MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	TGTA	2	8	245	252	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011256	AATT	2	8	292	299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011256	TCTT	2	8	8915	8922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011256	TAAC	2	8	9630	9637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011256	CAAA	2	8	10101	10108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011256	AATA	2	8	21367	21374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011256	TAAT	2	8	22265	22272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011256	TCAA	2	8	22378	22385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011256	AAGC	2	8	26466	26473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011256	ATCA	2	8	26768	26775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011256	AATT	2	8	27080	27087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011256	CTTA	2	8	27514	27521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011256	ATTA	2	8	28884	28891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011256	TTAT	2	8	28937	28944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011256	TTTA	2	8	29178	29185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011256	TAGA	2	8	29465	29472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011256	AATA	2	8	30231	30238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011256	TAAA	2	8	30243	30250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011256	TACA	2	8	31255	31262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011256	AATT	3	12	31493	31504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011256	ACAA	2	8	31690	31697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011256	AATT	2	8	31925	31932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011256	ATTT	2	8	32125	32132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011256	AAAG	2	8	32224	32231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011256	AAAT	2	8	32284	32291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011256	ATAA	2	8	32304	32311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011256	ATAA	2	8	32945	32952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011256	ATAA	2	8	32971	32978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011256	AGAA	2	8	33076	33083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011256	AAAG	2	8	33208	33215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011256	TGAA	2	8	33353	33360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011256	AAAT	2	8	33690	33697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011256	ATAA	2	8	33718	33725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011256	AATG	2	8	39913	39920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011256	ATTG	2	8	40174	40181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011256	CATT	2	8	40237	40244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011256	ATTT	2	8	40579	40586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011256	TTCA	2	8	40912	40919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011256	TTAA	2	8	41008	41015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011256	CTTT	2	8	41057	41064	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011256	AATA	2	8	41130	41137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011256	TCTT	2	8	41230	41237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011256	CTTC	2	8	41278	41285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011256	CTTA	2	8	41312	41319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011256	GTTA	2	8	42113	42120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011256	TTCA	2	8	42128	42135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011256	TAAA	2	8	43225	43232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011256	TTAT	2	8	44483	44490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011256	AGAT	2	8	45048	45055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011256	AAGT	2	8	45165	45172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011256	ATAA	2	8	45242	45249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011256	GAAA	2	8	45452	45459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011256	AGAA	2	8	45467	45474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011256	AATT	2	8	46227	46234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011256	GTAA	2	8	46267	46274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011256	AGGA	2	8	46635	46642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011256	CATT	2	8	46766	46773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011256	ATAA	2	8	46836	46843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011256	TCTT	2	8	48217	48224	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011256	AATC	2	8	48395	48402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011256	ATTC	2	8	48444	48451	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011256	TCTT	2	8	48479	48486	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011256	TAAT	2	8	48809	48816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011256	AAGT	2	8	49109	49116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011256	CAAT	2	8	49169	49176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011256	AATC	2	8	49240	49247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011256	ATCA	2	8	49449	49456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011256	TTTA	2	8	49566	49573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011256	TACA	2	8	49587	49594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011256	TAAA	2	8	50761	50768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011256	AAGG	2	8	51262	51269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011256	TTTA	2	8	52313	52320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011256	TATT	2	8	52347	52354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011256	AGGA	2	8	52392	52399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011256	ATAG	2	8	52945	52952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011256	AATT	2	8	53554	53561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011256	AGTA	2	8	53893	53900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011256	GAGG	2	8	54069	54076	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011256	GTAA	2	8	54409	54416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011256	ACAA	2	8	54586	54593	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011256	GTAA	2	8	55264	55271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011256	ATAA	2	8	55551	55558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011256	GATA	2	8	55876	55883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011256	AATA	2	8	55930	55937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011256	CATT	2	8	55978	55985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011256	TAAA	5	20	56793	56812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011256	CATT	2	8	56895	56902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011256	ATAA	2	8	59339	59346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011256	TTAT	2	8	59441	59448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011256	TTTA	2	8	60675	60682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011256	TTTA	2	8	60698	60705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011256	AAGA	2	8	60774	60781	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011256	TTAC	2	8	60811	60818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011256	AACA	2	8	60982	60989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011256	ATTC	2	8	61007	61014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011256	GAAG	2	8	61132	61139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011256	ATTA	2	8	61571	61578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011256	TCAC	2	8	61581	61588	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011256	GAAA	2	8	61911	61918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011256	TGAT	2	8	64908	64915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011256	AATT	2	8	64923	64930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011256	TAAA	2	8	64954	64961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011256	TATG	2	8	65149	65156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011256	TGAG	2	8	65169	65176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011256	TTTG	2	8	65253	65260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011256	TTGT	2	8	65668	65675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011256	TACT	2	8	65743	65750	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011256	GAAT	2	8	65911	65918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011256	ACTT	2	8	66029	66036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011256	AATG	2	8	66077	66084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011256	TCTA	2	8	66346	66353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.