MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl35

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011255	TA	3	6	329	334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011255	AC	3	6	594	599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011255	TC	3	6	1244	1249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011255	CT	3	6	1689	1694	0 %	50 %	0 %	50 %	203288401
5	NC_011255	GT	3	6	2067	2072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011255	AC	3	6	2186	2191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011255	TA	3	6	2311	2316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011255	AT	3	6	2376	2381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011255	AG	3	6	3046	3051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011255	AT	4	8	3073	3080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011255	AT	3	6	3741	3746	50 %	50 %	0 %	0 %	203288402
12	NC_011255	TA	3	6	4506	4511	50 %	50 %	0 %	0 %	203288402
13	NC_011255	AT	3	6	4599	4604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011255	TC	3	6	4666	4671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011255	AT	3	6	5012	5017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011255	CT	5	10	5667	5676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011255	CT	3	6	5679	5684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011255	TC	3	6	5711	5716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011255	TA	3	6	5799	5804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011255	CT	3	6	5862	5867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011255	TC	3	6	5973	5978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011255	TA	3	6	6068	6073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011255	TC	3	6	6912	6917	0 %	50 %	0 %	50 %	203288403
24	NC_011255	AT	4	8	8184	8191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011255	CT	3	6	8388	8393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011255	TA	3	6	9112	9117	50 %	50 %	0 %	0 %	203288404
27	NC_011255	AT	3	6	9126	9131	50 %	50 %	0 %	0 %	203288404
28	NC_011255	TA	3	6	9303	9308	50 %	50 %	0 %	0 %	203288404
29	NC_011255	TA	4	8	9481	9488	50 %	50 %	0 %	0 %	203288404
30	NC_011255	TA	3	6	9718	9723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011255	AT	3	6	9738	9743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011255	TC	3	6	10371	10376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011255	AT	3	6	10550	10555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011255	TA	3	6	10901	10906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011255	AT	3	6	11225	11230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011255	TA	3	6	11417	11422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011255	AT	3	6	11449	11454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011255	TA	4	8	11522	11529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011255	AT	3	6	11641	11646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011255	AT	3	6	12077	12082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011255	TA	4	8	12674	12681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011255	AT	3	6	12964	12969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011255	CT	3	6	13345	13350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011255	TA	3	6	14088	14093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011255	TA	3	6	14452	14457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011255	AT	3	6	14615	14620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011255	TA	4	8	15609	15616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011255	AT	3	6	15990	15995	50 %	50 %	0 %	0 %	203288406
49	NC_011255	AG	4	8	16537	16544	50 %	0 %	50 %	0 %	203288407
50	NC_011255	AT	3	6	16559	16564	50 %	50 %	0 %	0 %	203288407
51	NC_011255	TA	3	6	16844	16849	50 %	50 %	0 %	0 %	203288407
52	NC_011255	AT	3	6	16940	16945	50 %	50 %	0 %	0 %	203288407
53	NC_011255	AT	3	6	17191	17196	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
54	NC_011255	TA	3	6	17371	17376	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
55	NC_011255	TA	3	6	17686	17691	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
56	NC_011255	AT	3	6	18397	18402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011255	AT	3	6	18433	18438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011255	AT	3	6	19926	19931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011255	AT	3	6	19992	19997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011255	TA	3	6	20102	20107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011255	TA	3	6	20215	20220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011255	TA	3	6	20798	20803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011255	AT	3	6	20816	20821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011255	AT	3	6	21247	21252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011255	AT	3	6	21264	21269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011255	AT	3	6	21454	21459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011255	TA	3	6	21486	21491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011255	AT	3	6	21678	21683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011255	TC	3	6	22175	22180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011255	TA	4	8	22310	22317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011255	AT	3	6	22381	22386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011255	GA	3	6	22394	22399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011255	TA	3	6	22568	22573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011255	TC	3	6	22699	22704	0 %	50 %	0 %	50 %	203288410
75	NC_011255	AT	3	6	23139	23144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011255	AT	3	6	23279	23284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011255	TA	3	6	23372	23377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011255	TA	3	6	23477	23482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011255	AG	3	6	24413	24418	50 %	0 %	50 %	0 %	203288411
80	NC_011255	GA	3	6	24434	24439	50 %	0 %	50 %	0 %	203288411
81	NC_011255	AT	4	8	24616	24623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011255	TA	3	6	25047	25052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011255	AT	3	6	25570	25575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011255	TA	3	6	25984	25989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011255	AG	3	6	26077	26082	50 %	0 %	50 %	0 %	203288412
86	NC_011255	GA	3	6	26616	26621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011255	TA	3	6	26687	26692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011255	AT	3	6	26825	26830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011255	AT	3	6	27416	27421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011255	GA	3	6	27747	27752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011255	CT	3	6	27872	27877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011255	TA	3	6	27904	27909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011255	TA	3	6	27919	27924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011255	AG	3	6	28039	28044	50 %	0 %	50 %	0 %	203288413
95	NC_011255	AG	3	6	28072	28077	50 %	0 %	50 %	0 %	203288413
96	NC_011255	AG	3	6	28792	28797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011255	CT	3	6	28814	28819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011255	CA	4	8	30280	30287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011255	AT	3	6	30376	30381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011255	GA	3	6	30722	30727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011255	TA	4	8	30788	30795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011255	CT	3	6	30850	30855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011255	TA	3	6	30882	30887	50 %	50 %	0 %	0 %	203288414
104	NC_011255	AT	3	6	31647	31652	50 %	50 %	0 %	0 %	203288414
105	NC_011255	TA	4	8	32312	32319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011255	TC	3	6	32341	32346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011255	TA	3	6	33077	33082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011255	TG	3	6	33201	33206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011255	AC	3	6	33321	33326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011255	AG	3	6	33699	33704	50 %	0 %	50 %	0 %	203288415
111	NC_011255	GA	3	6	34144	34149	50 %	0 %	50 %	0 %	203288415
112	NC_011255	GT	3	6	34794	34799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.