MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl35

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011255	ACT	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288401
2	NC_011255	ATG	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288401
3	NC_011255	TCA	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288401
4	NC_011255	CTT	2	6	1597	1602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288401
5	NC_011255	TTG	2	6	1700	1705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288401
6	NC_011255	TGT	2	6	1736	1741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288401
7	NC_011255	CAT	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288401
8	NC_011255	TTA	3	9	1836	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288401
9	NC_011255	TAC	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288402
10	NC_011255	ACT	2	6	3400	3405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288402
11	NC_011255	CTT	2	6	3411	3416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288402
12	NC_011255	TTC	2	6	3456	3461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288402
13	NC_011255	TAG	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288402
14	NC_011255	CTG	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288402
15	NC_011255	TTA	2	6	3597	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288402
16	NC_011255	GCA	2	6	3680	3685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288402
17	NC_011255	CAG	2	6	3696	3701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288402
18	NC_011255	TGC	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288402
19	NC_011255	CAC	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288402
20	NC_011255	GCT	2	6	3896	3901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288402
21	NC_011255	CAA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288402
22	NC_011255	CTT	2	6	4188	4193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288402
23	NC_011255	CAC	2	6	4363	4368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288402
24	NC_011255	ATC	2	6	4382	4387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288402
25	NC_011255	TTC	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288402
26	NC_011255	CCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288402
27	NC_011255	TCT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288402
28	NC_011255	TAA	2	6	6363	6368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288403
29	NC_011255	ATT	2	6	6598	6603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288403
30	NC_011255	CAA	2	6	6693	6698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288403
31	NC_011255	ATT	2	6	6751	6756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288403
32	NC_011255	TAG	2	6	6864	6869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288403
33	NC_011255	ATC	2	6	6901	6906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288403
34	NC_011255	ACT	2	6	9080	9085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288404
35	NC_011255	GAA	2	6	9086	9091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288404
36	NC_011255	ACA	2	6	9156	9161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288404
37	NC_011255	AAG	2	6	9183	9188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288404
38	NC_011255	CAA	2	6	9202	9207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288404
39	NC_011255	GAT	2	6	9236	9241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288404
40	NC_011255	TAT	2	6	9371	9376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288404
41	NC_011255	ATC	2	6	9399	9404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288404
42	NC_011255	CTA	2	6	9447	9452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288404
43	NC_011255	AAT	2	6	9490	9495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288404
44	NC_011255	TGT	2	6	9588	9593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288404
45	NC_011255	ATA	2	6	9595	9600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288404
46	NC_011255	AAT	2	6	9768	9773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288405
47	NC_011255	TAC	2	6	9794	9799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288405
48	NC_011255	AGT	2	6	9805	9810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288405
49	NC_011255	ATA	2	6	9821	9826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288405
50	NC_011255	CAA	2	6	9852	9857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288405
51	NC_011255	AAC	2	6	9869	9874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288405
52	NC_011255	GAA	2	6	9898	9903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288405
53	NC_011255	AAG	2	6	9956	9961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288405
54	NC_011255	TAA	2	6	9987	9992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288405
55	NC_011255	GAA	3	9	10003	10011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288405
56	NC_011255	CAA	2	6	10081	10086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288405
57	NC_011255	AGT	2	6	10104	10109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288405
58	NC_011255	CTG	2	6	10150	10155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288405
59	NC_011255	AAT	2	6	15891	15896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288406
60	NC_011255	TTA	2	6	15928	15933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288406
61	NC_011255	TAT	2	6	15945	15950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288406
62	NC_011255	TTA	2	6	15961	15966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288406
63	NC_011255	ATG	2	6	16070	16075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288406
64	NC_011255	ACA	2	6	16107	16112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288406
65	NC_011255	TAA	3	9	16191	16199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288406
66	NC_011255	ATA	2	6	16208	16213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288406
67	NC_011255	GAA	2	6	16383	16388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288406
68	NC_011255	AAG	2	6	16468	16473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288407
69	NC_011255	ATT	2	6	16772	16777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288407
70	NC_011255	TAT	2	6	16859	16864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288407
71	NC_011255	ATT	2	6	16906	16911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288407
72	NC_011255	ATA	2	6	16916	16921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288407
73	NC_011255	AAT	2	6	17010	17015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288407
74	NC_011255	TAC	2	6	17052	17057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288408
75	NC_011255	ATT	2	6	17076	17081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288408
76	NC_011255	CTA	3	9	17129	17137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288408
77	NC_011255	AAG	2	6	17178	17183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288408
78	NC_011255	AAT	2	6	17248	17253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288408
79	NC_011255	CCA	2	6	17389	17394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288408
80	NC_011255	ATT	2	6	17435	17440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288408
81	NC_011255	CAG	2	6	17456	17461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288408
82	NC_011255	TTA	2	6	17540	17545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288408
83	NC_011255	ATA	2	6	17561	17566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288408
84	NC_011255	ATT	2	6	17577	17582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288408
85	NC_011255	ATA	2	6	17660	17665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288408
86	NC_011255	TAA	3	9	17870	17878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288409
87	NC_011255	GAA	2	6	17880	17885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288409
88	NC_011255	TAA	2	6	17954	17959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288409
89	NC_011255	TAT	2	6	18003	18008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288409
90	NC_011255	ATT	2	6	18079	18084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288409
91	NC_011255	GCA	2	6	18093	18098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288409
92	NC_011255	AGA	2	6	18104	18109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288409
93	NC_011255	AGA	2	6	18119	18124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288409
94	NC_011255	TTG	2	6	18165	18170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288409
95	NC_011255	TTG	2	6	22609	22614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288410
96	NC_011255	ATT	2	6	22646	22651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288410
97	NC_011255	TTA	2	6	22663	22668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288410
98	NC_011255	ATT	2	6	22796	22801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288410
99	NC_011255	CTT	2	6	22807	22812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288410
100	NC_011255	TTC	2	6	22898	22903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288410
101	NC_011255	TCT	2	6	22926	22931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288410
102	NC_011255	AAT	2	6	22979	22984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288410
103	NC_011255	ATA	2	6	22993	22998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288410
104	NC_011255	TGA	2	6	24083	24088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288411
105	NC_011255	AAT	2	6	24204	24209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288411
106	NC_011255	AGA	2	6	24212	24217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288411
107	NC_011255	GAA	2	6	24240	24245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288411
108	NC_011255	AAT	2	6	24252	24257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288411
109	NC_011255	GTA	2	6	24295	24300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288411
110	NC_011255	TAA	3	9	24470	24478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288411
111	NC_011255	TAT	2	6	24534	24539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288411
112	NC_011255	ATA	2	6	26216	26221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288412
113	NC_011255	ATT	2	6	26230	26235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288412
114	NC_011255	ATA	2	6	26282	26287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288412
115	NC_011255	GTT	2	6	26344	26349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288412
116	NC_011255	ATT	2	6	26428	26433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288412
117	NC_011255	TTA	2	6	26452	26457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288412
118	NC_011255	AAG	2	6	28051	28056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288413
119	NC_011255	AGA	2	6	28098	28103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288413
120	NC_011255	GTA	2	6	28104	28109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288413
121	NC_011255	ATG	2	6	28116	28121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288413
122	NC_011255	TGA	3	9	28123	28131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288413
123	NC_011255	ATA	2	6	28144	28149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288413
124	NC_011255	GTA	2	6	28221	28226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288413
125	NC_011255	TGT	2	6	28247	28252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288413
126	NC_011255	AGA	2	6	28259	28264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288413
127	NC_011255	GGT	2	6	28338	28343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288413
128	NC_011255	GAT	2	6	28350	28355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288413
129	NC_011255	AAT	2	6	28397	28402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288413
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132	NC_011255	TTG	2	6	28627	28632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288413
133	NC_011255	GTT	2	6	28655	28660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288413
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171	NC_011255	AAT	2	6	34399	34404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288415
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174	NC_011255	CAT	2	6	34574	34579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288415

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.