MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl33

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011253	CT	3	6	803	808	0 %	50 %	0 %	50 %	203288383
2	NC_011253	TA	3	6	1483	1488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011253	AT	3	6	1604	1609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011253	TA	3	6	1627	1632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011253	TC	3	6	2053	2058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011253	TA	3	6	2241	2246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011253	TC	3	6	3040	3045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011253	AC	4	8	3308	3315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011253	AT	3	6	3448	3453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011253	TC	3	6	4005	4010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011253	TA	4	8	4256	4263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011253	CA	3	6	4648	4653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011253	TA	3	6	4952	4957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011253	AT	3	6	5311	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011253	TA	3	6	6161	6166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011253	CT	3	6	6810	6815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011253	AT	3	6	7409	7414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011253	TA	5	10	7567	7576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011253	TA	3	6	7673	7678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011253	AT	3	6	7740	7745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011253	TA	3	6	8308	8313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011253	TA	4	8	8331	8338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011253	AC	3	6	8582	8587	50 %	0 %	0 %	50 %	203288386
24	NC_011253	AT	3	6	8917	8922	50 %	50 %	0 %	0 %	203288386
25	NC_011253	AT	3	6	9317	9322	50 %	50 %	0 %	0 %	203288387
26	NC_011253	GA	3	6	9367	9372	50 %	0 %	50 %	0 %	203288387
27	NC_011253	AT	3	6	9560	9565	50 %	50 %	0 %	0 %	203288387
28	NC_011253	TA	3	6	9614	9619	50 %	50 %	0 %	0 %	203288387
29	NC_011253	TA	3	6	10201	10206	50 %	50 %	0 %	0 %	203288388
30	NC_011253	AC	3	6	10328	10333	50 %	0 %	0 %	50 %	203288388
31	NC_011253	AT	3	6	10350	10355	50 %	50 %	0 %	0 %	203288388
32	NC_011253	AG	3	6	10364	10369	50 %	0 %	50 %	0 %	203288388
33	NC_011253	GA	4	8	10390	10397	50 %	0 %	50 %	0 %	203288388
34	NC_011253	TA	3	6	10450	10455	50 %	50 %	0 %	0 %	203288388
35	NC_011253	AT	3	6	10846	10851	50 %	50 %	0 %	0 %	203288389
36	NC_011253	AG	3	6	11347	11352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011253	TA	3	6	12529	12534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011253	TA	3	6	12560	12565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011253	TG	3	6	13845	13850	0 %	50 %	50 %	0 %	203288390
40	NC_011253	AT	3	6	13976	13981	50 %	50 %	0 %	0 %	203288390
41	NC_011253	TA	3	6	14314	14319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011253	AT	3	6	14386	14391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011253	TA	4	8	15269	15276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011253	AT	4	8	15709	15716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011253	AT	3	6	15733	15738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011253	GA	3	6	16205	16210	50 %	0 %	50 %	0 %	203288392
47	NC_011253	TG	3	6	16722	16727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011253	CT	3	6	17079	17084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011253	TA	3	6	17111	17116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011253	AG	4	8	17198	17205	50 %	0 %	50 %	0 %	203288393
51	NC_011253	AT	3	6	17852	17857	50 %	50 %	0 %	0 %	203288393
52	NC_011253	GA	3	6	18194	18199	50 %	0 %	50 %	0 %	203288393
53	NC_011253	CT	3	6	18317	18322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011253	TA	3	6	18366	18371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011253	AG	3	6	18486	18491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011253	AG	4	8	18496	18503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011253	AG	4	8	18673	18680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011253	TC	3	6	18975	18980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011253	GA	3	6	19179	19184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011253	AG	3	6	19628	19633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011253	CT	3	6	19643	19648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011253	TA	3	6	20045	20050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011253	AT	3	6	20191	20196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011253	TC	3	6	20331	20336	0 %	50 %	0 %	50 %	203288394
65	NC_011253	TG	3	6	20424	20429	0 %	50 %	50 %	0 %	203288394
66	NC_011253	TA	3	6	20531	20536	50 %	50 %	0 %	0 %	203288394
67	NC_011253	TA	3	6	20612	20617	50 %	50 %	0 %	0 %	203288394
68	NC_011253	TG	3	6	20785	20790	0 %	50 %	50 %	0 %	203288394
69	NC_011253	AT	3	6	20942	20947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011253	AT	3	6	20968	20973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011253	AG	3	6	22602	22607	50 %	0 %	50 %	0 %	203288395
72	NC_011253	TA	3	6	23489	23494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011253	GA	3	6	23584	23589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011253	AT	3	6	23639	23644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011253	AG	3	6	23693	23698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011253	CT	3	6	23707	23712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011253	AG	3	6	23829	23834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011253	AG	3	6	23865	23870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011253	AG	3	6	25247	25252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011253	TA	3	6	26429	26434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011253	AT	3	6	26567	26572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011253	AT	3	6	27155	27160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011253	CT	3	6	27637	27642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011253	TA	3	6	27669	27674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011253	AG	3	6	27787	27792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011253	GA	3	6	27811	27816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011253	GA	3	6	27955	27960	50 %	0 %	50 %	0 %	203288397
88	NC_011253	GA	3	6	28334	28339	50 %	0 %	50 %	0 %	203288397
89	NC_011253	AT	3	6	28487	28492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011253	TA	3	6	29819	29824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011253	AG	3	6	29856	29861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011253	CT	3	6	29870	29875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011253	TA	3	6	29903	29908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011253	AG	3	6	30311	30316	50 %	0 %	50 %	0 %	203288398
95	NC_011253	GA	3	6	31041	31046	50 %	0 %	50 %	0 %	203288398
96	NC_011253	AG	3	6	31136	31141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011253	CT	3	6	31153	31158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011253	AG	3	6	31256	31261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011253	AG	3	6	31289	31294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011253	AG	4	8	31299	31306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011253	AG	5	10	31310	31319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011253	GT	3	6	32054	32059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011253	AT	3	6	32069	32074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011253	AT	3	6	32231	32236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011253	AT	3	6	32318	32323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011253	TA	3	6	32349	32354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.