MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	TGTA	2	8	245	252	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011256	AATT	2	8	292	299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011256	TTTC	2	8	642	649	0 %	75 %	0 %	25 %	203288752
4	NC_011256	ATTC	2	8	886	893	25 %	50 %	0 %	25 %	203288752
5	NC_011256	AAAT	2	8	902	909	75 %	25 %	0 %	0 %	203288752
6	NC_011256	TTTC	2	8	937	944	0 %	75 %	0 %	25 %	203288752
7	NC_011256	CTTA	2	8	1550	1557	25 %	50 %	0 %	25 %	203288752
8	NC_011256	ACTT	2	8	2289	2296	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
9	NC_011256	AATT	2	8	2316	2323	50 %	50 %	0 %	0 %	203288753
10	NC_011256	ATCT	2	8	2464	2471	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
11	NC_011256	ATCT	2	8	2497	2504	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
12	NC_011256	TATC	2	8	2517	2524	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
13	NC_011256	ATCT	2	8	2551	2558	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
14	NC_011256	TATC	2	8	2571	2578	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
15	NC_011256	ATCT	2	8	2605	2612	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
16	NC_011256	TATC	2	8	2625	2632	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
17	NC_011256	ATCT	2	8	2659	2666	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
18	NC_011256	AATC	2	8	2676	2683	50 %	25 %	0 %	25 %	203288753
19	NC_011256	TTAT	2	8	2843	2850	25 %	75 %	0 %	0 %	203288753
20	NC_011256	AATT	2	8	2863	2870	50 %	50 %	0 %	0 %	203288753
21	NC_011256	TTCA	2	8	4660	4667	25 %	50 %	0 %	25 %	203288754
22	NC_011256	TCAA	2	8	6344	6351	50 %	25 %	0 %	25 %	203288754
23	NC_011256	GATC	2	8	6852	6859	25 %	25 %	25 %	25 %	203288755
24	NC_011256	TGTT	2	8	7138	7145	0 %	75 %	25 %	0 %	203288755
25	NC_011256	TGAT	2	8	7404	7411	25 %	50 %	25 %	0 %	203288755
26	NC_011256	TACC	2	8	7854	7861	25 %	25 %	0 %	50 %	203288756
27	NC_011256	TGTT	2	8	7979	7986	0 %	75 %	25 %	0 %	203288756
28	NC_011256	CATA	2	8	8143	8150	50 %	25 %	0 %	25 %	203288756
29	NC_011256	TGAT	2	8	8245	8252	25 %	50 %	25 %	0 %	203288756
30	NC_011256	CGAA	2	8	8689	8696	50 %	0 %	25 %	25 %	203288757
31	NC_011256	CAAA	2	8	8824	8831	75 %	0 %	0 %	25 %	203288757
32	NC_011256	TCTT	2	8	8844	8851	0 %	75 %	0 %	25 %	203288757
33	NC_011256	TCTT	2	8	8915	8922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011256	ACTT	2	8	9227	9234	25 %	50 %	0 %	25 %	203288758
35	NC_011256	AATC	2	8	9280	9287	50 %	25 %	0 %	25 %	203288758
36	NC_011256	ATCA	2	8	9290	9297	50 %	25 %	0 %	25 %	203288758
37	NC_011256	ATAA	2	8	9381	9388	75 %	25 %	0 %	0 %	203288758
38	NC_011256	TAAC	2	8	9630	9637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011256	CAAA	2	8	10101	10108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011256	TAAC	2	8	10374	10381	50 %	25 %	0 %	25 %	203288759
41	NC_011256	ATGA	2	8	10449	10456	50 %	25 %	25 %	0 %	203288759
42	NC_011256	AACA	2	8	10509	10516	75 %	0 %	0 %	25 %	203288759
43	NC_011256	ATGG	2	8	10831	10838	25 %	25 %	50 %	0 %	203288759
44	NC_011256	ATCA	2	8	10923	10930	50 %	25 %	0 %	25 %	203288759
45	NC_011256	TTTA	2	8	12384	12391	25 %	75 %	0 %	0 %	203288762
46	NC_011256	TCCC	2	8	12630	12637	0 %	25 %	0 %	75 %	203288762
47	NC_011256	ATTG	2	8	14402	14409	25 %	50 %	25 %	0 %	203288763
48	NC_011256	ATTC	2	8	14742	14749	25 %	50 %	0 %	25 %	203288764
49	NC_011256	ATTT	2	8	15381	15388	25 %	75 %	0 %	0 %	203288765
50	NC_011256	TTGA	2	8	15979	15986	25 %	50 %	25 %	0 %	203288766
51	NC_011256	CAAA	2	8	16158	16165	75 %	0 %	0 %	25 %	203288766
52	NC_011256	TCAA	2	8	16189	16196	50 %	25 %	0 %	25 %	203288766
53	NC_011256	ATTG	2	8	16335	16342	25 %	50 %	25 %	0 %	203288766
54	NC_011256	CAAA	2	8	16385	16392	75 %	0 %	0 %	25 %	203288766
55	NC_011256	AATC	2	8	16906	16913	50 %	25 %	0 %	25 %	203288767
56	NC_011256	TTAG	2	8	17799	17806	25 %	50 %	25 %	0 %	203288767
57	NC_011256	AAAT	2	8	17842	17849	75 %	25 %	0 %	0 %	203288767
58	NC_011256	TCTT	2	8	19295	19302	0 %	75 %	0 %	25 %	203288767
59	NC_011256	TGTA	2	8	19476	19483	25 %	50 %	25 %	0 %	203288768
60	NC_011256	CACT	2	8	20124	20131	25 %	25 %	0 %	50 %	203288769
61	NC_011256	ACAA	2	8	20828	20835	75 %	0 %	0 %	25 %	203288770
62	NC_011256	TCTT	2	8	20948	20955	0 %	75 %	0 %	25 %	203288771
63	NC_011256	TCTT	2	8	21111	21118	0 %	75 %	0 %	25 %	203288771
64	NC_011256	ACAA	2	8	21259	21266	75 %	0 %	0 %	25 %	203288771
65	NC_011256	AATA	2	8	21367	21374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011256	AGCA	2	8	21609	21616	50 %	0 %	25 %	25 %	203288772
67	NC_011256	AAAT	2	8	21710	21717	75 %	25 %	0 %	0 %	203288772
68	NC_011256	AAAT	2	8	22046	22053	75 %	25 %	0 %	0 %	203288772
69	NC_011256	AATA	2	8	22077	22084	75 %	25 %	0 %	0 %	203288772
70	NC_011256	TAAT	2	8	22265	22272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011256	TCAA	2	8	22378	22385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011256	AAAT	2	8	22580	22587	75 %	25 %	0 %	0 %	203288773
73	NC_011256	AATA	2	8	22725	22732	75 %	25 %	0 %	0 %	203288773
74	NC_011256	CAAT	2	8	22753	22760	50 %	25 %	0 %	25 %	203288773
75	NC_011256	TTAC	2	8	23005	23012	25 %	50 %	0 %	25 %	203288773
76	NC_011256	ATAA	2	8	23194	23201	75 %	25 %	0 %	0 %	203288773
77	NC_011256	AAGA	2	8	23804	23811	75 %	0 %	25 %	0 %	203288773
78	NC_011256	CGCC	2	8	23977	23984	0 %	0 %	25 %	75 %	203288773
79	NC_011256	GTAT	2	8	24281	24288	25 %	50 %	25 %	0 %	203288774
80	NC_011256	AGAA	2	8	24458	24465	75 %	0 %	25 %	0 %	203288774
81	NC_011256	TTAT	2	8	24739	24746	25 %	75 %	0 %	0 %	203288775
82	NC_011256	ATCC	2	8	25341	25348	25 %	25 %	0 %	50 %	203288775
83	NC_011256	TTTA	2	8	25768	25775	25 %	75 %	0 %	0 %	203288776
84	NC_011256	TAAT	2	8	25986	25993	50 %	50 %	0 %	0 %	203288776
85	NC_011256	ATGT	2	8	26007	26014	25 %	50 %	25 %	0 %	203288776
86	NC_011256	GTAA	2	8	26044	26051	50 %	25 %	25 %	0 %	203288776
87	NC_011256	ATTT	2	8	26203	26210	25 %	75 %	0 %	0 %	203288776
88	NC_011256	TGTT	2	8	26239	26246	0 %	75 %	25 %	0 %	203288776
89	NC_011256	AAGC	2	8	26466	26473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011256	ATCA	2	8	26768	26775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011256	AATT	2	8	27080	27087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011256	CTTA	2	8	27514	27521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011256	ATTC	2	8	28703	28710	25 %	50 %	0 %	25 %	203288777
94	NC_011256	ATTA	2	8	28884	28891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011256	TTAT	2	8	28937	28944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011256	TTTA	2	8	29178	29185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011256	TAGA	2	8	29465	29472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011256	ACTT	2	8	29493	29500	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
99	NC_011256	TATC	2	8	29620	29627	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
100	NC_011256	ATCT	2	8	29654	29661	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
101	NC_011256	TATC	2	8	29707	29714	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
102	NC_011256	ATCT	2	8	29774	29781	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
103	NC_011256	ATCT	2	8	29807	29814	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
104	NC_011256	AATA	2	8	30231	30238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011256	TAAA	2	8	30243	30250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011256	TACA	2	8	31255	31262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011256	AATT	3	12	31493	31504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011256	ACAA	2	8	31690	31697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011256	AATT	2	8	31925	31932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011256	ATTT	2	8	32125	32132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011256	AAAG	2	8	32224	32231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011256	AAAT	2	8	32284	32291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011256	ATAA	2	8	32304	32311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011256	CAAT	2	8	32844	32851	50 %	25 %	0 %	25 %	203288779
115	NC_011256	ATAA	2	8	32945	32952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011256	ATAA	2	8	32971	32978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011256	AGAA	2	8	33076	33083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011256	AAAG	2	8	33208	33215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011256	TGAA	2	8	33353	33360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011256	AAAT	2	8	33690	33697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011256	ATAA	2	8	33718	33725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011256	TAAT	2	8	35062	35069	50 %	50 %	0 %	0 %	203288780
123	NC_011256	ACCA	2	8	35785	35792	50 %	0 %	0 %	50 %	203288780
124	NC_011256	AAAT	2	8	35901	35908	75 %	25 %	0 %	0 %	203288780
125	NC_011256	TAAT	2	8	36016	36023	50 %	50 %	0 %	0 %	203288780
126	NC_011256	ATTC	2	8	36133	36140	25 %	50 %	0 %	25 %	203288780
127	NC_011256	GTTT	2	8	36192	36199	0 %	75 %	25 %	0 %	203288780
128	NC_011256	ATTC	2	8	36269	36276	25 %	50 %	0 %	25 %	203288780
129	NC_011256	TTAT	2	8	36683	36690	25 %	75 %	0 %	0 %	203288781
130	NC_011256	AACA	2	8	36871	36878	75 %	0 %	0 %	25 %	203288781
131	NC_011256	GATT	2	8	37493	37500	25 %	50 %	25 %	0 %	203288781
132	NC_011256	GAAA	2	8	38119	38126	75 %	0 %	25 %	0 %	203288782
133	NC_011256	TTTA	2	8	38470	38477	25 %	75 %	0 %	0 %	203288783
134	NC_011256	TAGC	2	8	38808	38815	25 %	25 %	25 %	25 %	203288783
135	NC_011256	GATG	2	8	39111	39118	25 %	25 %	50 %	0 %	203288784
136	NC_011256	TAAT	2	8	39469	39476	50 %	50 %	0 %	0 %	203288784
137	NC_011256	AATG	2	8	39913	39920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011256	ATTG	2	8	40174	40181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011256	CATT	2	8	40237	40244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011256	ATTT	2	8	40579	40586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011256	TTCA	2	8	40912	40919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011256	TTAA	2	8	41008	41015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011256	CTTT	2	8	41057	41064	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011256	AATA	2	8	41130	41137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011256	TCTT	2	8	41230	41237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011256	CTTC	2	8	41278	41285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.