MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	TTTC	2	8	642	649	0 %	75 %	0 %	25 %	203288752
2	NC_011256	ATTC	2	8	886	893	25 %	50 %	0 %	25 %	203288752
3	NC_011256	AAAT	2	8	902	909	75 %	25 %	0 %	0 %	203288752
4	NC_011256	TTTC	2	8	937	944	0 %	75 %	0 %	25 %	203288752
5	NC_011256	CTTA	2	8	1550	1557	25 %	50 %	0 %	25 %	203288752
6	NC_011256	ACTT	2	8	2289	2296	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
7	NC_011256	AATT	2	8	2316	2323	50 %	50 %	0 %	0 %	203288753
8	NC_011256	ATCT	2	8	2464	2471	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
9	NC_011256	ATCT	2	8	2497	2504	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
10	NC_011256	TATC	2	8	2517	2524	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
11	NC_011256	ATCT	2	8	2551	2558	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
12	NC_011256	TATC	2	8	2571	2578	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
13	NC_011256	ATCT	2	8	2605	2612	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
14	NC_011256	TATC	2	8	2625	2632	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
15	NC_011256	ATCT	2	8	2659	2666	25 %	50 %	0 %	25 %	203288753
16	NC_011256	AATC	2	8	2676	2683	50 %	25 %	0 %	25 %	203288753
17	NC_011256	TTAT	2	8	2843	2850	25 %	75 %	0 %	0 %	203288753
18	NC_011256	AATT	2	8	2863	2870	50 %	50 %	0 %	0 %	203288753
19	NC_011256	TTCA	2	8	4660	4667	25 %	50 %	0 %	25 %	203288754
20	NC_011256	TCAA	2	8	6344	6351	50 %	25 %	0 %	25 %	203288754
21	NC_011256	GATC	2	8	6852	6859	25 %	25 %	25 %	25 %	203288755
22	NC_011256	TGTT	2	8	7138	7145	0 %	75 %	25 %	0 %	203288755
23	NC_011256	TGAT	2	8	7404	7411	25 %	50 %	25 %	0 %	203288755
24	NC_011256	TACC	2	8	7854	7861	25 %	25 %	0 %	50 %	203288756
25	NC_011256	TGTT	2	8	7979	7986	0 %	75 %	25 %	0 %	203288756
26	NC_011256	CATA	2	8	8143	8150	50 %	25 %	0 %	25 %	203288756
27	NC_011256	TGAT	2	8	8245	8252	25 %	50 %	25 %	0 %	203288756
28	NC_011256	CGAA	2	8	8689	8696	50 %	0 %	25 %	25 %	203288757
29	NC_011256	CAAA	2	8	8824	8831	75 %	0 %	0 %	25 %	203288757
30	NC_011256	TCTT	2	8	8844	8851	0 %	75 %	0 %	25 %	203288757
31	NC_011256	ACTT	2	8	9227	9234	25 %	50 %	0 %	25 %	203288758
32	NC_011256	AATC	2	8	9280	9287	50 %	25 %	0 %	25 %	203288758
33	NC_011256	ATCA	2	8	9290	9297	50 %	25 %	0 %	25 %	203288758
34	NC_011256	ATAA	2	8	9381	9388	75 %	25 %	0 %	0 %	203288758
35	NC_011256	TAAC	2	8	10374	10381	50 %	25 %	0 %	25 %	203288759
36	NC_011256	ATGA	2	8	10449	10456	50 %	25 %	25 %	0 %	203288759
37	NC_011256	AACA	2	8	10509	10516	75 %	0 %	0 %	25 %	203288759
38	NC_011256	ATGG	2	8	10831	10838	25 %	25 %	50 %	0 %	203288759
39	NC_011256	ATCA	2	8	10923	10930	50 %	25 %	0 %	25 %	203288759
40	NC_011256	TTTA	2	8	12384	12391	25 %	75 %	0 %	0 %	203288762
41	NC_011256	TCCC	2	8	12630	12637	0 %	25 %	0 %	75 %	203288762
42	NC_011256	ATTG	2	8	14402	14409	25 %	50 %	25 %	0 %	203288763
43	NC_011256	ATTC	2	8	14742	14749	25 %	50 %	0 %	25 %	203288764
44	NC_011256	ATTT	2	8	15381	15388	25 %	75 %	0 %	0 %	203288765
45	NC_011256	TTGA	2	8	15979	15986	25 %	50 %	25 %	0 %	203288766
46	NC_011256	CAAA	2	8	16158	16165	75 %	0 %	0 %	25 %	203288766
47	NC_011256	TCAA	2	8	16189	16196	50 %	25 %	0 %	25 %	203288766
48	NC_011256	ATTG	2	8	16335	16342	25 %	50 %	25 %	0 %	203288766
49	NC_011256	CAAA	2	8	16385	16392	75 %	0 %	0 %	25 %	203288766
50	NC_011256	AATC	2	8	16906	16913	50 %	25 %	0 %	25 %	203288767
51	NC_011256	TTAG	2	8	17799	17806	25 %	50 %	25 %	0 %	203288767
52	NC_011256	AAAT	2	8	17842	17849	75 %	25 %	0 %	0 %	203288767
53	NC_011256	TCTT	2	8	19295	19302	0 %	75 %	0 %	25 %	203288767
54	NC_011256	TGTA	2	8	19476	19483	25 %	50 %	25 %	0 %	203288768
55	NC_011256	CACT	2	8	20124	20131	25 %	25 %	0 %	50 %	203288769
56	NC_011256	ACAA	2	8	20828	20835	75 %	0 %	0 %	25 %	203288770
57	NC_011256	TCTT	2	8	20948	20955	0 %	75 %	0 %	25 %	203288771
58	NC_011256	TCTT	2	8	21111	21118	0 %	75 %	0 %	25 %	203288771
59	NC_011256	ACAA	2	8	21259	21266	75 %	0 %	0 %	25 %	203288771
60	NC_011256	AGCA	2	8	21609	21616	50 %	0 %	25 %	25 %	203288772
61	NC_011256	AAAT	2	8	21710	21717	75 %	25 %	0 %	0 %	203288772
62	NC_011256	AAAT	2	8	22046	22053	75 %	25 %	0 %	0 %	203288772
63	NC_011256	AATA	2	8	22077	22084	75 %	25 %	0 %	0 %	203288772
64	NC_011256	AAAT	2	8	22580	22587	75 %	25 %	0 %	0 %	203288773
65	NC_011256	AATA	2	8	22725	22732	75 %	25 %	0 %	0 %	203288773
66	NC_011256	CAAT	2	8	22753	22760	50 %	25 %	0 %	25 %	203288773
67	NC_011256	TTAC	2	8	23005	23012	25 %	50 %	0 %	25 %	203288773
68	NC_011256	ATAA	2	8	23194	23201	75 %	25 %	0 %	0 %	203288773
69	NC_011256	AAGA	2	8	23804	23811	75 %	0 %	25 %	0 %	203288773
70	NC_011256	CGCC	2	8	23977	23984	0 %	0 %	25 %	75 %	203288773
71	NC_011256	GTAT	2	8	24281	24288	25 %	50 %	25 %	0 %	203288774
72	NC_011256	AGAA	2	8	24458	24465	75 %	0 %	25 %	0 %	203288774
73	NC_011256	TTAT	2	8	24739	24746	25 %	75 %	0 %	0 %	203288775
74	NC_011256	ATCC	2	8	25341	25348	25 %	25 %	0 %	50 %	203288775
75	NC_011256	TTTA	2	8	25768	25775	25 %	75 %	0 %	0 %	203288776
76	NC_011256	TAAT	2	8	25986	25993	50 %	50 %	0 %	0 %	203288776
77	NC_011256	ATGT	2	8	26007	26014	25 %	50 %	25 %	0 %	203288776
78	NC_011256	GTAA	2	8	26044	26051	50 %	25 %	25 %	0 %	203288776
79	NC_011256	ATTT	2	8	26203	26210	25 %	75 %	0 %	0 %	203288776
80	NC_011256	TGTT	2	8	26239	26246	0 %	75 %	25 %	0 %	203288776
81	NC_011256	ATTC	2	8	28703	28710	25 %	50 %	0 %	25 %	203288777
82	NC_011256	ACTT	2	8	29493	29500	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
83	NC_011256	TATC	2	8	29620	29627	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
84	NC_011256	ATCT	2	8	29654	29661	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
85	NC_011256	TATC	2	8	29707	29714	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
86	NC_011256	ATCT	2	8	29774	29781	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
87	NC_011256	ATCT	2	8	29807	29814	25 %	50 %	0 %	25 %	203288778
88	NC_011256	CAAT	2	8	32844	32851	50 %	25 %	0 %	25 %	203288779
89	NC_011256	TAAT	2	8	35062	35069	50 %	50 %	0 %	0 %	203288780
90	NC_011256	ACCA	2	8	35785	35792	50 %	0 %	0 %	50 %	203288780
91	NC_011256	AAAT	2	8	35901	35908	75 %	25 %	0 %	0 %	203288780
92	NC_011256	TAAT	2	8	36016	36023	50 %	50 %	0 %	0 %	203288780
93	NC_011256	ATTC	2	8	36133	36140	25 %	50 %	0 %	25 %	203288780
94	NC_011256	GTTT	2	8	36192	36199	0 %	75 %	25 %	0 %	203288780
95	NC_011256	ATTC	2	8	36269	36276	25 %	50 %	0 %	25 %	203288780
96	NC_011256	TTAT	2	8	36683	36690	25 %	75 %	0 %	0 %	203288781
97	NC_011256	AACA	2	8	36871	36878	75 %	0 %	0 %	25 %	203288781
98	NC_011256	GATT	2	8	37493	37500	25 %	50 %	25 %	0 %	203288781
99	NC_011256	GAAA	2	8	38119	38126	75 %	0 %	25 %	0 %	203288782
100	NC_011256	TTTA	2	8	38470	38477	25 %	75 %	0 %	0 %	203288783
101	NC_011256	TAGC	2	8	38808	38815	25 %	25 %	25 %	25 %	203288783
102	NC_011256	GATG	2	8	39111	39118	25 %	25 %	50 %	0 %	203288784
103	NC_011256	TAAT	2	8	39469	39476	50 %	50 %	0 %	0 %	203288784
104	NC_011256	CAAT	2	8	41506	41513	50 %	25 %	0 %	25 %	203288785
105	NC_011256	TTCT	2	8	41610	41617	0 %	75 %	0 %	25 %	203288785
106	NC_011256	AAAT	2	8	41645	41652	75 %	25 %	0 %	0 %	203288785
107	NC_011256	TGTT	2	8	41719	41726	0 %	75 %	25 %	0 %	203288785
108	NC_011256	TGAG	2	8	42252	42259	25 %	25 %	50 %	0 %	203288786
109	NC_011256	AAGA	2	8	42650	42657	75 %	0 %	25 %	0 %	203288786
110	NC_011256	AGAA	2	8	42906	42913	75 %	0 %	25 %	0 %	203288786
111	NC_011256	AAAG	2	8	42931	42938	75 %	0 %	25 %	0 %	203288786
112	NC_011256	ATCA	2	8	43081	43088	50 %	25 %	0 %	25 %	203288786
113	NC_011256	ACTA	2	8	43806	43813	50 %	25 %	0 %	25 %	203288787
114	NC_011256	GAAA	2	8	43914	43921	75 %	0 %	25 %	0 %	203288787
115	NC_011256	TGAT	2	8	44084	44091	25 %	50 %	25 %	0 %	203288787
116	NC_011256	TAAA	2	8	44448	44455	75 %	25 %	0 %	0 %	203288787
117	NC_011256	AGGA	2	8	45641	45648	50 %	0 %	50 %	0 %	203288788
118	NC_011256	AAAT	2	8	46206	46213	75 %	25 %	0 %	0 %	203288788
119	NC_011256	GAAG	2	8	47225	47232	50 %	0 %	50 %	0 %	203288789
120	NC_011256	AGTA	2	8	54690	54697	50 %	25 %	25 %	0 %	203288790
121	NC_011256	TTGC	2	8	54844	54851	0 %	50 %	25 %	25 %	203288790
122	NC_011256	AAAT	2	8	54975	54982	75 %	25 %	0 %	0 %	203288790
123	NC_011256	GAAG	2	8	55008	55015	50 %	0 %	50 %	0 %	203288790
124	NC_011256	AGGA	2	8	56183	56190	50 %	0 %	50 %	0 %	203288791
125	NC_011256	AAGG	2	8	56205	56212	50 %	0 %	50 %	0 %	203288791
126	NC_011256	GAAA	2	8	56535	56542	75 %	0 %	25 %	0 %	203288791
127	NC_011256	TAAG	2	8	57331	57338	50 %	25 %	25 %	0 %	203288792
128	NC_011256	AGTG	2	8	57620	57627	25 %	25 %	50 %	0 %	203288792
129	NC_011256	GCGA	2	8	57797	57804	25 %	0 %	50 %	25 %	203288792
130	NC_011256	ATAA	2	8	57954	57961	75 %	25 %	0 %	0 %	203288792
131	NC_011256	TAAT	2	8	58013	58020	50 %	50 %	0 %	0 %	203288792
132	NC_011256	ATAA	2	8	58175	58182	75 %	25 %	0 %	0 %	203288793
133	NC_011256	GAAG	2	8	58573	58580	50 %	0 %	50 %	0 %	203288793
134	NC_011256	AGGA	2	8	59644	59651	50 %	0 %	50 %	0 %	203288794
135	NC_011256	GAAT	2	8	59702	59709	50 %	25 %	25 %	0 %	203288794
136	NC_011256	TGAT	2	8	60244	60251	25 %	50 %	25 %	0 %	203288794
137	NC_011256	TAAA	2	8	60614	60621	75 %	25 %	0 %	0 %	203288794
138	NC_011256	ATTT	2	8	62868	62875	25 %	75 %	0 %	0 %	203288795

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.