MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	TA	4	8	300	307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011252	GA	3	6	347	352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011252	AT	3	6	433	438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011252	AT	4	8	1035	1042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011252	AT	3	6	1065	1070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011252	TA	3	6	2351	2356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011252	TA	3	6	2373	2378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011252	AT	3	6	2380	2385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011252	AT	3	6	2409	2414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011252	TC	3	6	2607	2612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011252	AT	4	8	3871	3878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011252	AC	3	6	4065	4070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011252	AC	3	6	4174	4179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011252	AC	3	6	4552	4557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011252	AC	3	6	5177	5182	50 %	0 %	0 %	50 %	203288365
16	NC_011252	AT	3	6	5334	5339	50 %	50 %	0 %	0 %	203288365
17	NC_011252	GA	3	6	6302	6307	50 %	0 %	50 %	0 %	203288365
18	NC_011252	TA	3	6	6309	6314	50 %	50 %	0 %	0 %	203288365
19	NC_011252	AT	3	6	6331	6336	50 %	50 %	0 %	0 %	203288365
20	NC_011252	TA	3	6	6545	6550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011252	AT	3	6	6893	6898	50 %	50 %	0 %	0 %	203288366
22	NC_011252	TA	3	6	7037	7042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011252	CT	3	6	7471	7476	0 %	50 %	0 %	50 %	203288367
24	NC_011252	AT	3	6	7638	7643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011252	TA	3	6	7669	7674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011252	AT	3	6	7788	7793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011252	TA	5	10	7812	7821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011252	AT	3	6	8607	8612	50 %	50 %	0 %	0 %	203288368
29	NC_011252	CT	3	6	8765	8770	0 %	50 %	0 %	50 %	203288368
30	NC_011252	CA	3	6	8990	8995	50 %	0 %	0 %	50 %	203288369
31	NC_011252	AT	3	6	9003	9008	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
32	NC_011252	TA	3	6	9010	9015	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
33	NC_011252	AT	3	6	9022	9027	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
34	NC_011252	TA	3	6	9624	9629	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
35	NC_011252	CA	3	6	9711	9716	50 %	0 %	0 %	50 %	203288369
36	NC_011252	TA	3	6	9770	9775	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
37	NC_011252	AT	3	6	9838	9843	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
38	NC_011252	AT	4	8	10212	10219	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
39	NC_011252	TA	3	6	10689	10694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011252	AT	3	6	10710	10715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011252	AT	3	6	10820	10825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011252	AT	3	6	11898	11903	50 %	50 %	0 %	0 %	203288370
43	NC_011252	CT	3	6	12147	12152	0 %	50 %	0 %	50 %	203288370
44	NC_011252	AT	3	6	12161	12166	50 %	50 %	0 %	0 %	203288370
45	NC_011252	CA	3	6	12426	12431	50 %	0 %	0 %	50 %	203288370
46	NC_011252	AT	3	6	13495	13500	50 %	50 %	0 %	0 %	203288372
47	NC_011252	AT	3	6	14068	14073	50 %	50 %	0 %	0 %	203288373
48	NC_011252	AT	3	6	14697	14702	50 %	50 %	0 %	0 %	203288373
49	NC_011252	AT	3	6	14858	14863	50 %	50 %	0 %	0 %	203288373
50	NC_011252	AT	3	6	14988	14993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011252	TC	3	6	15032	15037	0 %	50 %	0 %	50 %	203288374
52	NC_011252	TA	3	6	16780	16785	50 %	50 %	0 %	0 %	203288375
53	NC_011252	AT	3	6	16866	16871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011252	AT	3	6	16882	16887	50 %	50 %	0 %	0 %	203288376
55	NC_011252	AT	4	8	17624	17631	50 %	50 %	0 %	0 %	203288377
56	NC_011252	AT	3	6	17738	17743	50 %	50 %	0 %	0 %	203288377
57	NC_011252	TA	3	6	17779	17784	50 %	50 %	0 %	0 %	203288377
58	NC_011252	AG	3	6	18068	18073	50 %	0 %	50 %	0 %	203288377
59	NC_011252	TA	4	8	18502	18509	50 %	50 %	0 %	0 %	203288378
60	NC_011252	AT	3	6	18511	18516	50 %	50 %	0 %	0 %	203288378
61	NC_011252	AG	3	6	18673	18678	50 %	0 %	50 %	0 %	203288378
62	NC_011252	AT	3	6	18855	18860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011252	GT	3	6	19235	19240	0 %	50 %	50 %	0 %	203288379
64	NC_011252	AT	3	6	19250	19255	50 %	50 %	0 %	0 %	203288379
65	NC_011252	TA	3	6	19356	19361	50 %	50 %	0 %	0 %	203288379
66	NC_011252	GT	3	6	19544	19549	0 %	50 %	50 %	0 %	203288379
67	NC_011252	AT	3	6	20020	20025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011252	TA	8	16	20108	20123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011252	AG	3	6	20299	20304	50 %	0 %	50 %	0 %	203288380
70	NC_011252	GA	3	6	20404	20409	50 %	0 %	50 %	0 %	203288380
71	NC_011252	GA	3	6	21925	21930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011252	TC	3	6	22105	22110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011252	AT	3	6	22131	22136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011252	TA	3	6	22766	22771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.