MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl33

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011253	ATAAA	2	10	270	279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011253	ATACT	2	10	2001	2010	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011253	ATTTA	2	10	2334	2343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011253	AAATT	2	10	3261	3270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011253	TACAT	2	10	4703	4712	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011253	TATAT	2	10	4749	4758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011253	TTATC	2	10	5632	5641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011253	ATTTA	2	10	6097	6106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011253	TCTTA	2	10	6584	6593	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011253	TATAA	2	10	7555	7564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011253	TTATT	2	10	11248	11257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011253	ACTAA	2	10	11674	11683	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011253	CTTAA	2	10	12519	12528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011253	GATAA	2	10	12576	12585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011253	ATTTA	2	10	12948	12957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011253	ATTTA	2	10	15544	15553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011253	AATTA	2	10	16660	16669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011253	AAGGA	2	10	16796	16805	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011253	AGGTA	2	10	16929	16938	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011253	TATAA	2	10	18265	18274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011253	GTATT	2	10	18336	18345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011253	TTACA	2	10	20083	20092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011253	TTAAA	2	10	21253	21262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011253	TAGAA	2	10	23875	23884	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011253	GAAGG	2	10	23981	23990	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011253	AGGAG	2	10	25231	25240	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011253	TTACT	2	10	28777	28786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011253	TTTTA	2	10	32042	32051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011253	AAATG	2	10	32503	32512	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.