MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011257	AT	3	6	96	101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011257	TA	4	8	442	449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011257	AT	3	6	473	478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011257	AT	3	6	711	716	50 %	50 %	0 %	0 %	203288798
5	NC_011257	AC	3	6	873	878	50 %	0 %	0 %	50 %	203288798
6	NC_011257	TA	3	6	2358	2363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011257	TA	3	6	2380	2385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011257	AT	3	6	2387	2392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011257	TA	3	6	2417	2422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011257	TC	3	6	2614	2619	0 %	50 %	0 %	50 %	203288800
11	NC_011257	AT	4	8	3876	3883	50 %	50 %	0 %	0 %	203288800
12	NC_011257	AC	3	6	4070	4075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011257	AC	3	6	4179	4184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011257	AC	3	6	4557	4562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011257	AC	3	6	5182	5187	50 %	0 %	0 %	50 %	203288801
16	NC_011257	AT	3	6	5339	5344	50 %	50 %	0 %	0 %	203288801
17	NC_011257	GA	3	6	6307	6312	50 %	0 %	50 %	0 %	203288801
18	NC_011257	TA	3	6	6314	6319	50 %	50 %	0 %	0 %	203288801
19	NC_011257	AT	3	6	6336	6341	50 %	50 %	0 %	0 %	203288801
20	NC_011257	TA	3	6	6550	6555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011257	AT	3	6	6898	6903	50 %	50 %	0 %	0 %	203288802
22	NC_011257	TA	3	6	7042	7047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011257	CT	3	6	7476	7481	0 %	50 %	0 %	50 %	203288803
24	NC_011257	AT	3	6	7643	7648	50 %	50 %	0 %	0 %	203288804
25	NC_011257	TA	3	6	7674	7679	50 %	50 %	0 %	0 %	203288804
26	NC_011257	AT	3	6	7793	7798	50 %	50 %	0 %	0 %	203288804
27	NC_011257	TA	5	10	7817	7826	50 %	50 %	0 %	0 %	203288804
28	NC_011257	AT	3	6	8613	8618	50 %	50 %	0 %	0 %	203288805
29	NC_011257	CT	3	6	8771	8776	0 %	50 %	0 %	50 %	203288805
30	NC_011257	CA	3	6	8996	9001	50 %	0 %	0 %	50 %	203288806
31	NC_011257	AT	3	6	9009	9014	50 %	50 %	0 %	0 %	203288806
32	NC_011257	TA	3	6	9016	9021	50 %	50 %	0 %	0 %	203288806
33	NC_011257	AT	3	6	9028	9033	50 %	50 %	0 %	0 %	203288806
34	NC_011257	TA	3	6	9630	9635	50 %	50 %	0 %	0 %	203288806
35	NC_011257	CA	3	6	9717	9722	50 %	0 %	0 %	50 %	203288806
36	NC_011257	TA	3	6	9776	9781	50 %	50 %	0 %	0 %	203288806
37	NC_011257	AT	3	6	9844	9849	50 %	50 %	0 %	0 %	203288806
38	NC_011257	AT	4	8	10218	10225	50 %	50 %	0 %	0 %	203288806
39	NC_011257	TA	3	6	10698	10703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011257	AT	3	6	10719	10724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011257	AT	3	6	10829	10834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011257	AT	3	6	11906	11911	50 %	50 %	0 %	0 %	203288807
43	NC_011257	CT	3	6	12155	12160	0 %	50 %	0 %	50 %	203288807
44	NC_011257	AT	3	6	12169	12174	50 %	50 %	0 %	0 %	203288807
45	NC_011257	CA	3	6	12434	12439	50 %	0 %	0 %	50 %	203288807
46	NC_011257	GA	3	6	12721	12726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011257	AT	3	6	13503	13508	50 %	50 %	0 %	0 %	203288809
48	NC_011257	AT	3	6	14076	14081	50 %	50 %	0 %	0 %	203288810
49	NC_011257	TA	3	6	14704	14709	50 %	50 %	0 %	0 %	203288810
50	NC_011257	AT	3	6	14866	14871	50 %	50 %	0 %	0 %	203288810
51	NC_011257	AT	3	6	14996	15001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011257	TC	3	6	15039	15044	0 %	50 %	0 %	50 %	203288811
53	NC_011257	AC	4	8	15712	15719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011257	TA	3	6	16784	16789	50 %	50 %	0 %	0 %	203288812
55	NC_011257	AT	3	6	16879	16884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011257	AT	3	6	16895	16900	50 %	50 %	0 %	0 %	203288813
57	NC_011257	AT	3	6	17244	17249	50 %	50 %	0 %	0 %	203288813
58	NC_011257	TA	3	6	17250	17255	50 %	50 %	0 %	0 %	203288813
59	NC_011257	AT	4	8	17637	17644	50 %	50 %	0 %	0 %	203288814
60	NC_011257	AT	3	6	17751	17756	50 %	50 %	0 %	0 %	203288814
61	NC_011257	TA	3	6	17792	17797	50 %	50 %	0 %	0 %	203288814
62	NC_011257	AG	3	6	18081	18086	50 %	0 %	50 %	0 %	203288814
63	NC_011257	TA	4	8	18515	18522	50 %	50 %	0 %	0 %	203288815
64	NC_011257	AT	3	6	18524	18529	50 %	50 %	0 %	0 %	203288815
65	NC_011257	AG	3	6	18686	18691	50 %	0 %	50 %	0 %	203288815
66	NC_011257	AT	3	6	18869	18874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011257	GT	3	6	19252	19257	0 %	50 %	50 %	0 %	203288816
68	NC_011257	AT	3	6	19267	19272	50 %	50 %	0 %	0 %	203288816
69	NC_011257	TA	3	6	19373	19378	50 %	50 %	0 %	0 %	203288816
70	NC_011257	GT	3	6	19561	19566	0 %	50 %	50 %	0 %	203288816
71	NC_011257	AT	3	6	20040	20045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011257	GA	3	6	21463	21468	50 %	0 %	50 %	0 %	203288817
73	NC_011257	AT	3	6	22988	22993	50 %	50 %	0 %	0 %	203288818
74	NC_011257	GT	3	6	23249	23254	0 %	50 %	50 %	0 %	203288818

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.