MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	TC	3	6	211	216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011256	AT	3	6	313	318	50 %	50 %	0 %	0 %	203288752
3	NC_011256	AT	3	6	700	705	50 %	50 %	0 %	0 %	203288752
4	NC_011256	TC	3	6	916	921	0 %	50 %	0 %	50 %	203288752
5	NC_011256	CT	3	6	1075	1080	0 %	50 %	0 %	50 %	203288752
6	NC_011256	AG	3	6	1082	1087	50 %	0 %	50 %	0 %	203288752
7	NC_011256	CT	3	6	2820	2825	0 %	50 %	0 %	50 %	203288753
8	NC_011256	CT	3	6	4082	4087	0 %	50 %	0 %	50 %	203288754
9	NC_011256	AT	3	6	4170	4175	50 %	50 %	0 %	0 %	203288754
10	NC_011256	TC	4	8	4343	4350	0 %	50 %	0 %	50 %	203288754
11	NC_011256	CT	3	6	4586	4591	0 %	50 %	0 %	50 %	203288754
12	NC_011256	AG	3	6	5114	5119	50 %	0 %	50 %	0 %	203288754
13	NC_011256	TC	3	6	6172	6177	0 %	50 %	0 %	50 %	203288754
14	NC_011256	AT	3	6	6465	6470	50 %	50 %	0 %	0 %	203288754
15	NC_011256	CT	3	6	6761	6766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011256	TA	4	8	7595	7602	50 %	50 %	0 %	0 %	203288756
17	NC_011256	CA	3	6	8428	8433	50 %	0 %	0 %	50 %	203288756
18	NC_011256	GA	3	6	8579	8584	50 %	0 %	50 %	0 %	203288757
19	NC_011256	CA	4	8	9509	9516	50 %	0 %	0 %	50 %	203288758
20	NC_011256	AT	3	6	9600	9605	50 %	50 %	0 %	0 %	203288758
21	NC_011256	AT	3	6	9709	9714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011256	AG	3	6	9786	9791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011256	TG	3	6	10077	10082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011256	TA	3	6	10614	10619	50 %	50 %	0 %	0 %	203288759
25	NC_011256	AT	3	6	11209	11214	50 %	50 %	0 %	0 %	203288759
26	NC_011256	TA	3	6	11514	11519	50 %	50 %	0 %	0 %	203288760
27	NC_011256	TC	3	6	11814	11819	0 %	50 %	0 %	50 %	203288761
28	NC_011256	TC	4	8	12110	12117	0 %	50 %	0 %	50 %	203288761
29	NC_011256	AT	3	6	13260	13265	50 %	50 %	0 %	0 %	203288762
30	NC_011256	TA	3	6	13441	13446	50 %	50 %	0 %	0 %	203288763
31	NC_011256	GA	3	6	13601	13606	50 %	0 %	50 %	0 %	203288763
32	NC_011256	AC	4	8	14066	14073	50 %	0 %	0 %	50 %	203288763
33	NC_011256	TC	5	10	14161	14170	0 %	50 %	0 %	50 %	203288763
34	NC_011256	AT	3	6	14308	14313	50 %	50 %	0 %	0 %	203288763
35	NC_011256	TC	3	6	14470	14475	0 %	50 %	0 %	50 %	203288763
36	NC_011256	AT	3	6	15064	15069	50 %	50 %	0 %	0 %	203288765
37	NC_011256	TG	3	6	15242	15247	0 %	50 %	50 %	0 %	203288765
38	NC_011256	AT	3	6	16101	16106	50 %	50 %	0 %	0 %	203288766
39	NC_011256	TC	3	6	16115	16120	0 %	50 %	0 %	50 %	203288766
40	NC_011256	TA	3	6	16290	16295	50 %	50 %	0 %	0 %	203288766
41	NC_011256	TC	3	6	17099	17104	0 %	50 %	0 %	50 %	203288767
42	NC_011256	AT	3	6	17353	17358	50 %	50 %	0 %	0 %	203288767
43	NC_011256	TG	3	6	17777	17782	0 %	50 %	50 %	0 %	203288767
44	NC_011256	AT	4	8	17939	17946	50 %	50 %	0 %	0 %	203288767
45	NC_011256	GC	3	6	18002	18007	0 %	0 %	50 %	50 %	203288767
46	NC_011256	TC	3	6	18345	18350	0 %	50 %	0 %	50 %	203288767
47	NC_011256	TA	3	6	18682	18687	50 %	50 %	0 %	0 %	203288767
48	NC_011256	AT	3	6	19003	19008	50 %	50 %	0 %	0 %	203288767
49	NC_011256	TA	3	6	19420	19425	50 %	50 %	0 %	0 %	203288768
50	NC_011256	CT	3	6	20887	20892	0 %	50 %	0 %	50 %	203288771
51	NC_011256	TA	3	6	21530	21535	50 %	50 %	0 %	0 %	203288772
52	NC_011256	CT	3	6	21596	21601	0 %	50 %	0 %	50 %	203288772
53	NC_011256	AT	3	6	21634	21639	50 %	50 %	0 %	0 %	203288772
54	NC_011256	AT	3	6	21651	21656	50 %	50 %	0 %	0 %	203288772
55	NC_011256	TA	3	6	22117	22122	50 %	50 %	0 %	0 %	203288772
56	NC_011256	AT	4	8	22143	22150	50 %	50 %	0 %	0 %	203288772
57	NC_011256	TA	4	8	22336	22343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011256	TA	3	6	22394	22399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011256	AT	3	6	22444	22449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011256	AT	3	6	23772	23777	50 %	50 %	0 %	0 %	203288773
61	NC_011256	AG	3	6	23778	23783	50 %	0 %	50 %	0 %	203288773
62	NC_011256	GA	3	6	23829	23834	50 %	0 %	50 %	0 %	203288773
63	NC_011256	AG	3	6	23949	23954	50 %	0 %	50 %	0 %	203288773
64	NC_011256	GA	3	6	24119	24124	50 %	0 %	50 %	0 %	203288773
65	NC_011256	TA	3	6	25424	25429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011256	TG	3	6	25578	25583	0 %	50 %	50 %	0 %	203288776
67	NC_011256	CT	3	6	27662	27667	0 %	50 %	0 %	50 %	203288777
68	NC_011256	TC	3	6	28039	28044	0 %	50 %	0 %	50 %	203288777
69	NC_011256	GA	3	6	28240	28245	50 %	0 %	50 %	0 %	203288777
70	NC_011256	AC	3	6	28249	28254	50 %	0 %	0 %	50 %	203288777
71	NC_011256	CT	4	8	28540	28547	0 %	50 %	0 %	50 %	203288777
72	NC_011256	TA	3	6	28775	28780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011256	TC	3	6	28923	28928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011256	AT	3	6	29155	29160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011256	TA	3	6	29293	29298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011256	TC	3	6	29986	29991	0 %	50 %	0 %	50 %	203288778
77	NC_011256	TA	3	6	30080	30085	50 %	50 %	0 %	0 %	203288778
78	NC_011256	AT	4	8	30805	30812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011256	CT	3	6	31009	31014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011256	AT	3	6	31464	31469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011256	AT	3	6	31780	31785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011256	TA	4	8	31818	31825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011256	AT	3	6	32013	32018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011256	CA	3	6	32065	32070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011256	TA	3	6	32116	32121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011256	TA	3	6	32388	32393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011256	GA	3	6	32580	32585	50 %	0 %	50 %	0 %	203288779
88	NC_011256	TC	3	6	33037	33042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011256	TA	3	6	33160	33165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011256	AT	3	6	33252	33257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011256	AT	3	6	33491	33496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011256	AT	3	6	33788	33793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011256	AT	3	6	33800	33805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011256	TA	3	6	33994	33999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011256	TA	3	6	34135	34140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011256	TA	3	6	34194	34199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011256	AT	3	6	34219	34224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011256	TA	4	8	34888	34895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011256	AT	3	6	35113	35118	50 %	50 %	0 %	0 %	203288780
100	NC_011256	AT	3	6	35179	35184	50 %	50 %	0 %	0 %	203288780
101	NC_011256	CT	3	6	35559	35564	0 %	50 %	0 %	50 %	203288780
102	NC_011256	TA	3	6	36253	36258	50 %	50 %	0 %	0 %	203288780
103	NC_011256	AT	3	6	36340	36345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011256	TA	3	6	36356	36361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011256	GA	3	6	36742	36747	50 %	0 %	50 %	0 %	203288781
106	NC_011256	TC	3	6	37046	37051	0 %	50 %	0 %	50 %	203288781
107	NC_011256	AG	3	6	37298	37303	50 %	0 %	50 %	0 %	203288781
108	NC_011256	AT	3	6	37719	37724	50 %	50 %	0 %	0 %	203288782
109	NC_011256	GT	3	6	37996	38001	0 %	50 %	50 %	0 %	203288782
110	NC_011256	TA	3	6	38104	38109	50 %	50 %	0 %	0 %	203288782
111	NC_011256	AT	4	8	38352	38359	50 %	50 %	0 %	0 %	203288783
112	NC_011256	TA	3	6	38686	38691	50 %	50 %	0 %	0 %	203288783
113	NC_011256	TA	3	6	38843	38848	50 %	50 %	0 %	0 %	203288783
114	NC_011256	AT	3	6	38862	38867	50 %	50 %	0 %	0 %	203288783
115	NC_011256	AT	3	6	38902	38907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011256	AT	3	6	38998	39003	50 %	50 %	0 %	0 %	203288784
117	NC_011256	AT	3	6	39172	39177	50 %	50 %	0 %	0 %	203288784
118	NC_011256	AT	3	6	39656	39661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011256	TA	3	6	39887	39892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011256	AT	3	6	39941	39946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011256	AT	3	6	40778	40783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011256	AT	3	6	41378	41383	50 %	50 %	0 %	0 %	203288785
123	NC_011256	TA	3	6	41523	41528	50 %	50 %	0 %	0 %	203288785
124	NC_011256	TA	3	6	41748	41753	50 %	50 %	0 %	0 %	203288785
125	NC_011256	TG	3	6	41806	41811	0 %	50 %	50 %	0 %	203288785
126	NC_011256	AT	3	6	42801	42806	50 %	50 %	0 %	0 %	203288786
127	NC_011256	GA	3	6	43134	43139	50 %	0 %	50 %	0 %	203288786
128	NC_011256	CT	3	6	43257	43262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011256	TA	3	6	43282	43287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011256	GA	3	6	44520	44525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011256	TA	3	6	44569	44574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011256	AG	3	6	44780	44785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011256	AT	3	6	44925	44930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011256	GA	3	6	45258	45263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011256	TA	3	6	45315	45320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011256	CT	3	6	45376	45381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011256	TG	3	6	45400	45405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011256	TA	3	6	45407	45412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011256	AG	3	6	45499	45504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011256	AG	3	6	45532	45537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011256	AG	4	8	45549	45556	50 %	0 %	50 %	0 %	203288788
142	NC_011256	TG	3	6	46777	46782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011256	AG	3	6	46871	46876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011256	AG	3	6	46924	46929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011256	TA	3	6	48411	48416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011256	AT	3	6	49496	49501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011256	TA	4	8	49670	49677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011256	TA	3	6	49796	49801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011256	AG	4	8	50935	50942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.