MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23b

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011259	CT	3	6	114	119	0 %	50 %	0 %	50 %	203288820
2	NC_011259	CT	3	6	285	290	0 %	50 %	0 %	50 %	203288820
3	NC_011259	AT	3	6	291	296	50 %	50 %	0 %	0 %	203288820
4	NC_011259	TA	3	6	1674	1679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011259	TA	3	6	1722	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011259	AT	3	6	2638	2643	50 %	50 %	0 %	0 %	203288821
7	NC_011259	TA	4	8	3438	3445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011259	AT	5	10	3974	3983	50 %	50 %	0 %	0 %	203288822
9	NC_011259	AT	3	6	4264	4269	50 %	50 %	0 %	0 %	203288822
10	NC_011259	AT	4	8	4371	4378	50 %	50 %	0 %	0 %	203288822
11	NC_011259	AT	3	6	4428	4433	50 %	50 %	0 %	0 %	203288822
12	NC_011259	AT	5	10	5897	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011259	AT	3	6	6202	6207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011259	TC	3	6	6707	6712	0 %	50 %	0 %	50 %	203288824
15	NC_011259	AT	3	6	7207	7212	50 %	50 %	0 %	0 %	203288825
16	NC_011259	TA	3	6	7626	7631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011259	GT	3	6	7868	7873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011259	TA	3	6	7921	7926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011259	AT	3	6	8093	8098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011259	TA	3	6	8153	8158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011259	AT	3	6	8229	8234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011259	AT	3	6	8492	8497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011259	AT	3	6	8596	8601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011259	AT	3	6	8719	8724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011259	AG	3	6	8781	8786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011259	AT	5	10	8958	8967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011259	GA	3	6	9310	9315	50 %	0 %	50 %	0 %	203288826
28	NC_011259	TA	3	6	10704	10709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011259	GA	4	8	10731	10738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011259	AG	3	6	10748	10753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011259	AG	3	6	10760	10765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011259	AG	3	6	11016	11021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011259	GA	3	6	11292	11297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011259	CT	3	6	11598	11603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011259	TA	3	6	11623	11628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011259	AG	3	6	12872	12877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011259	AG	3	6	13527	13532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011259	AT	3	6	13927	13932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011259	GA	3	6	14272	14277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011259	TA	3	6	14328	14333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011259	CT	3	6	14387	14392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011259	TA	3	6	14412	14417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011259	AG	3	6	14517	14522	50 %	0 %	50 %	0 %	203288828
44	NC_011259	TA	3	6	15169	15174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011259	AT	3	6	15343	15348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011259	AG	3	6	15665	15670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011259	AG	4	8	15675	15682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011259	GA	4	8	15684	15691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011259	AT	3	6	16331	16336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011259	GA	3	6	16675	16680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011259	TA	3	6	16804	16809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011259	GT	3	6	16848	16853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011259	AT	3	6	17593	17598	50 %	50 %	0 %	0 %	203288829
54	NC_011259	TA	3	6	18338	18343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011259	TA	3	6	18446	18451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011259	GA	3	6	18452	18457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011259	GA	4	8	18630	18637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011259	GA	3	6	18651	18656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011259	AG	3	6	18679	18684	50 %	0 %	50 %	0 %	203288830
60	NC_011259	AT	3	6	19343	19348	50 %	50 %	0 %	0 %	203288830
61	NC_011259	GA	3	6	19694	19699	50 %	0 %	50 %	0 %	203288830
62	NC_011259	CT	3	6	19820	19825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011259	AG	3	6	19935	19940	50 %	0 %	50 %	0 %	203288831
64	NC_011259	GA	3	6	20206	20211	50 %	0 %	50 %	0 %	203288831
65	NC_011259	CT	3	6	21108	21113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011259	TC	3	6	21782	21787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011259	TA	3	6	22026	22031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011259	AT	3	6	22193	22198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.