MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	AAATAG	2	12	37	48	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011256	ATCAAA	2	12	2896	2907	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011256	ATTCTA	2	12	2933	2944	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011256	AAAAAT	2	12	22508	22519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011256	AAATAT	2	12	26399	26410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011256	CCAGCA	2	12	26663	26674	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011256	AATTTT	2	12	27128	27139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011256	TGGTTT	2	12	30721	30732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011256	ATACAA	2	12	31598	31609	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011256	ATACAA	2	12	31616	31627	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011256	ATACAA	2	12	31634	31645	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011256	ATACAA	2	12	31652	31663	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011256	ATACAA	2	12	31670	31681	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011256	ACAAAA	2	12	31911	31922	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011256	ATTTAA	2	12	34259	34270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011256	ATGGAT	2	12	40061	40072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011256	TATTTA	2	12	40552	40563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011256	TATTTT	2	12	40953	40964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011256	TTTTGT	2	12	42148	42159	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011256	GATGCT	2	12	44954	44965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011256	TATAAA	2	12	48332	48343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011256	TATAAA	2	12	49714	49725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011256	TTACTG	2	12	50017	50028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011256	GTAATG	2	12	51681	51692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011256	ATTTTG	2	12	52356	52367	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011256	GGTAGA	2	12	52971	52982	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011256	TTAATG	2	12	53030	53041	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011256	TAATGC	2	12	59247	59258	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011256	GGTGAT	2	12	61198	61209	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011256	TTTTAA	2	12	65874	65885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011256	CTATTT	2	12	66372	66383	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.