MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	AATAA	2	10	3555	3564	80 %	20 %	0 %	0 %	203288754
2	NC_011256	AAGTA	2	10	4231	4240	60 %	20 %	20 %	0 %	203288754
3	NC_011256	TTTGA	2	10	5185	5194	20 %	60 %	20 %	0 %	203288754
4	NC_011256	TTCAT	2	10	6479	6488	20 %	60 %	0 %	20 %	203288754
5	NC_011256	CAATA	2	10	7233	7242	60 %	20 %	0 %	20 %	203288755
6	NC_011256	CTTGA	2	10	7720	7729	20 %	40 %	20 %	20 %	203288756
7	NC_011256	GTTTT	2	10	14414	14423	0 %	80 %	20 %	0 %	203288763
8	NC_011256	CTTGA	2	10	17971	17980	20 %	40 %	20 %	20 %	203288767
9	NC_011256	TGAGT	2	10	18789	18798	20 %	40 %	40 %	0 %	203288767
10	NC_011256	AAGAA	2	10	19674	19683	80 %	0 %	20 %	0 %	203288768
11	NC_011256	ATCAA	2	10	20531	20540	60 %	20 %	0 %	20 %	203288770
12	NC_011256	ACAAT	2	10	21520	21529	60 %	20 %	0 %	20 %	203288772
13	NC_011256	AAAAT	2	10	21734	21743	80 %	20 %	0 %	0 %	203288772
14	NC_011256	ATAAA	2	10	21785	21794	80 %	20 %	0 %	0 %	203288772
15	NC_011256	AAATG	2	10	22875	22884	60 %	20 %	20 %	0 %	203288773
16	NC_011256	GAAAA	2	10	23526	23535	80 %	0 %	20 %	0 %	203288773
17	NC_011256	ATTAT	2	10	26213	26222	40 %	60 %	0 %	0 %	203288776
18	NC_011256	TCAAA	2	10	32601	32610	60 %	20 %	0 %	20 %	203288779
19	NC_011256	TAAAA	2	10	32682	32691	80 %	20 %	0 %	0 %	203288779
20	NC_011256	TAATT	2	10	35367	35376	40 %	60 %	0 %	0 %	203288780
21	NC_011256	AAAAT	2	10	36604	36613	80 %	20 %	0 %	0 %	203288781
22	NC_011256	TTATT	2	10	38302	38311	20 %	80 %	0 %	0 %	203288783
23	NC_011256	ATTAT	2	10	38526	38535	40 %	60 %	0 %	0 %	203288783
24	NC_011256	GAAGG	2	10	43483	43492	40 %	0 %	60 %	0 %	203288787
25	NC_011256	AGATA	2	10	44355	44364	60 %	20 %	20 %	0 %	203288787
26	NC_011256	GATAA	2	10	47295	47304	60 %	20 %	20 %	0 %	203288789
27	NC_011256	AGGGA	2	10	58228	58237	40 %	0 %	60 %	0 %	203288793
28	NC_011256	GGAAG	2	10	58369	58378	40 %	0 %	60 %	0 %	203288793
29	NC_011256	GATAA	2	10	58643	58652	60 %	20 %	20 %	0 %	203288793
30	NC_011256	AGGTG	2	10	60212	60221	20 %	20 %	60 %	0 %	203288794
31	NC_011256	GCAAT	2	10	63918	63927	40 %	20 %	20 %	20 %	203288796
32	NC_011256	ACAAA	2	10	64196	64205	80 %	0 %	0 %	20 %	203288796
33	NC_011256	GAAAT	2	10	64403	64412	60 %	20 %	20 %	0 %	203288796

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.