MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	AAAG	2	8	77	84	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011252	TTAA	2	8	629	636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011252	ATCC	2	8	688	695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011252	ATCA	2	8	743	750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011252	ATTA	2	8	1110	1117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011252	CATA	2	8	1491	1498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011252	CAAA	2	8	1510	1517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011252	CATA	2	8	1583	1590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011252	ATTA	2	8	1623	1630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011252	TCAT	2	8	3335	3342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011252	TAAA	2	8	3462	3469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011252	TAAT	2	8	3510	3517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011252	ATTA	2	8	4092	4099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011252	TAAT	2	8	4591	4598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011252	TAAT	2	8	4892	4899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011252	ATCA	2	8	5036	5043	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011252	ATAA	2	8	5404	5411	75 %	25 %	0 %	0 %	203288365
18	NC_011252	CCTC	2	8	5446	5453	0 %	25 %	0 %	75 %	203288365
19	NC_011252	GTAG	2	8	5478	5485	25 %	25 %	50 %	0 %	203288365
20	NC_011252	AAAT	2	8	5628	5635	75 %	25 %	0 %	0 %	203288365
21	NC_011252	AAAT	2	8	5648	5655	75 %	25 %	0 %	0 %	203288365
22	NC_011252	GTAA	2	8	5902	5909	50 %	25 %	25 %	0 %	203288365
23	NC_011252	CCAA	2	8	5938	5945	50 %	0 %	0 %	50 %	203288365
24	NC_011252	AATA	2	8	5997	6004	75 %	25 %	0 %	0 %	203288365
25	NC_011252	ATTC	2	8	6144	6151	25 %	50 %	0 %	25 %	203288365
26	NC_011252	TAAA	2	8	6762	6769	75 %	25 %	0 %	0 %	203288366
27	NC_011252	TGAA	2	8	7612	7619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011252	TATT	2	8	7656	7663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011252	CAAA	2	8	8166	8173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011252	TAGA	2	8	8174	8181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011252	AGCA	2	8	8271	8278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011252	TAAA	2	8	8921	8928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011252	AATC	2	8	8960	8967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011252	TTAT	2	8	9125	9132	25 %	75 %	0 %	0 %	203288369
35	NC_011252	AATA	2	8	9313	9320	75 %	25 %	0 %	0 %	203288369
36	NC_011252	ATAA	2	8	9872	9879	75 %	25 %	0 %	0 %	203288369
37	NC_011252	TAAT	3	12	10231	10242	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
38	NC_011252	ATTA	2	8	10272	10279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011252	AATT	2	8	10280	10287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011252	GATA	2	8	10529	10536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011252	CATA	2	8	10770	10777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011252	ATTT	2	8	10953	10960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011252	AGGG	2	8	11040	11047	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011252	ATGC	2	8	11231	11238	25 %	25 %	25 %	25 %	203288370
45	NC_011252	CTAC	2	8	11603	11610	25 %	25 %	0 %	50 %	203288370
46	NC_011252	CATT	2	8	11703	11710	25 %	50 %	0 %	25 %	203288370
47	NC_011252	ATTT	2	8	12563	12570	25 %	75 %	0 %	0 %	203288370
48	NC_011252	AACA	2	8	12921	12928	75 %	0 %	0 %	25 %	203288371
49	NC_011252	TTAC	2	8	13121	13128	25 %	50 %	0 %	25 %	203288372
50	NC_011252	AAAT	2	8	13284	13291	75 %	25 %	0 %	0 %	203288372
51	NC_011252	TAAA	2	8	13535	13542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011252	GTAT	2	8	13842	13849	25 %	50 %	25 %	0 %	203288373
53	NC_011252	AAAT	2	8	14043	14050	75 %	25 %	0 %	0 %	203288373
54	NC_011252	CTTT	2	8	14245	14252	0 %	75 %	0 %	25 %	203288373
55	NC_011252	ATTT	2	8	14423	14430	25 %	75 %	0 %	0 %	203288373
56	NC_011252	AAAC	2	8	14516	14523	75 %	0 %	0 %	25 %	203288373
57	NC_011252	ATTT	2	8	14758	14765	25 %	75 %	0 %	0 %	203288373
58	NC_011252	AGCA	2	8	14795	14802	50 %	0 %	25 %	25 %	203288373
59	NC_011252	TTAA	2	8	15869	15876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011252	AAGT	2	8	16808	16815	50 %	25 %	25 %	0 %	203288375
61	NC_011252	AGAA	2	8	17364	17371	75 %	0 %	25 %	0 %	203288376
62	NC_011252	GAAA	2	8	17748	17755	75 %	0 %	25 %	0 %	203288377
63	NC_011252	TAAC	2	8	17975	17982	50 %	25 %	0 %	25 %	203288377
64	NC_011252	ATAG	2	8	18001	18008	50 %	25 %	25 %	0 %	203288377
65	NC_011252	AGAT	2	8	18769	18776	50 %	25 %	25 %	0 %	203288378
66	NC_011252	TTAA	2	8	18832	18839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011252	TTTA	2	8	18866	18873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011252	TAAA	3	12	19148	19159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011252	TTTA	2	8	19399	19406	25 %	75 %	0 %	0 %	203288379
70	NC_011252	GTTT	2	8	19511	19518	0 %	75 %	25 %	0 %	203288379
71	NC_011252	TTTA	2	8	19606	19613	25 %	75 %	0 %	0 %	203288379
72	NC_011252	AGTA	2	8	19903	19910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011252	TTAG	2	8	19967	19974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011252	TATG	2	8	20047	20054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011252	TAAA	2	8	20184	20191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011252	AGGA	2	8	20392	20399	50 %	0 %	50 %	0 %	203288380
77	NC_011252	GAAT	2	8	20450	20457	50 %	25 %	25 %	0 %	203288380
78	NC_011252	GAAA	2	8	20828	20835	75 %	0 %	25 %	0 %	203288380
79	NC_011252	TGAT	2	8	21001	21008	25 %	50 %	25 %	0 %	203288380
80	NC_011252	TAAA	2	8	21380	21387	75 %	25 %	0 %	0 %	203288380
81	NC_011252	AGTA	2	8	21735	21742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011252	ATAA	2	8	21748	21755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011252	TGAT	2	8	21960	21967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011252	ATTT	2	8	22016	22023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011252	AATA	2	8	22321	22328	75 %	25 %	0 %	0 %	203288381
86	NC_011252	AAAT	2	8	22425	22432	75 %	25 %	0 %	0 %	203288381
87	NC_011252	GTAA	2	8	22499	22506	50 %	25 %	25 %	0 %	203288381
88	NC_011252	ATTT	2	8	22658	22665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011252	TAAA	2	8	22758	22765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.