MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23b

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011259	CGG	2	6	83	88	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	203288820
2	NC_011259	ATC	2	6	146	151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288820
3	NC_011259	TCT	2	6	195	200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288820
4	NC_011259	TCT	3	9	228	236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288820
5	NC_011259	TTC	2	6	266	271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288820
6	NC_011259	TTG	2	6	299	304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288820
7	NC_011259	CTT	3	9	358	366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288820
8	NC_011259	GTC	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288820
9	NC_011259	TTA	2	6	520	525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288820
10	NC_011259	TCA	3	9	541	549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288820
11	NC_011259	GTT	2	6	683	688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288820
12	NC_011259	TAA	2	6	895	900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288820
13	NC_011259	GTT	2	6	949	954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288820
14	NC_011259	GTT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288820
15	NC_011259	TAA	2	6	982	987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288820
16	NC_011259	ATA	2	6	1151	1156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288820
17	NC_011259	TAG	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288820
18	NC_011259	TAA	2	6	1280	1285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288820
19	NC_011259	TTC	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288820
20	NC_011259	ATT	2	6	1386	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288820
21	NC_011259	ATT	2	6	1416	1421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288820
22	NC_011259	TAT	2	6	1456	1461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288820
23	NC_011259	TAT	3	9	1543	1551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288820
24	NC_011259	GAT	2	6	1963	1968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288821
25	NC_011259	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288821
26	NC_011259	TTA	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288821
27	NC_011259	TAT	2	6	2068	2073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288821
28	NC_011259	TAG	2	6	2079	2084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288821
29	NC_011259	GAA	2	6	2131	2136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288821
30	NC_011259	AAC	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288821
31	NC_011259	GCT	2	6	2185	2190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288821
32	NC_011259	TGA	2	6	2192	2197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288821
33	NC_011259	TAT	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288821
34	NC_011259	TCA	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288821
35	NC_011259	CTG	2	6	2360	2365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288821
36	NC_011259	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288821
37	NC_011259	GTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288821
38	NC_011259	TAA	2	6	3630	3635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
39	NC_011259	ATG	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288822
40	NC_011259	ATT	2	6	3786	3791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
41	NC_011259	TTA	2	6	3824	3829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
42	NC_011259	ATT	2	6	3856	3861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
43	NC_011259	ATA	2	6	3875	3880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
44	NC_011259	AAT	2	6	3970	3975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
45	NC_011259	TAA	2	6	4110	4115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
46	NC_011259	TTA	2	6	4208	4213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
47	NC_011259	GAT	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288822
48	NC_011259	ATA	2	6	4243	4248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
49	NC_011259	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
50	NC_011259	GAT	2	6	4333	4338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288822
51	NC_011259	ATT	2	6	4362	4367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288822
52	NC_011259	ATG	3	9	4460	4468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288822
53	NC_011259	ATA	2	6	4477	4482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
54	NC_011259	ATA	2	6	4645	4650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
55	NC_011259	AAT	2	6	4693	4698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
56	NC_011259	ATA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288822
57	NC_011259	TCT	2	6	4726	4731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288822
58	NC_011259	TTA	2	6	4743	4748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288823
59	NC_011259	AAT	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288823
60	NC_011259	TCT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288823
61	NC_011259	AGA	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288823
62	NC_011259	TGA	2	6	4973	4978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288823
63	NC_011259	AAG	2	6	5014	5019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288823
64	NC_011259	AAT	2	6	5128	5133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288823
65	NC_011259	CAT	2	6	5134	5139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288823
66	NC_011259	CTG	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288823
67	NC_011259	TTA	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288823
68	NC_011259	TTC	2	6	5336	5341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288823
69	NC_011259	AAT	4	12	5429	5440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288823
70	NC_011259	TAA	2	6	5477	5482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288823
71	NC_011259	TAT	2	6	5560	5565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288823
72	NC_011259	TAA	2	6	5578	5583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288823
73	NC_011259	TAT	2	6	5587	5592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288823
74	NC_011259	TTC	2	6	5624	5629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288823
75	NC_011259	TAG	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288823
76	NC_011259	ATC	2	6	5687	5692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288823
77	NC_011259	TTA	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288823
78	NC_011259	TTA	2	6	6412	6417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288824
79	NC_011259	AAT	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288824
80	NC_011259	AAT	2	6	6494	6499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288824
81	NC_011259	TTC	2	6	6593	6598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288824
82	NC_011259	AAT	2	6	6718	6723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288824
83	NC_011259	GAT	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288824
84	NC_011259	TCT	2	6	6938	6943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288825
85	NC_011259	TAT	2	6	7008	7013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288825
86	NC_011259	CAG	2	6	7113	7118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288825
87	NC_011259	TAT	2	6	7129	7134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288825
88	NC_011259	AAT	2	6	7165	7170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288825
89	NC_011259	ATA	2	6	7218	7223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288825
90	NC_011259	CAA	2	6	7497	7502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288825
91	NC_011259	ACC	2	6	7528	7533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288825
92	NC_011259	TTA	2	6	7551	7556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288825
93	NC_011259	TAA	3	9	9031	9039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288826
94	NC_011259	GTA	2	6	9115	9120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288826
95	NC_011259	TTA	2	6	9165	9170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288826
96	NC_011259	AGT	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288826
97	NC_011259	GAA	2	6	9246	9251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288826
98	NC_011259	GTA	2	6	9252	9257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288826
99	NC_011259	ATA	2	6	9318	9323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288826
100	NC_011259	ATT	2	6	9428	9433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288826
101	NC_011259	TTG	2	6	9481	9486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288826
102	NC_011259	TGT	2	6	9491	9496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288826
103	NC_011259	AGA	2	6	9509	9514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288826
104	NC_011259	TCA	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288826
105	NC_011259	CTG	2	6	9655	9660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288826
106	NC_011259	TGG	2	6	9683	9688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288826
107	NC_011259	TGA	2	6	9689	9694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288826
108	NC_011259	TCT	2	6	9732	9737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288826
109	NC_011259	TAA	2	6	9746	9751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288826
110	NC_011259	TGC	2	6	9851	9856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288826
111	NC_011259	GCT	2	6	9870	9875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288826
112	NC_011259	CTG	2	6	9877	9882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288826
113	NC_011259	TGG	2	6	9890	9895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288826
114	NC_011259	GAA	2	6	9936	9941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288826
115	NC_011259	TAT	2	6	9965	9970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288826
116	NC_011259	TAA	2	6	10022	10027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288826
117	NC_011259	GTG	2	6	10060	10065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288826
118	NC_011259	GCT	2	6	10104	10109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288826
119	NC_011259	TAG	2	6	10166	10171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288826
120	NC_011259	TAA	2	6	10181	10186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288826
121	NC_011259	AAG	2	6	10192	10197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288826
122	NC_011259	ATT	2	6	10242	10247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288826
123	NC_011259	AGT	2	6	11764	11769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288827
124	NC_011259	AAT	2	6	11770	11775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288827
125	NC_011259	TGA	3	9	11781	11789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288827
126	NC_011259	TGA	3	9	11793	11801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288827
127	NC_011259	GGA	2	6	11816	11821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288827
128	NC_011259	AGG	2	6	11824	11829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288827
129	NC_011259	AGA	2	6	11856	11861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288827
130	NC_011259	TTG	2	6	11913	11918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288827
131	NC_011259	AGA	2	6	12022	12027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288827
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.