MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	AACAA	2	10	490	499	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011252	ATTAA	2	10	997	1006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011252	AAATT	2	10	2394	2403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011252	ATCCC	2	10	2644	2653	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_011252	TTACC	2	10	2692	2701	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011252	TATAA	2	10	4271	4280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011252	ATCTT	2	10	4336	4345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011252	ATTCA	2	10	4720	4729	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011252	TTAGC	2	10	5068	5077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011252	CTATA	2	10	5225	5234	40 %	40 %	0 %	20 %	203288365
11	NC_011252	AATTA	2	10	7569	7578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011252	ACTAT	2	10	8547	8556	40 %	40 %	0 %	20 %	203288368
13	NC_011252	AACAA	2	10	11174	11183	80 %	0 %	0 %	20 %	203288370
14	NC_011252	ATTTC	2	10	12787	12796	20 %	60 %	0 %	20 %	203288371
15	NC_011252	TTTTA	2	10	13087	13096	20 %	80 %	0 %	0 %	203288372
16	NC_011252	TTGAA	2	10	13384	13393	40 %	40 %	20 %	0 %	203288372
17	NC_011252	AATTA	2	10	14231	14240	60 %	40 %	0 %	0 %	203288373
18	NC_011252	TTATC	2	10	15687	15696	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011252	ACTTT	2	10	15849	15858	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011252	AGTTA	2	10	16529	16538	40 %	40 %	20 %	0 %	203288375
21	NC_011252	AAGAG	2	10	18322	18331	60 %	0 %	40 %	0 %	203288378
22	NC_011252	AGTGA	2	10	20676	20685	40 %	20 %	40 %	0 %	203288380
23	NC_011252	TTAAT	2	10	21713	21722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011252	GATAA	2	10	21756	21765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011252	GATTA	2	10	21870	21879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.