MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl33

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011253	A	6	6	146	151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011253	A	6	6	158	163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011253	T	6	6	795	800	0 %	100 %	0 %	0 %	203288383
4	NC_011253	A	6	6	963	968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011253	A	7	7	1074	1080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011253	T	6	6	1110	1115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011253	T	6	6	1117	1122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011253	T	6	6	1250	1255	0 %	100 %	0 %	0 %	203288384
9	NC_011253	A	6	6	1611	1616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011253	T	6	6	1765	1770	0 %	100 %	0 %	0 %	203288385
11	NC_011253	T	8	8	1941	1948	0 %	100 %	0 %	0 %	203288385
12	NC_011253	A	6	6	2129	2134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011253	T	6	6	2599	2604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011253	T	7	7	3090	3096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011253	T	7	7	3709	3715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011253	T	7	7	3971	3977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011253	T	6	6	4781	4786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011253	A	7	7	4829	4835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011253	T	7	7	4929	4935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011253	T	8	8	5131	5138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011253	T	6	6	5363	5368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011253	A	7	7	5844	5850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011253	T	6	6	6278	6283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011253	T	7	7	6900	6906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011253	T	8	8	6956	6963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011253	A	6	6	7091	7096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011253	T	6	6	7518	7523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011253	A	7	7	7589	7595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011253	A	6	6	7597	7602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011253	A	7	7	7762	7768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011253	A	7	7	8467	8473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011253	A	6	6	8567	8572	100 %	0 %	0 %	0 %	203288386
33	NC_011253	A	6	6	8595	8600	100 %	0 %	0 %	0 %	203288386
34	NC_011253	A	6	6	8786	8791	100 %	0 %	0 %	0 %	203288386
35	NC_011253	A	8	8	8942	8949	100 %	0 %	0 %	0 %	203288386
36	NC_011253	A	6	6	9133	9138	100 %	0 %	0 %	0 %	203288386
37	NC_011253	A	7	7	9165	9171	100 %	0 %	0 %	0 %	203288386
38	NC_011253	A	6	6	9220	9225	100 %	0 %	0 %	0 %	203288387
39	NC_011253	A	9	9	9262	9270	100 %	0 %	0 %	0 %	203288387
40	NC_011253	T	6	6	9383	9388	0 %	100 %	0 %	0 %	203288387
41	NC_011253	A	7	7	9419	9425	100 %	0 %	0 %	0 %	203288387
42	NC_011253	A	7	7	9535	9541	100 %	0 %	0 %	0 %	203288387
43	NC_011253	T	6	6	9606	9611	0 %	100 %	0 %	0 %	203288387
44	NC_011253	A	7	7	9640	9646	100 %	0 %	0 %	0 %	203288387
45	NC_011253	A	7	7	9658	9664	100 %	0 %	0 %	0 %	203288387
46	NC_011253	A	7	7	9768	9774	100 %	0 %	0 %	0 %	203288387
47	NC_011253	A	6	6	9855	9860	100 %	0 %	0 %	0 %	203288388
48	NC_011253	T	6	6	10482	10487	0 %	100 %	0 %	0 %	203288388
49	NC_011253	A	6	6	10888	10893	100 %	0 %	0 %	0 %	203288389
50	NC_011253	A	8	8	10912	10919	100 %	0 %	0 %	0 %	203288389
51	NC_011253	T	7	7	11025	11031	0 %	100 %	0 %	0 %	203288389
52	NC_011253	A	6	6	11090	11095	100 %	0 %	0 %	0 %	203288389
53	NC_011253	T	7	7	11264	11270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011253	A	8	8	11598	11605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011253	A	6	6	11988	11993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011253	A	6	6	12355	12360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011253	A	6	6	12375	12380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011253	T	7	7	12421	12427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011253	T	7	7	12429	12435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011253	A	6	6	12786	12791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011253	T	7	7	13193	13199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011253	T	6	6	13203	13208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011253	A	8	8	13309	13316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011253	A	6	6	13342	13347	100 %	0 %	0 %	0 %	203288390
65	NC_011253	A	7	7	13593	13599	100 %	0 %	0 %	0 %	203288390
66	NC_011253	T	6	6	13793	13798	0 %	100 %	0 %	0 %	203288390
67	NC_011253	A	7	7	14119	14125	100 %	0 %	0 %	0 %	203288390
68	NC_011253	A	6	6	14223	14228	100 %	0 %	0 %	0 %	203288390
69	NC_011253	A	7	7	14292	14298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011253	T	6	6	14411	14416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011253	A	6	6	14418	14423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011253	T	6	6	14430	14435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011253	A	6	6	14547	14552	100 %	0 %	0 %	0 %	203288391
74	NC_011253	A	8	8	14674	14681	100 %	0 %	0 %	0 %	203288391
75	NC_011253	A	7	7	14787	14793	100 %	0 %	0 %	0 %	203288391
76	NC_011253	T	9	9	14801	14809	0 %	100 %	0 %	0 %	203288391
77	NC_011253	A	6	6	14987	14992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011253	T	7	7	15002	15008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011253	T	7	7	15019	15025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011253	A	6	6	15105	15110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011253	A	6	6	15493	15498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011253	T	7	7	15613	15619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011253	T	6	6	15844	15849	0 %	100 %	0 %	0 %	203288392
84	NC_011253	T	7	7	15958	15964	0 %	100 %	0 %	0 %	203288392
85	NC_011253	T	7	7	16703	16709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011253	T	7	7	17084	17090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011253	T	6	6	17133	17138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011253	A	8	8	17158	17165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011253	A	8	8	17170	17177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011253	A	6	6	17206	17211	100 %	0 %	0 %	0 %	203288393
91	NC_011253	T	7	7	18322	18328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011253	A	6	6	18408	18413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011253	A	7	7	18426	18432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011253	A	6	6	18862	18867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011253	T	8	8	19718	19725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011253	T	8	8	19768	19775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011253	T	6	6	20272	20277	0 %	100 %	0 %	0 %	203288394
98	NC_011253	T	6	6	20279	20284	0 %	100 %	0 %	0 %	203288394
99	NC_011253	T	7	7	20952	20958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011253	T	6	6	20991	20996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011253	T	8	8	21017	21024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011253	T	6	6	21042	21047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011253	T	6	6	21320	21325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011253	T	8	8	23360	23367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011253	T	6	6	23372	23377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011253	T	6	6	23385	23390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011253	T	7	7	23712	23718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011253	T	6	6	23760	23765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011253	A	7	7	23786	23792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011253	A	6	6	23802	23807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011253	A	6	6	23836	23841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011253	T	6	6	24013	24018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011253	A	6	6	24600	24605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011253	T	6	6	25045	25050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011253	T	6	6	25083	25088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011253	T	6	6	25121	25126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011253	T	7	7	25136	25142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011253	A	6	6	25585	25590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011253	T	7	7	26279	26285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011253	T	6	6	26290	26295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011253	T	6	6	26417	26422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011253	A	7	7	26709	26715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011253	A	6	6	26747	26752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011253	A	6	6	26875	26880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011253	A	6	6	27009	27014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011253	A	6	6	27456	27461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011253	T	7	7	27642	27648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011253	T	8	8	27706	27713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011253	T	6	6	28502	28507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011253	A	6	6	29720	29725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011253	T	6	6	29875	29880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011253	T	6	6	29926	29931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011253	A	8	8	29951	29958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011253	A	7	7	30046	30052	100 %	0 %	0 %	0 %	203288398
135	NC_011253	T	8	8	31158	31165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011253	T	6	6	31187	31192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011253	A	6	6	31228	31233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011253	A	6	6	31764	31769	100 %	0 %	0 %	0 %	203288399
139	NC_011253	A	6	6	32163	32168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011253	A	7	7	32170	32176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011253	T	7	7	32289	32295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011253	A	6	6	32957	32962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011253	A	6	6	33191	33196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.