MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl35

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011255	CAAA	2	8	1888	1895	75 %	0 %	0 %	25 %	203288401
2	NC_011255	CTGC	2	8	3951	3958	0 %	25 %	25 %	50 %	203288402
3	NC_011255	AACT	2	8	4039	4046	50 %	25 %	0 %	25 %	203288402
4	NC_011255	TATC	2	8	6426	6433	25 %	50 %	0 %	25 %	203288403
5	NC_011255	ATCT	2	8	6460	6467	25 %	50 %	0 %	25 %	203288403
6	NC_011255	TATC	2	8	6513	6520	25 %	50 %	0 %	25 %	203288403
7	NC_011255	TATC	2	8	6699	6706	25 %	50 %	0 %	25 %	203288403
8	NC_011255	ATCT	2	8	6733	6740	25 %	50 %	0 %	25 %	203288403
9	NC_011255	TAAG	2	8	9267	9274	50 %	25 %	25 %	0 %	203288404
10	NC_011255	AAAT	2	8	10200	10207	75 %	25 %	0 %	0 %	203288405
11	NC_011255	AAGA	2	8	10237	10244	75 %	0 %	25 %	0 %	203288405
12	NC_011255	GAAT	2	8	15719	15726	50 %	25 %	25 %	0 %	203288406
13	NC_011255	AAAT	2	8	16008	16015	75 %	25 %	0 %	0 %	203288406
14	NC_011255	GTCA	2	8	16174	16181	25 %	25 %	25 %	25 %	203288406
15	NC_011255	TAAA	2	8	16423	16430	75 %	25 %	0 %	0 %	203288406
16	NC_011255	ATTT	2	8	16674	16681	25 %	75 %	0 %	0 %	203288407
17	NC_011255	GTAT	2	8	16710	16717	25 %	50 %	25 %	0 %	203288407
18	NC_011255	GATA	2	8	17106	17113	50 %	25 %	25 %	0 %	203288408
19	NC_011255	ATTC	2	8	17590	17597	25 %	50 %	0 %	25 %	203288408
20	NC_011255	TTAA	2	8	17710	17717	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
21	NC_011255	ATTA	2	8	17731	17738	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
22	NC_011255	ATGT	2	8	24163	24170	25 %	50 %	25 %	0 %	203288411
23	NC_011255	AGGA	2	8	28165	28172	50 %	0 %	50 %	0 %	203288413
24	NC_011255	AAGG	2	8	28187	28194	50 %	0 %	50 %	0 %	203288413
25	NC_011255	TTGC	2	8	28377	28384	0 %	50 %	25 %	25 %	203288413
26	NC_011255	TAAA	2	8	28507	28514	75 %	25 %	0 %	0 %	203288413
27	NC_011255	ATAG	2	8	28584	28591	50 %	25 %	25 %	0 %	203288413
28	NC_011255	AAGA	2	8	31196	31203	75 %	0 %	25 %	0 %	203288414
29	NC_011255	AGTT	2	8	31347	31354	25 %	50 %	25 %	0 %	203288414
30	NC_011255	AATA	2	8	33412	33419	75 %	25 %	0 %	0 %	203288415
31	NC_011255	GTTT	2	8	33497	33504	0 %	75 %	25 %	0 %	203288415
32	NC_011255	AGAA	2	8	33788	33795	75 %	0 %	25 %	0 %	203288415
33	NC_011255	TGAG	2	8	33986	33993	25 %	25 %	50 %	0 %	203288415
34	NC_011255	TAGA	2	8	34475	34482	50 %	25 %	25 %	0 %	203288415
35	NC_011255	TAGA	2	8	34641	34648	50 %	25 %	25 %	0 %	203288415

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.