MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl42

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011254	TTATA	2	10	296	305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011254	CCTTC	2	10	3113	3122	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_011254	TTATT	2	10	3410	3419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011254	TTATT	2	10	11108	11117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011254	TAATT	2	10	13456	13465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011254	TAAAA	2	10	13927	13936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011254	TCTTT	2	10	14142	14151	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011254	ATTAT	2	10	14512	14521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011254	TCTAT	2	10	15378	15387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011254	TATAG	2	10	18865	18874	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011254	AATTA	2	10	19813	19822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011254	TTAAA	2	10	23474	23483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011254	TTAAA	2	10	23508	23517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011254	GAGAG	2	10	27912	27921	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011254	AGGGA	2	10	29884	29893	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011254	TGAAA	2	10	30379	30388	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011254	AGATA	2	10	30454	30463	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011254	ATAAA	2	10	32986	32995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011254	TTTTA	2	10	33042	33051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011254	TTTAT	2	10	33339	33348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011254	AAAAG	2	10	33534	33543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011254	GGAAG	2	10	36782	36791	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011254	AGTAA	2	10	39073	39082	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011254	TATAA	2	10	39581	39590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011254	AAGTA	2	10	39995	40004	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011254	TTGAT	2	10	41220	41229	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.