MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl70

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011256	AT	3	6	313	318	50 %	50 %	0 %	0 %	203288752
2	NC_011256	AT	3	6	700	705	50 %	50 %	0 %	0 %	203288752
3	NC_011256	TC	3	6	916	921	0 %	50 %	0 %	50 %	203288752
4	NC_011256	CT	3	6	1075	1080	0 %	50 %	0 %	50 %	203288752
5	NC_011256	AG	3	6	1082	1087	50 %	0 %	50 %	0 %	203288752
6	NC_011256	CT	3	6	2820	2825	0 %	50 %	0 %	50 %	203288753
7	NC_011256	CT	3	6	4082	4087	0 %	50 %	0 %	50 %	203288754
8	NC_011256	AT	3	6	4170	4175	50 %	50 %	0 %	0 %	203288754
9	NC_011256	TC	4	8	4343	4350	0 %	50 %	0 %	50 %	203288754
10	NC_011256	CT	3	6	4586	4591	0 %	50 %	0 %	50 %	203288754
11	NC_011256	AG	3	6	5114	5119	50 %	0 %	50 %	0 %	203288754
12	NC_011256	TC	3	6	6172	6177	0 %	50 %	0 %	50 %	203288754
13	NC_011256	AT	3	6	6465	6470	50 %	50 %	0 %	0 %	203288754
14	NC_011256	TA	4	8	7595	7602	50 %	50 %	0 %	0 %	203288756
15	NC_011256	CA	3	6	8428	8433	50 %	0 %	0 %	50 %	203288756
16	NC_011256	GA	3	6	8579	8584	50 %	0 %	50 %	0 %	203288757
17	NC_011256	CA	4	8	9509	9516	50 %	0 %	0 %	50 %	203288758
18	NC_011256	AT	3	6	9600	9605	50 %	50 %	0 %	0 %	203288758
19	NC_011256	TA	3	6	10614	10619	50 %	50 %	0 %	0 %	203288759
20	NC_011256	AT	3	6	11209	11214	50 %	50 %	0 %	0 %	203288759
21	NC_011256	TA	3	6	11514	11519	50 %	50 %	0 %	0 %	203288760
22	NC_011256	TC	3	6	11814	11819	0 %	50 %	0 %	50 %	203288761
23	NC_011256	TC	4	8	12110	12117	0 %	50 %	0 %	50 %	203288761
24	NC_011256	AT	3	6	13260	13265	50 %	50 %	0 %	0 %	203288762
25	NC_011256	TA	3	6	13441	13446	50 %	50 %	0 %	0 %	203288763
26	NC_011256	GA	3	6	13601	13606	50 %	0 %	50 %	0 %	203288763
27	NC_011256	AC	4	8	14066	14073	50 %	0 %	0 %	50 %	203288763
28	NC_011256	TC	5	10	14161	14170	0 %	50 %	0 %	50 %	203288763
29	NC_011256	AT	3	6	14308	14313	50 %	50 %	0 %	0 %	203288763
30	NC_011256	TC	3	6	14470	14475	0 %	50 %	0 %	50 %	203288763
31	NC_011256	AT	3	6	15064	15069	50 %	50 %	0 %	0 %	203288765
32	NC_011256	TG	3	6	15242	15247	0 %	50 %	50 %	0 %	203288765
33	NC_011256	AT	3	6	16101	16106	50 %	50 %	0 %	0 %	203288766
34	NC_011256	TC	3	6	16115	16120	0 %	50 %	0 %	50 %	203288766
35	NC_011256	TA	3	6	16290	16295	50 %	50 %	0 %	0 %	203288766
36	NC_011256	TC	3	6	17099	17104	0 %	50 %	0 %	50 %	203288767
37	NC_011256	AT	3	6	17353	17358	50 %	50 %	0 %	0 %	203288767
38	NC_011256	TG	3	6	17777	17782	0 %	50 %	50 %	0 %	203288767
39	NC_011256	AT	4	8	17939	17946	50 %	50 %	0 %	0 %	203288767
40	NC_011256	GC	3	6	18002	18007	0 %	0 %	50 %	50 %	203288767
41	NC_011256	TC	3	6	18345	18350	0 %	50 %	0 %	50 %	203288767
42	NC_011256	TA	3	6	18682	18687	50 %	50 %	0 %	0 %	203288767
43	NC_011256	AT	3	6	19003	19008	50 %	50 %	0 %	0 %	203288767
44	NC_011256	TA	3	6	19420	19425	50 %	50 %	0 %	0 %	203288768
45	NC_011256	CT	3	6	20887	20892	0 %	50 %	0 %	50 %	203288771
46	NC_011256	TA	3	6	21530	21535	50 %	50 %	0 %	0 %	203288772
47	NC_011256	CT	3	6	21596	21601	0 %	50 %	0 %	50 %	203288772
48	NC_011256	AT	3	6	21634	21639	50 %	50 %	0 %	0 %	203288772
49	NC_011256	AT	3	6	21651	21656	50 %	50 %	0 %	0 %	203288772
50	NC_011256	TA	3	6	22117	22122	50 %	50 %	0 %	0 %	203288772
51	NC_011256	AT	4	8	22143	22150	50 %	50 %	0 %	0 %	203288772
52	NC_011256	AT	3	6	23772	23777	50 %	50 %	0 %	0 %	203288773
53	NC_011256	AG	3	6	23778	23783	50 %	0 %	50 %	0 %	203288773
54	NC_011256	GA	3	6	23829	23834	50 %	0 %	50 %	0 %	203288773
55	NC_011256	AG	3	6	23949	23954	50 %	0 %	50 %	0 %	203288773
56	NC_011256	GA	3	6	24119	24124	50 %	0 %	50 %	0 %	203288773
57	NC_011256	TG	3	6	25578	25583	0 %	50 %	50 %	0 %	203288776
58	NC_011256	CT	3	6	27662	27667	0 %	50 %	0 %	50 %	203288777
59	NC_011256	TC	3	6	28039	28044	0 %	50 %	0 %	50 %	203288777
60	NC_011256	GA	3	6	28240	28245	50 %	0 %	50 %	0 %	203288777
61	NC_011256	AC	3	6	28249	28254	50 %	0 %	0 %	50 %	203288777
62	NC_011256	CT	4	8	28540	28547	0 %	50 %	0 %	50 %	203288777
63	NC_011256	TC	3	6	29986	29991	0 %	50 %	0 %	50 %	203288778
64	NC_011256	TA	3	6	30080	30085	50 %	50 %	0 %	0 %	203288778
65	NC_011256	GA	3	6	32580	32585	50 %	0 %	50 %	0 %	203288779
66	NC_011256	AT	3	6	35113	35118	50 %	50 %	0 %	0 %	203288780
67	NC_011256	AT	3	6	35179	35184	50 %	50 %	0 %	0 %	203288780
68	NC_011256	CT	3	6	35559	35564	0 %	50 %	0 %	50 %	203288780
69	NC_011256	TA	3	6	36253	36258	50 %	50 %	0 %	0 %	203288780
70	NC_011256	GA	3	6	36742	36747	50 %	0 %	50 %	0 %	203288781
71	NC_011256	TC	3	6	37046	37051	0 %	50 %	0 %	50 %	203288781
72	NC_011256	AG	3	6	37298	37303	50 %	0 %	50 %	0 %	203288781
73	NC_011256	AT	3	6	37719	37724	50 %	50 %	0 %	0 %	203288782
74	NC_011256	GT	3	6	37996	38001	0 %	50 %	50 %	0 %	203288782
75	NC_011256	TA	3	6	38104	38109	50 %	50 %	0 %	0 %	203288782
76	NC_011256	AT	4	8	38352	38359	50 %	50 %	0 %	0 %	203288783
77	NC_011256	TA	3	6	38686	38691	50 %	50 %	0 %	0 %	203288783
78	NC_011256	TA	3	6	38843	38848	50 %	50 %	0 %	0 %	203288783
79	NC_011256	AT	3	6	38862	38867	50 %	50 %	0 %	0 %	203288783
80	NC_011256	AT	3	6	38998	39003	50 %	50 %	0 %	0 %	203288784
81	NC_011256	AT	3	6	39172	39177	50 %	50 %	0 %	0 %	203288784
82	NC_011256	AT	3	6	41378	41383	50 %	50 %	0 %	0 %	203288785
83	NC_011256	TA	3	6	41523	41528	50 %	50 %	0 %	0 %	203288785
84	NC_011256	TA	3	6	41748	41753	50 %	50 %	0 %	0 %	203288785
85	NC_011256	TG	3	6	41806	41811	0 %	50 %	50 %	0 %	203288785
86	NC_011256	AT	3	6	42801	42806	50 %	50 %	0 %	0 %	203288786
87	NC_011256	GA	3	6	43134	43139	50 %	0 %	50 %	0 %	203288786
88	NC_011256	AG	4	8	45549	45556	50 %	0 %	50 %	0 %	203288788
89	NC_011256	AG	3	6	56083	56088	50 %	0 %	50 %	0 %	203288791
90	NC_011256	AT	3	6	57634	57639	50 %	50 %	0 %	0 %	203288792
91	NC_011256	GA	3	6	57970	57975	50 %	0 %	50 %	0 %	203288792
92	NC_011256	GA	4	8	58245	58252	50 %	0 %	50 %	0 %	203288793
93	NC_011256	AG	4	8	58258	58265	50 %	0 %	50 %	0 %	203288793
94	NC_011256	AG	4	8	58269	58276	50 %	0 %	50 %	0 %	203288793
95	NC_011256	GA	3	6	59656	59661	50 %	0 %	50 %	0 %	203288794
96	NC_011256	AT	3	6	59869	59874	50 %	50 %	0 %	0 %	203288794
97	NC_011256	AT	3	6	62963	62968	50 %	50 %	0 %	0 %	203288795
98	NC_011256	GT	4	8	63190	63197	0 %	50 %	50 %	0 %	203288795
99	NC_011256	AG	3	6	63793	63798	50 %	0 %	50 %	0 %	203288796
100	NC_011256	GA	3	6	63885	63890	50 %	0 %	50 %	0 %	203288796
101	NC_011256	AT	3	6	64169	64174	50 %	50 %	0 %	0 %	203288796
102	NC_011256	TA	3	6	64181	64186	50 %	50 %	0 %	0 %	203288796
103	NC_011256	GA	4	8	64289	64296	50 %	0 %	50 %	0 %	203288796
104	NC_011256	TA	4	8	64353	64360	50 %	50 %	0 %	0 %	203288796

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.