MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011257	CAC	2	6	112	117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_011257	TAA	2	6	160	165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011257	TAA	2	6	197	202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011257	TGA	2	6	337	342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011257	GAA	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011257	ATT	2	6	501	506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011257	ATT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011257	AAT	2	6	618	623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288798
9	NC_011257	TTA	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288798
10	NC_011257	AAT	3	9	674	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288798
11	NC_011257	CTC	2	6	735	740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288798
12	NC_011257	AAG	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011257	TCA	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011257	ATT	2	6	946	951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011257	TAA	2	6	982	987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011257	GAA	2	6	1049	1054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011257	TTG	2	6	1217	1222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011257	TAA	2	6	1229	1234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011257	TAA	2	6	1277	1282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011257	ACA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
21	NC_011257	TCA	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
22	NC_011257	ATT	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288799
23	NC_011257	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288799
24	NC_011257	CAG	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288799
25	NC_011257	AAC	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
26	NC_011257	CAA	2	6	1653	1658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
27	NC_011257	GTT	2	6	1725	1730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288799
28	NC_011257	AAT	2	6	1770	1775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288799
29	NC_011257	CAA	2	6	1797	1802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
30	NC_011257	TAT	2	6	1803	1808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288799
31	NC_011257	AAG	2	6	1936	1941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288799
32	NC_011257	TAA	2	6	1974	1979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288799
33	NC_011257	ATC	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
34	NC_011257	CAT	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
35	NC_011257	ATT	2	6	2056	2061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288799
36	NC_011257	ACA	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
37	NC_011257	AAT	2	6	2213	2218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288799
38	NC_011257	CAT	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
39	NC_011257	TCC	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288799
40	NC_011257	ACA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011257	AAT	2	6	2303	2308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011257	TAC	2	6	2317	2322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011257	TCA	2	6	2411	2416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011257	ATT	2	6	2478	2483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011257	ATA	2	6	2505	2510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011257	CAT	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
47	NC_011257	ATG	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
48	NC_011257	AGC	2	6	2808	2813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288800
49	NC_011257	ATC	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
50	NC_011257	GCA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288800
51	NC_011257	ACC	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288800
52	NC_011257	CAT	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
53	NC_011257	TTG	2	6	3065	3070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288800
54	NC_011257	CTT	2	6	3140	3145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
55	NC_011257	TAG	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
56	NC_011257	CAA	3	9	3245	3253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288800
57	NC_011257	TTC	2	6	3279	3284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
58	NC_011257	TTA	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288800
59	NC_011257	TCA	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
60	NC_011257	TCT	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
61	NC_011257	ATC	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
62	NC_011257	TAA	2	6	3695	3700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288800
63	NC_011257	GAT	2	6	3722	3727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
64	NC_011257	GAT	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
65	NC_011257	CAT	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
66	NC_011257	CTT	2	6	3971	3976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
67	NC_011257	ATT	2	6	3995	4000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288800
68	NC_011257	ATT	2	6	4024	4029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011257	TCG	2	6	4039	4044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011257	AGA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011257	TGA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011257	TAA	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011257	CAC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011257	ATT	2	6	4286	4291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011257	TAT	2	6	4364	4369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011257	TAA	2	6	4484	4489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011257	ATG	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011257	AAT	2	6	4664	4669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011257	ATT	2	6	4698	4703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011257	TTA	2	6	4709	4714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011257	AAC	2	6	4753	4758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011257	ACT	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011257	ACA	2	6	4793	4798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011257	CAA	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011257	TAT	2	6	4853	4858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011257	ATC	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011257	TAA	2	6	4936	4941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011257	TTA	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011257	AAT	2	6	4959	4964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011257	ATA	2	6	5004	5009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011257	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
92	NC_011257	AGC	2	6	5348	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288801
93	NC_011257	CAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
94	NC_011257	AAC	2	6	5426	5431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
95	NC_011257	TAA	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
96	NC_011257	TTA	2	6	5553	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
97	NC_011257	ATA	2	6	5647	5652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
98	NC_011257	TTA	2	6	5715	5720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
99	NC_011257	AGC	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288801
100	NC_011257	TCA	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288801
101	NC_011257	AAT	2	6	5891	5896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
102	NC_011257	ATA	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
103	NC_011257	ATA	2	6	6102	6107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
104	NC_011257	ACA	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
105	NC_011257	AAC	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
106	NC_011257	TAT	2	6	6332	6337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
107	NC_011257	TAT	2	6	6397	6402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
108	NC_011257	ATT	2	6	6428	6433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
109	NC_011257	TCC	2	6	6450	6455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_011257	TTA	2	6	6574	6579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288802
111	NC_011257	ATT	2	6	6609	6614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288802
112	NC_011257	TAA	2	6	6656	6661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
113	NC_011257	TAA	2	6	6677	6682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
114	NC_011257	CTA	2	6	6782	6787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288802
115	NC_011257	AAT	2	6	6854	6859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
116	NC_011257	TAT	2	6	6875	6880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288802
117	NC_011257	TAA	2	6	6990	6995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
118	NC_011257	TAA	2	6	7007	7012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
119	NC_011257	TAT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011257	TAT	2	6	7059	7064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288803
121	NC_011257	ATT	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288803
122	NC_011257	CTA	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288803
123	NC_011257	CAT	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288803
124	NC_011257	AAT	2	6	7342	7347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288803
125	NC_011257	ATT	2	6	7406	7411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288803
126	NC_011257	TAT	2	6	7584	7589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011257	AAT	2	6	7629	7634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288804
128	NC_011257	ATC	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288804
129	NC_011257	GAA	2	6	7767	7772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288804
130	NC_011257	ATA	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288804
131	NC_011257	CAA	2	6	7981	7986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288804
132	NC_011257	TTA	2	6	7989	7994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288804
133	NC_011257	TAC	2	6	8206	8211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288804
134	NC_011257	GAA	2	6	8298	8303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288804
135	NC_011257	ATT	2	6	8323	8328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288805
136	NC_011257	CAA	2	6	8371	8376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288805
137	NC_011257	TAA	2	6	8422	8427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288805
138	NC_011257	AAT	2	6	8570	8575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288805
139	NC_011257	CTT	2	6	8585	8590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288805
140	NC_011257	TAT	2	6	8629	8634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288805
141	NC_011257	TTA	2	6	8691	8696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288805
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145	NC_011257	TCA	2	6	8913	8918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_011257	ATT	2	6	10498	10503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_011257	TAA	2	6	16315	16320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288812
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263	NC_011257	GAA	2	6	16887	16892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_011257	TAA	2	6	17054	17059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288813
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.