MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	TTAATT	2	12	432	443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288752
2	NC_011256	TCTGCC	2	12	3587	3598	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	203288754
3	NC_011256	TCAAAC	2	12	4185	4196	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	203288754
4	NC_011256	CTTTAC	2	12	5218	5229	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	203288754
5	NC_011256	CATACG	2	12	5881	5892	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	203288754
6	NC_011256	CAGAAG	2	12	5904	5915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	203288754
7	NC_011256	TCCTTA	2	12	7932	7943	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	203288756
8	NC_011256	CCTCAT	2	12	10901	10912	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	203288759
9	NC_011256	ATTTAC	2	12	12321	12332	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288761
10	NC_011256	CCATAA	2	12	15179	15190	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	203288765
11	NC_011256	CTCATA	2	12	17630	17641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288767
12	NC_011256	AGAATC	2	12	19115	19126	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203288767
13	NC_011256	AGAATC	2	12	19145	19156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203288767
14	NC_011256	AGAATC	2	12	19160	19171	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203288767
15	NC_011256	AGAATC	2	12	19175	19186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203288767
16	NC_011256	CAAGCA	2	12	24579	24590	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	203288774
17	NC_011256	TAATTT	2	12	24825	24836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288775
18	NC_011256	TTCTCT	2	12	35235	35246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288780
19	NC_011256	AGAGAA	2	12	37125	37136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288781
20	NC_011256	TAATAT	2	12	38374	38385	50 %	50 %	0 %	0 %	203288783
21	NC_011256	CTAGTG	2	12	43829	43840	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	203288787
22	NC_011256	TAATGG	2	12	43989	44000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288787
23	NC_011256	AGAATG	2	12	58292	58303	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	203288793
24	NC_011256	ATGCAA	2	12	59025	59036	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203288793
25	NC_011256	TGGTGC	2	12	60185	60196	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	203288794
26	NC_011256	ACAAAA	2	12	63769	63780	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	203288796
27	NC_011256	CTAAAG	2	12	64239	64250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203288796

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.