MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23b

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011259	AAT	2	6	1713	1718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011259	TAA	2	6	1759	1764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011259	TTA	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011259	ATT	2	6	2776	2781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011259	ATT	2	6	2797	2802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011259	AGT	2	6	2825	2830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011259	TGA	2	6	2872	2877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011259	TAA	2	6	2923	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011259	AAT	2	6	2973	2978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011259	TAT	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011259	AAT	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011259	TTG	2	6	3052	3057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011259	TAA	2	6	3177	3182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011259	AAC	2	6	3227	3232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011259	ATT	3	9	3244	3252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011259	ATT	2	6	3291	3296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011259	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011259	AAT	2	6	3336	3341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011259	ATA	2	6	3419	3424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011259	AAT	2	6	3530	3535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011259	ATC	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011259	TAA	2	6	5908	5913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011259	ACT	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011259	GTT	2	6	6132	6137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011259	TCC	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011259	GTT	2	6	7652	7657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011259	TAA	2	6	7707	7712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011259	TGA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011259	AGT	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011259	TTA	2	6	7791	7796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011259	TAT	2	6	7859	7864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011259	ATA	2	6	7886	7891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011259	CAA	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011259	TAG	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011259	ACT	4	12	8012	8023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011259	TTA	2	6	8159	8164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011259	AAG	2	6	8221	8226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011259	TGT	2	6	8286	8291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011259	TAT	2	6	8311	8316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011259	GTA	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011259	TTA	2	6	8381	8386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011259	CAA	2	6	8506	8511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011259	TAA	2	6	8569	8574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011259	TTA	2	6	8583	8588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011259	TTA	2	6	8633	8638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011259	ATT	3	9	8728	8736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011259	TAT	2	6	8898	8903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011259	ACT	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011259	TAT	2	6	8974	8979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011259	ATT	2	6	10354	10359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011259	TAA	2	6	10423	10428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011259	TGG	3	9	10792	10800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011259	TGA	2	6	10801	10806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011259	GGA	2	6	10818	10823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011259	AAT	2	6	10863	10868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011259	AGA	2	6	11039	11044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011259	TAA	2	6	11209	11214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011259	GGT	2	6	11245	11250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011259	AAG	2	6	11255	11260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011259	CTA	2	6	11280	11285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011259	ATG	2	6	11337	11342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011259	AAC	2	6	11349	11354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011259	GCA	3	9	11360	11368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011259	GCA	2	6	11468	11473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011259	AGG	2	6	11545	11550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011259	AAT	2	6	11570	11575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011259	TGA	2	6	11632	11637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011259	ATC	2	6	11654	11659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011259	AGG	2	6	11715	11720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011259	AAG	2	6	12997	13002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011259	GTT	2	6	13033	13038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011259	AAT	2	6	13127	13132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011259	ATA	2	6	13191	13196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011259	AAT	2	6	13223	13228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011259	TAA	2	6	13241	13246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011259	AGA	2	6	13471	13476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011259	GAA	2	6	13620	13625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011259	TGG	2	6	13670	13675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011259	TGC	2	6	13691	13696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011259	GAG	2	6	13809	13814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011259	AAG	2	6	13818	13823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011259	GAA	2	6	13872	13877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011259	GCA	2	6	13890	13895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011259	TGC	3	9	13994	14002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011259	TAA	2	6	14024	14029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011259	ATG	2	6	14035	14040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011259	TAT	2	6	14072	14077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011259	AGC	2	6	14078	14083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011259	GAT	2	6	14133	14138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011259	AGC	3	9	14174	14182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011259	TAA	2	6	14258	14263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011259	ATT	2	6	14349	14354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011259	TCT	2	6	14454	14459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011259	AGG	2	6	14497	14502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011259	AAT	2	6	15196	15201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011259	TTG	2	6	15313	15318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011259	ATA	2	6	15514	15519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011259	TAA	3	9	15594	15602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011259	GAA	2	6	15621	15626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011259	AAG	2	6	15644	15649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011259	AGA	2	6	15709	15714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011259	ATG	3	9	15736	15744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011259	AGA	2	6	15968	15973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011259	GAA	2	6	16038	16043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011259	ATG	2	6	16072	16077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011259	ATA	2	6	16080	16085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011259	TGC	2	6	16115	16120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011259	TGT	2	6	16133	16138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011259	TTG	2	6	16165	16170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011259	AAG	2	6	16189	16194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011259	TAA	2	6	16205	16210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011259	ATT	2	6	16245	16250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011259	AAG	2	6	16255	16260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011259	AAG	2	6	16277	16282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011259	GCT	2	6	16288	16293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011259	GCA	2	6	16408	16413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011259	TGT	2	6	16422	16427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011259	TGA	2	6	16437	16442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011259	AAT	2	6	16482	16487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011259	AGC	2	6	16488	16493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011259	ATT	2	6	16734	16739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011259	AAT	2	6	16810	16815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011259	ATT	2	6	16829	16834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011259	TAA	2	6	16878	16883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011259	AGG	2	6	16888	16893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011259	TAA	2	6	16904	16909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011259	TAG	2	6	16924	16929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011259	TAT	2	6	17965	17970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011259	AGA	2	6	17993	17998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011259	GAA	2	6	18195	18200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011259	TCT	2	6	18215	18220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011259	ATA	2	6	18222	18227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011259	ATT	2	6	18236	18241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011259	TTA	2	6	18284	18289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011259	TTA	2	6	18358	18363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011259	AAC	3	9	18392	18400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011259	AAT	2	6	18401	18406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011259	AAG	2	6	18608	18613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011259	ATA	2	6	18623	18628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011259	AAT	2	6	18638	18643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011259	TGT	2	6	19849	19854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011259	AGG	2	6	19915	19920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011259	ATA	2	6	21027	21032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011259	ATT	2	6	21039	21044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011259	ATA	2	6	21048	21053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011259	TAT	2	6	21132	21137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011259	TGT	2	6	21163	21168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011259	AGA	2	6	21201	21206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011259	AGG	2	6	21228	21233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_011259	ATT	2	6	21287	21292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011259	TGC	2	6	21328	21333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_011259	TAA	2	6	21851	21856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011259	GAA	2	6	21934	21939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011259	TTA	2	6	22118	22123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011259	TAA	2	6	22257	22262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011259	GAA	2	6	22384	22389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011259	TAG	2	6	22417	22422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_011259	ATC	2	6	22824	22829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_011259	AAG	2	6	22908	22913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.