MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	ATAA	2	8	5404	5411	75 %	25 %	0 %	0 %	203288365
2	NC_011252	CCTC	2	8	5446	5453	0 %	25 %	0 %	75 %	203288365
3	NC_011252	GTAG	2	8	5478	5485	25 %	25 %	50 %	0 %	203288365
4	NC_011252	AAAT	2	8	5628	5635	75 %	25 %	0 %	0 %	203288365
5	NC_011252	AAAT	2	8	5648	5655	75 %	25 %	0 %	0 %	203288365
6	NC_011252	GTAA	2	8	5902	5909	50 %	25 %	25 %	0 %	203288365
7	NC_011252	CCAA	2	8	5938	5945	50 %	0 %	0 %	50 %	203288365
8	NC_011252	AATA	2	8	5997	6004	75 %	25 %	0 %	0 %	203288365
9	NC_011252	ATTC	2	8	6144	6151	25 %	50 %	0 %	25 %	203288365
10	NC_011252	TAAA	2	8	6762	6769	75 %	25 %	0 %	0 %	203288366
11	NC_011252	TTAT	2	8	9125	9132	25 %	75 %	0 %	0 %	203288369
12	NC_011252	AATA	2	8	9313	9320	75 %	25 %	0 %	0 %	203288369
13	NC_011252	ATAA	2	8	9872	9879	75 %	25 %	0 %	0 %	203288369
14	NC_011252	TAAT	3	12	10231	10242	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
15	NC_011252	ATGC	2	8	11231	11238	25 %	25 %	25 %	25 %	203288370
16	NC_011252	CTAC	2	8	11603	11610	25 %	25 %	0 %	50 %	203288370
17	NC_011252	CATT	2	8	11703	11710	25 %	50 %	0 %	25 %	203288370
18	NC_011252	ATTT	2	8	12563	12570	25 %	75 %	0 %	0 %	203288370
19	NC_011252	AACA	2	8	12921	12928	75 %	0 %	0 %	25 %	203288371
20	NC_011252	TTAC	2	8	13121	13128	25 %	50 %	0 %	25 %	203288372
21	NC_011252	AAAT	2	8	13284	13291	75 %	25 %	0 %	0 %	203288372
22	NC_011252	GTAT	2	8	13842	13849	25 %	50 %	25 %	0 %	203288373
23	NC_011252	AAAT	2	8	14043	14050	75 %	25 %	0 %	0 %	203288373
24	NC_011252	CTTT	2	8	14245	14252	0 %	75 %	0 %	25 %	203288373
25	NC_011252	ATTT	2	8	14423	14430	25 %	75 %	0 %	0 %	203288373
26	NC_011252	AAAC	2	8	14516	14523	75 %	0 %	0 %	25 %	203288373
27	NC_011252	ATTT	2	8	14758	14765	25 %	75 %	0 %	0 %	203288373
28	NC_011252	AGCA	2	8	14795	14802	50 %	0 %	25 %	25 %	203288373
29	NC_011252	AAGT	2	8	16808	16815	50 %	25 %	25 %	0 %	203288375
30	NC_011252	AGAA	2	8	17364	17371	75 %	0 %	25 %	0 %	203288376
31	NC_011252	GAAA	2	8	17748	17755	75 %	0 %	25 %	0 %	203288377
32	NC_011252	TAAC	2	8	17975	17982	50 %	25 %	0 %	25 %	203288377
33	NC_011252	ATAG	2	8	18001	18008	50 %	25 %	25 %	0 %	203288377
34	NC_011252	AGAT	2	8	18769	18776	50 %	25 %	25 %	0 %	203288378
35	NC_011252	TTTA	2	8	19399	19406	25 %	75 %	0 %	0 %	203288379
36	NC_011252	GTTT	2	8	19511	19518	0 %	75 %	25 %	0 %	203288379
37	NC_011252	TTTA	2	8	19606	19613	25 %	75 %	0 %	0 %	203288379
38	NC_011252	AGGA	2	8	20392	20399	50 %	0 %	50 %	0 %	203288380
39	NC_011252	GAAT	2	8	20450	20457	50 %	25 %	25 %	0 %	203288380
40	NC_011252	GAAA	2	8	20828	20835	75 %	0 %	25 %	0 %	203288380
41	NC_011252	TGAT	2	8	21001	21008	25 %	50 %	25 %	0 %	203288380
42	NC_011252	TAAA	2	8	21380	21387	75 %	25 %	0 %	0 %	203288380
43	NC_011252	AATA	2	8	22321	22328	75 %	25 %	0 %	0 %	203288381
44	NC_011252	AAAT	2	8	22425	22432	75 %	25 %	0 %	0 %	203288381
45	NC_011252	GTAA	2	8	22499	22506	50 %	25 %	25 %	0 %	203288381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.