3630	3635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
59	NC_011259	ATG	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288822
60	NC_011259	ATT	2	6	3786	3791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
61	NC_011259	TTA	2	6	3824	3829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
62	NC_011259	ATT	2	6	3856	3861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
63	NC_011259	ATA	2	6	3875	3880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
64	NC_011259	AAT	2	6	3970	3975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
65	NC_011259	TAA	2	6	4110	4115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
66	NC_011259	TTA	2	6	4208	4213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
67	NC_011259	GAT	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288822
68	NC_011259	ATA	2	6	4243	4248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
69	NC_011259	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
70	NC_011259	GAT	2	6	4333	4338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288822
71	NC_011259	ATT	2	6	4362	4367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
72	NC_011259	ATG	3	9	4460	4468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288822
73	NC_011259	ATA	2	6	4477	4482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
74	NC_011259	ATA	2	6	4645	4650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
75	NC_011259	AAT	2	6	4693	4698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
76	NC_011259	ATA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
77	NC_011259	TCT	2	6	4726	4731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288822
78	NC_011259	TTA	2	6	4743	4748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288823
79	NC_011259	AAT	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288823
80	NC_011259	TCT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288823
81	NC_011259	AGA	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288823
82	NC_011259	TGA	2	6	4973	4978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288823
83	NC_011259	AAG	2	6	5014	5019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288823
84	NC_011259	AAT	2	6	5128	5133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288823
85	NC_011259	CAT	2	6	5134	5139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288823
86	NC_011259	CTG	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288823
87	NC_011259	TTA	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288823
88	NC_011259	TTC	2	6	5336	5341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288823
89	NC_011259	AAT	4	12	5429	5440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288823
90	NC_011259	TAA	2	6	5477	5482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288823
91	NC_011259	TAT	2	6	5560	5565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288823
92	NC_011259	TAA	2	6	5578	5583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288823
93	NC_011259	TAT	2	6	5587	5592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288823
94	NC_011259	TTC	2	6	5624	5629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288823
95	NC_011259	TAG	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288823
96	NC_011259	ATC	2	6	5687	5692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288823
97	NC_011259	TTA	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288823
98	NC_011259	ATC	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011259	TAA	2	6	5908	5913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011259	ACT	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011259	GTT	2	6	6132	6137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011259	TTA	2	6	6412	6417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288824
103	NC_011259	AAT	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288824
104	NC_011259	AAT	2	6	6494	6499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288824
105	NC_011259	TTC	2	6	6593	6598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288824
106	NC_011259	AAT	2	6	6718	6723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288824
107	NC_011259	GAT	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288824
108	NC_011259	TCT	2	6	6938	6943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288825
109	NC_011259	TAT	2	6	7008	7013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288825
110	NC_011259	CAG	2	6	7113	7118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288825
111	NC_011259	TAT	2	6	7129	7134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288825
112	NC_011259	AAT	2	6	7165	7170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288825
113	NC_011259	ATA	2	6	7218	7223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288825
114	NC_011259	CAA	2	6	7497	7502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288825
115	NC_011259	ACC	2	6	7528	7533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288825
116	NC_011259	TTA	2	6	7551	7556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288825
117	NC_011259	TCC	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_011259	GTT	2	6	7652	7657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011259	TAA	2	6	7707	7712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011259	TGA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011259	AGT	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011259	TTA	2	6	7791	7796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011259	TAT	2	6	7859	7864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011259	ATA	2	6	7886	7891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011259	CAA	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011259	TAG	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011259	ACT	4	12	8012	8023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011259	TTA	2	6	8159	8164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011259	AAG	2	6	8221	8226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011259	TGT	2	6	8286	8291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011259	TAT	2	6	8311	8316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011259	GTA	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011259	TTA	2	6	8381	8386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011259	CAA	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011259	TAA	2	6	8569	8574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011259	TTA	2	6	8583	8588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011259	TTA	2	6	8633	8638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_011259	TAA	2	6	22716	22721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_011259	ATC	2	6	22824	22829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_011259	AAG	2	6	22908	22913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.