MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 447

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	TTA	2	6	2	7	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011256	ACA	3	9	18	26	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011256	ACT	3	9	53	61	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011256	TAA	2	6	66	71	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011256	ATT	3	9	85	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011256	TAT	2	6	108	113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011256	TTC	2	6	168	173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011256	TTC	2	6	189	194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011256	ATA	2	6	217	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011256	ATA	2	6	2957	2962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011256	CAA	3	9	2996	3004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011256	ATA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011256	TTG	2	6	3118	3123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011256	TCC	2	6	6574	6579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011256	CAG	3	9	6644	6652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011256	TTA	2	6	6661	6666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011256	CCT	2	6	6757	6762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011256	CAA	2	6	8991	8996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011256	CCT	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011256	CAA	2	6	9653	9658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011256	CTT	2	6	9659	9664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011256	AAC	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011256	CTG	2	6	9686	9691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011256	TCT	2	6	9735	9740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011256	CTA	2	6	9780	9785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011256	ATA	2	6	10119	10124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011256	CTA	2	6	10139	10144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011256	CAG	3	9	10152	10160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011256	ATC	2	6	10183	10188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011256	CCT	2	6	13391	13396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_011256	CCT	2	6	20137	20142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011256	TTA	2	6	21294	21299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011256	TAA	2	6	21354	21359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011256	ATA	2	6	21417	21422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011256	TAA	2	6	21424	21429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011256	ATA	2	6	21462	21467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011256	TAT	2	6	21482	21487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011256	ATG	2	6	22171	22176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011256	TTC	2	6	22477	22482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011256	ATT	2	6	24688	24693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011256	TTA	2	6	26377	26382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011256	CTT	2	6	26455	26460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011256	CAA	2	6	26533	26538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011256	GCA	3	9	26585	26593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011256	CTG	2	6	26631	26636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011256	CTA	2	6	26637	26642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011256	ATT	3	9	26680	26688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011256	CAT	2	6	26710	26715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011256	AGC	2	6	26876	26881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011256	CTT	2	6	26944	26949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011256	CAA	2	6	26950	26955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011256	AAT	2	6	26972	26977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011256	CAT	2	6	27043	27048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011256	CTT	2	6	27224	27229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011256	CTA	2	6	27252	27257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011256	TTC	2	6	27369	27374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011256	CTC	2	6	27397	27402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011256	CAT	4	12	27434	27445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011256	CCA	2	6	27448	27453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011256	TCA	2	6	27454	27459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011256	ATC	2	6	27462	27467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011256	TAA	2	6	27597	27602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011256	CCT	2	6	28717	28722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011256	TAA	2	6	28844	28849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011256	ATT	2	6	28869	28874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011256	TAA	2	6	28930	28935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011256	CAA	2	6	28998	29003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011256	CTA	2	6	29131	29136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011256	TCA	2	6	29149	29154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011256	TCT	2	6	29276	29281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011256	ATT	2	6	29287	29292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011256	ATT	2	6	29331	29336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011256	ATT	2	6	29397	29402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011256	TTA	2	6	29457	29462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011256	ATA	2	6	30183	30188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011256	CAT	3	9	30198	30206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011256	ACT	2	6	30256	30261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011256	TTG	2	6	30342	30347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011256	ATC	2	6	30424	30429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011256	ATT	2	6	30470	30475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011256	ATA	2	6	30538	30543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011256	ATT	2	6	30637	30642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011256	CAA	2	6	30711	30716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011256	TTC	2	6	30912	30917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011256	TTA	3	9	30949	30957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011256	ATT	2	6	30975	30980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011256	TAC	2	6	31126	31131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011256	ATT	2	6	31169	31174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011256	CTT	2	6	31180	31185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011256	TTC	2	6	31208	31213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011256	ATT	2	6	31217	31222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011256	ATA	2	6	31429	31434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011256	ATT	2	6	31487	31492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011256	TAA	2	6	31510	31515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011256	ATT	2	6	31566	31571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011256	CCT	2	6	31708	31713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011256	CAT	2	6	31740	31745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011256	GAA	2	6	31753	31758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011256	ATA	2	6	31814	31819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011256	GAT	2	6	31963	31968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011256	ATA	2	6	32042	32047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011256	TAA	2	6	32094	32099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011256	TAA	2	6	32141	32146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011256	CTA	2	6	32177	32182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011256	GAA	2	6	32185	32190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011256	ATA	3	9	32348	32356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011256	ACA	2	6	32369	32374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011256	AAT	2	6	32379	32384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011256	GAA	2	6	33026	33031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011256	CTA	2	6	33168	33173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011256	TAA	2	6	33293	33298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011256	ACA	2	6	33364	33369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011256	AAT	2	6	33511	33516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011256	AAG	2	6	33553	33558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011256	AGT	2	6	33582	33587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011256	TAT	2	6	33612	33617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011256	CAT	2	6	33625	33630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011256	ATT	2	6	33632	33637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011256	TAC	2	6	33746	33751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011256	AAC	2	6	33770	33775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011256	TCA	2	6	33966	33971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011256	TAC	2	6	34032	34037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011256	AAG	2	6	34049	34054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011256	TTA	2	6	34131	34136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011256	ATA	2	6	34170	34175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011256	TAA	2	6	34206	34211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011256	GAT	2	6	34271	34276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011256	TAT	2	6	34325	34330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011256	TTG	2	6	34331	34336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011256	ATT	2	6	34356	34361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011256	ATG	2	6	34605	34610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011256	ATT	2	6	34642	34647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011256	TAC	2	6	34680	34685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011256	TTA	2	6	34733	34738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011256	CAT	3	9	34759	34767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011256	ATT	2	6	34788	34793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011256	AAT	2	6	34868	34873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011256	ATT	2	6	34917	34922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011256	TAC	2	6	36324	36329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011256	ATT	2	6	36368	36373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011256	ATA	2	6	36391	36396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011256	AGG	2	6	38926	38931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.