MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	TAA	2	6	20	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011252	AGA	2	6	62	67	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011252	TCT	2	6	68	73	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011252	CTG	2	6	87	92	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011252	TGT	2	6	106	111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011252	TAT	2	6	147	152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011252	AAC	2	6	155	160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011252	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011252	ATT	2	6	238	243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011252	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011252	ATA	2	6	288	293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011252	CAT	2	6	310	315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011252	AAC	2	6	355	360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011252	ATT	2	6	380	385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011252	TAT	3	9	413	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011252	AAT	2	6	423	428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011252	CAT	2	6	446	451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011252	TAT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011252	TAT	2	6	471	476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011252	CAC	2	6	704	709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011252	TAA	2	6	838	843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011252	TTA	2	6	913	918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011252	TAT	3	9	1028	1036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011252	ATT	2	6	1126	1131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011252	TTG	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011252	TAA	2	6	1221	1226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011252	TAA	2	6	1270	1275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011252	ACA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011252	TCA	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011252	TAA	2	6	1347	1352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011252	ATT	2	6	1470	1475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011252	GAA	2	6	1546	1551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011252	CAG	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011252	AAC	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011252	CAA	2	6	1646	1651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011252	GTT	2	6	1718	1723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011252	AAT	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011252	CAA	2	6	1790	1795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011252	TAT	2	6	1796	1801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011252	AAG	2	6	1929	1934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011252	TAA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011252	ATC	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011252	CAT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011252	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011252	ACA	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011252	AAT	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011252	CAT	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011252	TCC	2	6	2243	2248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011252	ACA	2	6	2272	2277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011252	AAT	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011252	TAC	2	6	2310	2315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011252	ATT	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011252	TAA	2	6	2477	2482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011252	ATA	2	6	2498	2503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011252	CAT	2	6	2551	2556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011252	ATG	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011252	ATA	2	6	2682	2687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011252	AGC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011252	ATC	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011252	GCA	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011252	ACC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011252	ATG	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011252	CAT	2	6	3010	3015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011252	TTG	2	6	3058	3063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011252	CTT	2	6	3133	3138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011252	TAG	2	6	3214	3219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011252	CAA	3	9	3238	3246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011252	TTC	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011252	TTA	2	6	3402	3407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011252	TCA	2	6	3428	3433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011252	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011252	TAT	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011252	TTA	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011252	TAA	2	6	3690	3695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011252	GAT	2	6	3717	3722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011252	GAT	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011252	CAT	2	6	3948	3953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011252	CTT	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011252	ATT	2	6	3990	3995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011252	ATT	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011252	TCG	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011252	AGA	2	6	4050	4055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011252	TGA	2	6	4104	4109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011252	ATT	2	6	4281	4286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011252	TAT	2	6	4359	4364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011252	TAA	2	6	4479	4484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011252	TCC	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011252	ATG	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011252	AAT	2	6	4659	4664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011252	ATT	2	6	4693	4698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011252	TTA	2	6	4704	4709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011252	AAC	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011252	ACT	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011252	ACA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011252	CAA	2	6	4822	4827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011252	TAT	2	6	4848	4853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011252	TAA	2	6	4931	4936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011252	TTA	2	6	4943	4948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011252	AAT	2	6	4954	4959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011252	ATA	2	6	4999	5004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011252	AGA	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011252	TCC	2	6	6445	6450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011252	TAT	2	6	7023	7028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011252	TAT	2	6	7579	7584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011252	AAT	2	6	7624	7629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011252	ATC	2	6	7711	7716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011252	ATA	2	6	7943	7948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011252	CAA	2	6	7976	7981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011252	TTA	2	6	7984	7989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011252	TAC	2	6	8201	8206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011252	GAA	2	6	8292	8297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011252	AAC	2	6	8887	8892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011252	TCA	2	6	8907	8912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011252	ATA	2	6	8945	8950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011252	TAT	2	6	10249	10254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011252	ATT	2	6	10489	10494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011252	TAA	2	6	10523	10528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011252	TTA	2	6	10544	10549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011252	ATA	2	6	10675	10680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011252	TAA	2	6	10717	10722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011252	AAT	2	6	10736	10741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011252	CAA	2	6	10751	10756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011252	TCA	2	6	10851	10856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011252	ACA	2	6	10890	10895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011252	AAT	2	6	10992	10997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011252	TAA	2	6	11027	11032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011252	ATT	2	6	12722	12727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011252	ACT	2	6	12732	12737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011252	AGG	2	6	12756	12761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011252	CTT	2	6	13568	13573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011252	ATA	2	6	14949	14954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011252	AAT	2	6	14975	14980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011252	TAT	2	6	14984	14989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011252	TAA	2	6	15698	15703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011252	TCA	2	6	15747	15752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011252	ATG	2	6	15775	15780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011252	TAA	6	18	15795	15812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011252	ACA	2	6	15818	15823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011252	TAT	2	6	15837	15842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011252	GAA	2	6	16874	16879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011252	TAT	2	6	18826	18831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011252	TAA	2	6	18879	18884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011252	AAT	2	6	18982	18987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011252	ATT	2	6	19046	19051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011252	TCC	2	6	19744	19749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_011252	TAA	2	6	19842	19847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011252	ATT	2	6	19876	19881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011252	AAT	2	6	20016	20021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011252	ATT	2	6	20233	20238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011252	ATA	2	6	20268	20273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011252	AGG	2	6	20281	20286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011252	ATA	2	6	21400	21405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011252	AGC	2	6	21421	21426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_011252	GTT	2	6	21446	21451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011252	TAT	2	6	21468	21473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011252	TAT	2	6	21490	21495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011252	TAA	3	9	21515	21523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011252	GCT	2	6	21552	21557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_011252	TAG	2	6	21560	21565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011252	CTA	2	6	21577	21582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_011252	AGC	3	9	21593	21601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_011252	TGC	2	6	21645	21650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_011252	ATG	2	6	21653	21658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011252	GCA	3	9	21673	21681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_011252	TAT	2	6	21828	21833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011252	TAG	2	6	21835	21840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_011252	AGT	2	6	21851	21856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_011252	ATG	2	6	21947	21952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011252	ATA	2	6	22030	22035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_011252	TTA	2	6	22139	22144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_011252	TAA	2	6	22642	22647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011252	ATT	2	6	22676	22681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_011252	ATT	2	6	22706	22711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_011252	ATC	2	6	22751	22756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_011252	TAA	2	6	22923	22928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.