MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	ATTGT	2	10	2162	2171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011256	CTTCT	2	10	10270	10279	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011256	ATATT	2	10	26308	26317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011256	ACGTT	2	10	30662	30671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011256	TTTAA	2	10	30868	30877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011256	CTTTA	2	10	31353	31362	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011256	TTAAC	2	10	31402	31411	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011256	TAAAA	2	10	31473	31482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011256	ATTTT	2	10	39574	39583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011256	ATTTT	2	10	39678	39687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011256	TAAAT	2	10	44460	44469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011256	ATTAA	2	10	46254	46263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011256	ATTTT	2	10	46787	46796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011256	AAAGT	2	10	48020	48029	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011256	TTTTA	2	10	48068	48077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011256	TTTAT	2	10	48166	48175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011256	ATTTT	2	10	48464	48473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011256	AAAAG	2	10	48487	48496	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011256	AGATA	2	10	49179	49188	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011256	AGGTG	2	10	50261	50270	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011256	TATGT	2	10	50978	50987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011256	AGAGA	2	10	51145	51154	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011256	AGGAG	2	10	51160	51169	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011256	AGATA	2	10	51457	51466	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011256	AAATT	2	10	52162	52171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011256	GATAA	2	10	53627	53636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011256	ATAAG	2	10	53910	53919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011256	AAAAT	2	10	54387	54396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011256	AGTTA	2	10	55594	55603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011256	TTTTA	2	10	55612	55621	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011256	TGTTA	2	10	55705	55714	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011256	ATATT	2	10	55740	55749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011256	ATTTT	2	10	56916	56925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011256	TTTTA	2	10	59388	59397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011256	ATAAA	2	10	60644	60653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011256	GGAAG	2	10	61164	61173	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011256	AAGTA	2	10	62221	62230	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011256	ATGGT	2	10	62236	62245	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011256	ATTGT	2	10	65048	65057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011256	TATAT	2	10	65782	65791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.