MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl35

Total Repeats: 583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011255	ATT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011255	ATT	4	12	59	70	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011255	CAT	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011255	TAG	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011255	AGC	2	6	255	260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011255	GCT	2	6	364	369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011255	TGC	2	6	405	410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011255	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011255	ATT	2	6	509	514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011255	GAT	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011255	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011255	GAT	2	6	813	818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011255	TTC	2	6	836	841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011255	ATT	2	6	989	994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011255	TTC	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011255	TTA	2	6	1050	1055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011255	TCA	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011255	CTT	2	6	1252	1257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011255	CAT	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011255	TTC	2	6	1283	1288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011255	ATA	2	6	1313	1318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011255	TCT	2	6	1338	1343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011255	TCA	3	9	1374	1382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011255	ATA	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011255	AAG	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011255	ACT	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288401
27	NC_011255	ATG	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288401
28	NC_011255	TCA	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288401
29	NC_011255	CTT	2	6	1597	1602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288401
30	NC_011255	TTG	2	6	1700	1705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288401
31	NC_011255	TGT	2	6	1736	1741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288401
32	NC_011255	CAT	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288401
33	NC_011255	TTA	3	9	1836	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288401
34	NC_011255	TCT	2	6	1996	2001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011255	TAA	2	6	2012	2017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011255	ATA	2	6	2076	2081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011255	TTA	2	6	2105	2110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011255	ATT	2	6	2145	2150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011255	CAT	3	9	2210	2218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011255	CTC	2	6	2253	2258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011255	ATT	2	6	2305	2310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011255	ACT	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011255	TAT	2	6	2388	2393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011255	TTA	2	6	2519	2524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011255	TAC	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011255	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011255	TTA	2	6	2757	2762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011255	CAT	2	6	2832	2837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011255	TAT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011255	TTA	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011255	TTC	2	6	3102	3107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011255	GCA	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011255	TAA	2	6	3177	3182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011255	AAT	2	6	3200	3205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011255	CTA	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011255	TAA	2	6	3346	3351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011255	ATA	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011255	TAC	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011255	TAC	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288402
60	NC_011255	ACT	2	6	3400	3405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288402
61	NC_011255	CTT	2	6	3411	3416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288402
62	NC_011255	TTC	2	6	3456	3461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288402
63	NC_011255	TAG	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288402
64	NC_011255	CTG	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288402
65	NC_011255	TTA	2	6	3597	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288402
66	NC_011255	GCA	2	6	3680	3685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288402
67	NC_011255	CAG	2	6	3696	3701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288402
68	NC_011255	TGC	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288402
69	NC_011255	CAC	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288402
70	NC_011255	GCT	2	6	3896	3901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288402
71	NC_011255	CAA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288402
72	NC_011255	CTT	2	6	4188	4193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288402
73	NC_011255	CAC	2	6	4363	4368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288402
74	NC_011255	ATC	2	6	4382	4387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288402
75	NC_011255	TTC	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288402
76	NC_011255	CCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288402
77	NC_011255	TCT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288402
78	NC_011255	TAA	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011255	TAT	2	6	4595	4600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011255	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011255	TCC	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011255	CCT	2	6	4852	4857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011255	CAA	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011255	GCA	2	6	4936	4941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011255	TCT	2	6	4984	4989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011255	CAT	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011255	ATC	2	6	5124	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011255	ACT	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011255	CTA	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011255	TAA	2	6	5202	5207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011255	CTG	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011255	CAC	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011255	TGC	2	6	5295	5300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011255	CTC	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_011255	ATC	3	9	5627	5635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011255	CTA	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011255	TTC	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011255	TAA	2	6	5872	5877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011255	TCA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011255	TTC	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011255	TCT	2	6	6051	6056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011255	ATT	2	6	6062	6067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011255	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011255	ATT	2	6	6200	6205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011255	TAA	2	6	6363	6368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288403
106	NC_011255	ATT	2	6	6598	6603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288403
107	NC_011255	CAA	2	6	6693	6698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288403
108	NC_011255	ATT	2	6	6751	6756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288403
109	NC_011255	TAG	2	6	6864	6869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288403
110	NC_011255	ATC	2	6	6901	6906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288403
111	NC_011255	ATT	2	6	7012	7017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011255	ATA	2	6	7020	7025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011255	CAT	3	9	7124	7132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011255	ACT	2	6	7182	7187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011255	ATA	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011255	TAA	2	6	7194	7199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011255	TAA	2	6	7227	7232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011255	TTA	2	6	7252	7257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011255	TTG	2	6	7268	7273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011255	ATC	2	6	7350	7355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011255	ATT	2	6	7396	7401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011255	TGT	2	6	7407	7412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011255	ATA	2	6	7464	7469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011255	TAT	2	6	7505	7510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011255	ACT	2	6	7518	7523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011255	CAT	2	6	7598	7603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011255	AGT	2	6	7623	7628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011255	CCA	2	6	7745	7750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_011255	ATT	2	6	7897	7902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011255	ATT	2	6	8015	8020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011255	GTT	2	6	8047	8052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011255	CAA	2	6	8090	8095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011255	TTA	3	9	8328	8336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011255	ATC	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011255	ATT	2	6	8354	8359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011255	TAC	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011255	ATT	2	6	8551	8556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011255	TTC	2	6	8563	8568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011255	TTC	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011255	ATT	2	6	8599	8604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011255	ATC	2	6	8719	8724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011255	GAG	2	6	8889	8894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011255	ACT	2	6	9080	9085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288404
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146	NC_011255	AAG	2	6	9183	9188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288404
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150	NC_011255	ATC	2	6	9399	9404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288404
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155	NC_011255	ATT	2	6	9620	9625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011255	TAG	2	6	9661	9666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011255	AAT	2	6	9680	9685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011255	ACA	2	6	9699	9704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_011255	AAT	2	6	9709	9714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011255	AAT	2	6	9768	9773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288405
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259	NC_011255	TTA	2	6	15961	15966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288406
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