MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl33

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011253	TAAA	3	12	276	287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011253	TAAT	2	8	916	923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011253	TTAG	2	8	2153	2160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011253	ATTC	2	8	2728	2735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011253	AATA	2	8	2800	2807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011253	ATTT	2	8	3583	3590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011253	CTTG	2	8	3606	3613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011253	ACCA	2	8	3812	3819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011253	CATT	2	8	4204	4211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011253	TAAA	2	8	4248	4255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011253	CTAG	2	8	4346	4353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011253	CTTA	2	8	4388	4395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011253	TGAT	2	8	4634	4641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011253	TCTT	2	8	4904	4911	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011253	TCTT	2	8	5062	5069	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011253	ACTC	2	8	5874	5881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011253	AATT	2	8	6075	6082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011253	TTCC	2	8	6151	6158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011253	AAAT	2	8	6176	6183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011253	TAAA	2	8	6244	6251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011253	TAAT	2	8	6520	6527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011253	AATT	2	8	6915	6922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011253	ATAA	2	8	7483	7490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011253	ATTA	2	8	7491	7498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011253	TATC	2	8	7987	7994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011253	TATC	2	8	8053	8060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011253	TAAT	2	8	8261	8268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011253	ATTA	2	8	8299	8306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011253	AAAT	2	8	8398	8405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011253	TAAT	2	8	8411	8418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011253	AAAT	2	8	8426	8433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011253	AGCT	2	8	11936	11943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011253	TGAT	2	8	11975	11982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011253	TAAA	2	8	12370	12377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011253	ATGG	2	8	12408	12415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011253	TTTC	2	8	12474	12481	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011253	GCAA	2	8	12618	12625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011253	TAAG	2	8	12645	12652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011253	AAAG	2	8	12655	12662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011253	AGAT	2	8	12907	12914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011253	ATTT	2	8	13000	13007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011253	GATT	2	8	13264	13271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011253	CTTT	2	8	14979	14986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011253	AGAA	2	8	15258	15265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011253	TAAT	2	8	15554	15561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011253	AAAT	2	8	15746	15753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011253	AGGT	2	8	18960	18967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011253	AAAG	2	8	19015	19022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011253	AGGG	2	8	19311	19318	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011253	AAAT	2	8	19468	19475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011253	TTAT	2	8	19649	19656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011253	AATT	2	8	20032	20039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011253	GTAA	2	8	21056	21063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011253	TTAA	2	8	21090	21097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011253	AATA	2	8	21342	21349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011253	TTAT	2	8	21630	21637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011253	ATAA	2	8	23568	23575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011253	TAAT	2	8	23621	23628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011253	ATTT	2	8	23751	23758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011253	GGAT	2	8	23886	23893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011253	AGCT	2	8	24548	24555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011253	TGAT	2	8	24587	24594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011253	TAAA	2	8	24969	24976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011253	ATTG	2	8	25075	25082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011253	GAAA	2	8	25455	25462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011253	ATAA	2	8	26303	26310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011253	CAAT	2	8	27371	27378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011253	AGTA	2	8	27530	27537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011253	AATT	2	8	27596	27603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011253	AAAC	2	8	27737	27744	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011253	AAGA	2	8	27797	27804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011253	GTAA	2	8	28517	28524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011253	TAAA	2	8	28766	28773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011253	TAAA	2	8	28949	28956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011253	AAAG	2	8	29235	29242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011253	GAGT	2	8	29684	29691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011253	TAAA	2	8	29696	29703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011253	AATA	2	8	31991	31998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011253	AATT	2	8	32642	32649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011253	TTAG	2	8	32706	32713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011253	AGTA	2	8	33131	33138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.