MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23b

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011259	T	8	8	350	357	0 %	100 %	0 %	0 %	203288820
2	NC_011259	T	6	6	378	383	0 %	100 %	0 %	0 %	203288820
3	NC_011259	T	6	6	421	426	0 %	100 %	0 %	0 %	203288820
4	NC_011259	T	6	6	787	792	0 %	100 %	0 %	0 %	203288820
5	NC_011259	T	7	7	960	966	0 %	100 %	0 %	0 %	203288820
6	NC_011259	T	8	8	973	980	0 %	100 %	0 %	0 %	203288820
7	NC_011259	T	7	7	1259	1265	0 %	100 %	0 %	0 %	203288820
8	NC_011259	T	6	6	1297	1302	0 %	100 %	0 %	0 %	203288820
9	NC_011259	T	6	6	1494	1499	0 %	100 %	0 %	0 %	203288820
10	NC_011259	T	7	7	1579	1585	0 %	100 %	0 %	0 %	203288820
11	NC_011259	T	6	6	1666	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011259	T	6	6	3148	3153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011259	T	8	8	3219	3226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011259	A	6	6	3379	3384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011259	A	6	6	3405	3410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011259	T	6	6	3570	3575	0 %	100 %	0 %	0 %	203288822
17	NC_011259	A	6	6	3617	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	203288822
18	NC_011259	T	6	6	3763	3768	0 %	100 %	0 %	0 %	203288822
19	NC_011259	A	8	8	3772	3779	100 %	0 %	0 %	0 %	203288822
20	NC_011259	T	7	7	3929	3935	0 %	100 %	0 %	0 %	203288822
21	NC_011259	A	9	9	4053	4061	100 %	0 %	0 %	0 %	203288822
22	NC_011259	T	8	8	4126	4133	0 %	100 %	0 %	0 %	203288822
23	NC_011259	A	8	8	4197	4204	100 %	0 %	0 %	0 %	203288822
24	NC_011259	A	8	8	4569	4576	100 %	0 %	0 %	0 %	203288822
25	NC_011259	T	7	7	4764	4770	0 %	100 %	0 %	0 %	203288823
26	NC_011259	A	7	7	4910	4916	100 %	0 %	0 %	0 %	203288823
27	NC_011259	T	9	9	5260	5268	0 %	100 %	0 %	0 %	203288823
28	NC_011259	T	8	8	5444	5451	0 %	100 %	0 %	0 %	203288823
29	NC_011259	T	6	6	5502	5507	0 %	100 %	0 %	0 %	203288823
30	NC_011259	T	7	7	5635	5641	0 %	100 %	0 %	0 %	203288823
31	NC_011259	T	6	6	5763	5768	0 %	100 %	0 %	0 %	203288823
32	NC_011259	A	6	6	5918	5923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011259	A	6	6	5945	5950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011259	T	6	6	5972	5977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011259	T	7	7	6050	6056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011259	A	6	6	6060	6065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011259	T	6	6	6264	6269	0 %	100 %	0 %	0 %	203288824
38	NC_011259	T	6	6	6306	6311	0 %	100 %	0 %	0 %	203288824
39	NC_011259	A	8	8	6317	6324	100 %	0 %	0 %	0 %	203288824
40	NC_011259	T	8	8	6357	6364	0 %	100 %	0 %	0 %	203288824
41	NC_011259	T	6	6	6834	6839	0 %	100 %	0 %	0 %	203288825
42	NC_011259	T	8	8	7013	7020	0 %	100 %	0 %	0 %	203288825
43	NC_011259	A	6	6	7072	7077	100 %	0 %	0 %	0 %	203288825
44	NC_011259	A	6	6	7276	7281	100 %	0 %	0 %	0 %	203288825
45	NC_011259	T	7	7	7564	7570	0 %	100 %	0 %	0 %	203288825
46	NC_011259	T	6	6	7777	7782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011259	A	7	7	7914	7920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011259	A	6	6	7926	7931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011259	A	6	6	8452	8457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011259	T	6	6	8935	8940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011259	T	8	8	8942	8949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011259	A	6	6	9012	9017	100 %	0 %	0 %	0 %	203288826
53	NC_011259	T	6	6	9472	9477	0 %	100 %	0 %	0 %	203288826
54	NC_011259	A	7	7	9606	9612	100 %	0 %	0 %	0 %	203288826
55	NC_011259	A	6	6	10284	10289	100 %	0 %	0 %	0 %	203288826
56	NC_011259	T	6	6	10488	10493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011259	A	6	6	10494	10499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011259	T	7	7	10564	10570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011259	T	6	6	10577	10582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011259	A	7	7	10690	10696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011259	G	7	7	11133	11139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011259	T	7	7	11603	11609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011259	T	6	6	11670	11675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011259	A	7	7	11699	11705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011259	A	6	6	11707	11712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011259	A	6	6	11741	11746	100 %	0 %	0 %	0 %	203288827
67	NC_011259	G	6	6	11834	11839	0 %	0 %	100 %	0 %	203288827
68	NC_011259	T	6	6	11866	11871	0 %	100 %	0 %	0 %	203288827
69	NC_011259	A	7	7	12010	12016	100 %	0 %	0 %	0 %	203288827
70	NC_011259	T	7	7	13177	13183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011259	T	6	6	13306	13311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011259	T	6	6	13321	13326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011259	A	7	7	13746	13752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011259	A	7	7	14145	14151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011259	A	6	6	14380	14385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011259	T	7	7	14392	14398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011259	A	7	7	14481	14487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011259	A	6	6	14489	14494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011259	A	6	6	14523	14528	100 %	0 %	0 %	0 %	203288828
80	NC_011259	A	7	7	15005	15011	100 %	0 %	0 %	0 %	203288828
81	NC_011259	A	7	7	15350	15356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011259	A	8	8	15427	15434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011259	T	6	6	15553	15558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011259	A	6	6	16227	16232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011259	T	7	7	16777	16783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011259	T	6	6	16842	16847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011259	A	7	7	16871	16877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011259	G	6	6	16979	16984	0 %	0 %	100 %	0 %	203288829
89	NC_011259	T	6	6	17979	17984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011259	T	7	7	18045	18051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011259	T	6	6	18080	18085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011259	T	7	7	18266	18272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011259	T	7	7	18502	18508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011259	A	6	6	18685	18690	100 %	0 %	0 %	0 %	203288830
95	NC_011259	T	7	7	19781	19787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011259	T	7	7	19825	19831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011259	A	7	7	19899	19905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011259	A	6	6	19907	19912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011259	A	6	6	19941	19946	100 %	0 %	0 %	0 %	203288831
100	NC_011259	A	6	6	20733	20738	100 %	0 %	0 %	0 %	203288831
101	NC_011259	A	6	6	20816	20821	100 %	0 %	0 %	0 %	203288831
102	NC_011259	A	6	6	20921	20926	100 %	0 %	0 %	0 %	203288831
103	NC_011259	T	6	6	21113	21118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011259	A	8	8	21219	21226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011259	A	6	6	21979	21984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011259	A	6	6	22042	22047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011259	A	8	8	22158	22165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011259	A	6	6	22207	22212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011259	T	6	6	22442	22447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011259	T	7	7	22489	22495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011259	T	8	8	22613	22620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011259	T	7	7	22782	22788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011259	T	7	7	22798	22804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011259	A	6	6	22805	22810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011259	T	7	7	22811	22817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011259	A	6	6	22854	22859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011259	T	6	6	22875	22880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011259	T	7	7	22894	22900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011259	T	7	7	22925	22931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011259	T	6	6	22947	22952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011259	T	6	6	22967	22972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011259	A	7	7	22990	22996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.