MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011257	TTAA	2	8	36	43	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011257	TTAC	2	8	590	597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011257	CAAA	2	8	691	698	75 %	0 %	0 %	25 %	203288798
4	NC_011257	ATAA	2	8	786	793	75 %	25 %	0 %	0 %	203288798
5	NC_011257	TAAT	2	8	961	968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011257	ATTT	2	8	1001	1008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011257	AAAT	2	8	1106	1113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011257	ATAG	2	8	1135	1142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011257	ATTT	2	8	1181	1188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011257	CATA	2	8	1498	1505	50 %	25 %	0 %	25 %	203288799
11	NC_011257	CATA	2	8	1590	1597	50 %	25 %	0 %	25 %	203288799
12	NC_011257	ATTA	2	8	1630	1637	50 %	50 %	0 %	0 %	203288799
13	NC_011257	TCAT	2	8	3340	3347	25 %	50 %	0 %	25 %	203288800
14	NC_011257	TAAA	2	8	3467	3474	75 %	25 %	0 %	0 %	203288800
15	NC_011257	TAAT	2	8	3515	3522	50 %	50 %	0 %	0 %	203288800
16	NC_011257	CCTT	2	8	3799	3806	0 %	50 %	0 %	50 %	203288800
17	NC_011257	ATTA	2	8	4097	4104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011257	TAAA	2	8	4585	4592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011257	TAAT	2	8	4596	4603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011257	TAAT	2	8	4897	4904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011257	ATCA	2	8	5041	5048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011257	ATAA	2	8	5409	5416	75 %	25 %	0 %	0 %	203288801
23	NC_011257	CCTC	2	8	5451	5458	0 %	25 %	0 %	75 %	203288801
24	NC_011257	GTAG	2	8	5483	5490	25 %	25 %	50 %	0 %	203288801
25	NC_011257	AAAT	2	8	5633	5640	75 %	25 %	0 %	0 %	203288801
26	NC_011257	AAAT	2	8	5653	5660	75 %	25 %	0 %	0 %	203288801
27	NC_011257	GTAA	2	8	5907	5914	50 %	25 %	25 %	0 %	203288801
28	NC_011257	CCAA	2	8	5943	5950	50 %	0 %	0 %	50 %	203288801
29	NC_011257	AATA	2	8	6002	6009	75 %	25 %	0 %	0 %	203288801
30	NC_011257	ATTC	2	8	6149	6156	25 %	50 %	0 %	25 %	203288801
31	NC_011257	TAAA	2	8	6767	6774	75 %	25 %	0 %	0 %	203288802
32	NC_011257	TGAA	2	8	7617	7624	50 %	25 %	25 %	0 %	203288804
33	NC_011257	TATT	2	8	7661	7668	25 %	75 %	0 %	0 %	203288804
34	NC_011257	CAAA	2	8	8171	8178	75 %	0 %	0 %	25 %	203288804
35	NC_011257	TAGA	2	8	8179	8186	50 %	25 %	25 %	0 %	203288804
36	NC_011257	AGCA	2	8	8276	8283	50 %	0 %	25 %	25 %	203288804
37	NC_011257	TAAA	2	8	8927	8934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011257	AATC	2	8	8966	8973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011257	TTAT	2	8	9131	9138	25 %	75 %	0 %	0 %	203288806
40	NC_011257	AATA	2	8	9319	9326	75 %	25 %	0 %	0 %	203288806
41	NC_011257	ATAA	2	8	9878	9885	75 %	25 %	0 %	0 %	203288806
42	NC_011257	TAAT	3	12	10239	10250	50 %	50 %	0 %	0 %	203288806
43	NC_011257	ATTA	2	8	10280	10287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011257	AATT	2	8	10288	10295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011257	GATA	2	8	10538	10545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011257	CATA	2	8	10779	10786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011257	ATTT	2	8	10961	10968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011257	AGGG	2	8	11048	11055	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011257	ATGC	2	8	11239	11246	25 %	25 %	25 %	25 %	203288807
50	NC_011257	CTAC	2	8	11611	11618	25 %	25 %	0 %	50 %	203288807
51	NC_011257	CATT	2	8	11711	11718	25 %	50 %	0 %	25 %	203288807
52	NC_011257	ATTT	2	8	12571	12578	25 %	75 %	0 %	0 %	203288807
53	NC_011257	AACA	2	8	12929	12936	75 %	0 %	0 %	25 %	203288808
54	NC_011257	TTAC	2	8	13129	13136	25 %	50 %	0 %	25 %	203288809
55	NC_011257	AAAT	2	8	13292	13299	75 %	25 %	0 %	0 %	203288809
56	NC_011257	TAAA	2	8	13543	13550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011257	GTAT	2	8	13850	13857	25 %	50 %	25 %	0 %	203288810
58	NC_011257	AAAT	2	8	14051	14058	75 %	25 %	0 %	0 %	203288810
59	NC_011257	CTTT	2	8	14253	14260	0 %	75 %	0 %	25 %	203288810
60	NC_011257	ATTT	2	8	14431	14438	25 %	75 %	0 %	0 %	203288810
61	NC_011257	AAAC	2	8	14524	14531	75 %	0 %	0 %	25 %	203288810
62	NC_011257	AGCA	2	8	14803	14810	50 %	0 %	25 %	25 %	203288810
63	NC_011257	TTAA	2	8	15873	15880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011257	AAGT	2	8	16812	16819	50 %	25 %	25 %	0 %	203288812
65	NC_011257	AGAA	2	8	17377	17384	75 %	0 %	25 %	0 %	203288813
66	NC_011257	GAAA	2	8	17761	17768	75 %	0 %	25 %	0 %	203288814
67	NC_011257	TAAC	2	8	17988	17995	50 %	25 %	0 %	25 %	203288814
68	NC_011257	ATAG	2	8	18014	18021	50 %	25 %	25 %	0 %	203288814
69	NC_011257	AGAT	2	8	18782	18789	50 %	25 %	25 %	0 %	203288815
70	NC_011257	TAAT	2	8	18847	18854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011257	TTTA	2	8	18881	18888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011257	TCTT	2	8	19151	19158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011257	TAAA	3	12	19165	19176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011257	TTTA	2	8	19416	19423	25 %	75 %	0 %	0 %	203288816
75	NC_011257	GTTT	2	8	19528	19535	0 %	75 %	25 %	0 %	203288816
76	NC_011257	TTTA	2	8	19623	19630	25 %	75 %	0 %	0 %	203288816
77	NC_011257	TTAT	2	8	19654	19661	25 %	75 %	0 %	0 %	203288816
78	NC_011257	TTAG	2	8	19987	19994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011257	TAAA	2	8	20348	20355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011257	TGAG	2	8	20563	20570	25 %	25 %	50 %	0 %	203288817
81	NC_011257	AGTG	2	8	21107	21114	25 %	25 %	50 %	0 %	203288817
82	NC_011257	AAGA	2	8	21252	21259	75 %	0 %	25 %	0 %	203288817
83	NC_011257	ATAA	2	8	21447	21454	75 %	25 %	0 %	0 %	203288817
84	NC_011257	TAAA	2	8	21813	21820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011257	TTTA	2	8	22133	22140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011257	TCAT	2	8	22165	22172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011257	AATG	2	8	22245	22252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011257	GAAG	2	8	22278	22285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011257	AGGA	2	8	22291	22298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011257	ATTT	2	8	22892	22899	25 %	75 %	0 %	0 %	203288818

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.