MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl35

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011255	ATTTA	2	10	570	579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011255	ATACT	2	10	3373	3382	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011255	TAAAC	2	10	4099	4108	60 %	20 %	0 %	20 %	203288402
4	NC_011255	TACCT	2	10	5349	5358	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011255	AATAC	2	10	5824	5833	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011255	TTTAA	2	10	8247	8256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011255	CTTTA	2	10	8734	8743	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011255	ATTAT	2	10	8936	8945	40 %	60 %	0 %	0 %	203288404
9	NC_011255	GATCA	2	10	9332	9341	40 %	20 %	20 %	20 %	203288404
10	NC_011255	AACAA	2	10	9610	9619	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011255	TAAAA	2	10	10014	10023	80 %	20 %	0 %	0 %	203288405
12	NC_011255	TAAGA	2	10	10934	10943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011255	AAAGA	2	10	10989	10998	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011255	AACAT	2	10	11432	11441	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011255	CTAAC	2	10	11928	11937	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011255	ATTTA	2	10	13110	13119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011255	TAATT	2	10	13153	13162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011255	TAAAA	2	10	13681	13690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011255	TCTTT	2	10	13897	13906	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011255	ATTAT	2	10	14266	14275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011255	TATAT	2	10	15559	15568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011255	AGAAA	2	10	16245	16254	80 %	0 %	20 %	0 %	203288406
23	NC_011255	AGAGA	2	10	17157	17166	60 %	0 %	40 %	0 %	203288408
24	NC_011255	CAAAA	2	10	18202	18211	80 %	0 %	0 %	20 %	203288409
25	NC_011255	AATTA	2	10	19740	19749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011255	TAAAA	2	10	21398	21407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011255	ATGTT	2	10	21467	21476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011255	ATTTT	2	10	22534	22543	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011255	AGGAT	2	10	22740	22749	40 %	20 %	40 %	0 %	203288410
30	NC_011255	TTTGT	2	10	23240	23249	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011255	TTAAA	2	10	24550	24559	60 %	40 %	0 %	0 %	203288411
32	NC_011255	AGTAT	2	10	28866	28875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011255	AGATA	2	10	29247	29256	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011255	AGGTA	2	10	30031	30040	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011255	AGTTT	2	10	31284	31293	20 %	60 %	20 %	0 %	203288414
36	NC_011255	TGCAG	2	10	31429	31438	20 %	20 %	40 %	20 %	203288414
37	NC_011255	TAGTA	2	10	32010	32019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011255	AATGT	2	10	32324	32333	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.