MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl42

Total Repeats: 320

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011254	ATT	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288731
2	NC_011254	TTG	2	6	835	840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288731
3	NC_011254	TCT	2	6	872	877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288731
4	NC_011254	CCT	2	6	906	911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288731
5	NC_011254	ATT	2	6	944	949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288731
6	NC_011254	TGC	2	6	979	984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288731
7	NC_011254	AGC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
8	NC_011254	CAT	2	6	1095	1100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
9	NC_011254	AGC	3	9	1135	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
10	NC_011254	CAG	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
11	NC_011254	CAG	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
12	NC_011254	TGC	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288731
13	NC_011254	CAG	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
14	NC_011254	ACA	2	6	1382	1387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288731
15	NC_011254	CAG	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
16	NC_011254	AGC	2	6	1444	1449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
17	NC_011254	CAG	3	9	1458	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
18	NC_011254	GCA	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
19	NC_011254	ATC	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
20	NC_011254	CTT	2	6	1521	1526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288731
21	NC_011254	CCA	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288731
22	NC_011254	CAT	3	9	1813	1821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
23	NC_011254	CAT	4	12	1825	1836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
24	NC_011254	ACT	2	6	1844	1849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
25	NC_011254	ATT	2	6	3438	3443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
26	NC_011254	ACT	2	6	3451	3456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288732
27	NC_011254	CTT	2	6	3510	3515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
28	NC_011254	CTT	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
29	NC_011254	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288732
30	NC_011254	AGC	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288732
31	NC_011254	ACC	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288732
32	NC_011254	CAC	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288732
33	NC_011254	CTT	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
34	NC_011254	CTC	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288732
35	NC_011254	TGC	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288732
36	NC_011254	CAT	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288732
37	NC_011254	CAG	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288732
38	NC_011254	TAA	2	6	3870	3875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288732
39	NC_011254	TTA	2	6	3935	3940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
40	NC_011254	CTA	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288732
41	NC_011254	TAT	2	6	4117	4122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
42	NC_011254	CAA	2	6	4206	4211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288732
43	NC_011254	TTA	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
44	NC_011254	CTT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
45	NC_011254	CTT	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
46	NC_011254	ACC	3	9	4445	4453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288732
47	NC_011254	CTT	2	6	5680	5685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288733
48	NC_011254	TTA	2	6	5691	5696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288733
49	NC_011254	TTA	2	6	5748	5753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288733
50	NC_011254	GCC	2	6	5769	5774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	203288733
51	NC_011254	AGC	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288733
52	NC_011254	CAT	3	9	5920	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288733
53	NC_011254	AGC	2	6	5930	5935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288733
54	NC_011254	ATT	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288733
55	NC_011254	TCA	2	6	6009	6014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288733
56	NC_011254	TAG	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288733
57	NC_011254	AAT	2	6	6143	6148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288733
58	NC_011254	CTT	2	6	6157	6162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288733
59	NC_011254	AAT	2	6	6164	6169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288733
60	NC_011254	GCA	3	9	6201	6209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288733
61	NC_011254	CAG	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288733
62	NC_011254	TAA	2	6	6313	6318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288733
63	NC_011254	TCT	2	6	6415	6420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288733
64	NC_011254	TTA	2	6	6538	6543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288733
65	NC_011254	CTC	2	6	6595	6600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288733
66	NC_011254	CAT	2	6	6614	6619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288733
67	NC_011254	CAT	4	12	6623	6634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288733
68	NC_011254	AAT	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288733
69	NC_011254	CAT	3	9	8166	8174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288734
70	NC_011254	ACT	2	6	8224	8229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288734
71	NC_011254	TAA	2	6	8236	8241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
72	NC_011254	TAA	2	6	8269	8274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
73	NC_011254	TTG	2	6	8310	8315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288734
74	NC_011254	ATC	2	6	8392	8397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288734
75	NC_011254	ATT	2	6	8438	8443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288734
76	NC_011254	ATA	2	6	8506	8511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
77	NC_011254	TAT	2	6	8547	8552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288734
78	NC_011254	CCA	2	6	8555	8560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288734
79	NC_011254	CTA	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288734
80	NC_011254	AAT	2	6	8614	8619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
81	NC_011254	CAT	2	6	8640	8645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288734
82	NC_011254	TAG	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288734
83	NC_011254	TCT	2	6	8708	8713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288734
84	NC_011254	TGT	2	6	8755	8760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288734
85	NC_011254	TTA	2	6	8786	8791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288734
86	NC_011254	AAT	2	6	8811	8816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
87	NC_011254	GAT	2	6	8823	8828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288734
88	NC_011254	ATA	2	6	8846	8851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
89	NC_011254	CTT	2	6	8883	8888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288734
90	NC_011254	GTT	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288734
91	NC_011254	CAG	2	6	8934	8939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288734
92	NC_011254	CAC	2	6	8979	8984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288734
93	NC_011254	ATA	2	6	9502	9507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288735
94	NC_011254	ATT	3	9	9562	9570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288735
95	NC_011254	TAC	2	6	9741	9746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288735
96	NC_011254	ATT	2	6	9784	9789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288735
97	NC_011254	TTC	2	6	9796	9801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288735
98	NC_011254	TTC	2	6	9823	9828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288735
99	NC_011254	ATT	2	6	9832	9837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288735
100	NC_011254	TCC	2	6	9928	9933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288735
101	NC_011254	ATC	2	6	9952	9957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288735
102	NC_011254	TAA	2	6	10217	10222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288736
103	NC_011254	CTA	2	6	10347	10352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288736
104	NC_011254	TAT	2	6	10395	10400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288736
105	NC_011254	ATA	2	6	10465	10470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288736
106	NC_011254	TAA	2	6	10556	10561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288736
107	NC_011254	TTA	2	6	10595	10600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288736
108	NC_011254	ATG	2	6	10612	10617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288736
109	NC_011254	TAC	2	6	10737	10742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288736
110	NC_011254	GAA	2	6	10752	10757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288736
111	NC_011254	TAT	2	6	12050	12055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288737
112	NC_011254	TTG	2	6	12056	12061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288737
113	NC_011254	ATT	2	6	12081	12086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288737
114	NC_011254	ATA	2	6	12243	12248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288737
115	NC_011254	ATT	3	9	12249	12257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288737
116	NC_011254	TAA	2	6	12301	12306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288737
117	NC_011254	AAC	2	6	12323	12328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288737
118	NC_011254	TAA	2	6	12345	12350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288737
119	NC_011254	TGT	2	6	12367	12372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288737
120	NC_011254	TTC	2	6	15785	15790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288738
121	NC_011254	TAA	2	6	15791	15796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288738
122	NC_011254	CTT	2	6	16111	16116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288738
123	NC_011254	TAA	2	6	16166	16171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288738
124	NC_011254	TTA	2	6	16221	16226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288738
125	NC_011254	TAA	2	6	16287	16292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288738
126	NC_011254	TTA	2	6	16330	16335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288739
127	NC_011254	TAA	2	6	16402	16407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288739
128	NC_011254	TAA	2	6	16507	16512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288739
129	NC_011254	TAA	2	6	16552	16557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288739
130	NC_011254	ACC	2	6	16606	16611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288739
131	NC_011254	CAA	2	6	16748	16753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288739
132	NC_011254	TAA	2	6	16877	16882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288739
133	NC_011254	TTC	2	6	16898	16903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288739
134	NC_011254	TAT	2	6	16906	16911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288739
135	NC_011254	TAA	2	6	16921	16926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288739
136	NC_011254	ACC	2	6	17033	17038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288739
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139	NC_011254	AAT	2	6	17426	17431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288740
140	NC_011254	CAT	2	6	17494	17499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288740
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142	NC_011254	TTC	2	6	17650	17655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288741
143	NC_011254	TCC	2	6	17674	17679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288741
144	NC_011254	TAA	2	6	17699	17704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288741
145	NC_011254	TTC	2	6	17798	17803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288741
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151	NC_011254	CTT	2	6	18015	18020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288741
152	NC_011254	TAC	2	6	18084	18089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288741
153	NC_011254	TCT	2	6	18119	18124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288741
154	NC_011254	TCT	2	6	18155	18160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288741
155	NC_011254	TGT	2	6	18163	18168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288741
156	NC_011254	ATC	2	6	18196	18201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288741
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159	NC_011254	ATT	2	6	18313	18318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288741
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161	NC_011254	GTT	2	6	18351	18356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288741
162	NC_011254	GTA	2	6	18472	18477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288741
163	NC_011254	TTA	3	9	18569	18577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288741
164	NC_011254	AGT	2	6	18579	18584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288741
165	NC_011254	TTG	2	6	18671	18676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288741
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167	NC_011254	TTA	2	6	20356	20361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288742
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169	NC_011254	ATT	2	6	20399	20404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288742
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171	NC_011254	TTA	2	6	20457	20462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288742
172	NC_011254	AAT	2	6	20620	20625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288742
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240	NC_011254	AGT	2	6	31887	31892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288747
241	NC_011254	TGA	3	9	31904	31912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288747
242	NC_011254	TGA	2	6	31916	31921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288747
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244	NC_011254	CAT	2	6	32021	32026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288747
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247	NC_011254	AAG	2	6	32098	32103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288747
248	NC_011254	TTG	2	6	32147	32152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288747
249	NC_011254	GAA	2	6	32160	32165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288747
250	NC_011254	GAA	2	6	32205	32210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288747
251	NC_011254	GTA	2	6	32383	32388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288747
252	NC_011254	GAT	2	6	32437	32442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288747
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254	NC_011254	TAA	3	9	32511	32519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288747
255	NC_011254	TGC	4	12	32529	32540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288747
256	NC_011254	AGC	2	6	32547	32552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288747
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258	NC_011254	TGT	2	6	32658	32663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288747
259	NC_011254	TAA	3	9	32667	32675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288747
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263	NC_011254	TGA	2	6	32868	32873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288747
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.