MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	AC	3	6	5177	5182	50 %	0 %	0 %	50 %	203288365
2	NC_011252	AT	3	6	5334	5339	50 %	50 %	0 %	0 %	203288365
3	NC_011252	GA	3	6	6302	6307	50 %	0 %	50 %	0 %	203288365
4	NC_011252	TA	3	6	6309	6314	50 %	50 %	0 %	0 %	203288365
5	NC_011252	AT	3	6	6331	6336	50 %	50 %	0 %	0 %	203288365
6	NC_011252	AT	3	6	6893	6898	50 %	50 %	0 %	0 %	203288366
7	NC_011252	CT	3	6	7471	7476	0 %	50 %	0 %	50 %	203288367
8	NC_011252	AT	3	6	8607	8612	50 %	50 %	0 %	0 %	203288368
9	NC_011252	CT	3	6	8765	8770	0 %	50 %	0 %	50 %	203288368
10	NC_011252	CA	3	6	8990	8995	50 %	0 %	0 %	50 %	203288369
11	NC_011252	AT	3	6	9003	9008	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
12	NC_011252	TA	3	6	9010	9015	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
13	NC_011252	AT	3	6	9022	9027	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
14	NC_011252	TA	3	6	9624	9629	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
15	NC_011252	CA	3	6	9711	9716	50 %	0 %	0 %	50 %	203288369
16	NC_011252	TA	3	6	9770	9775	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
17	NC_011252	AT	3	6	9838	9843	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
18	NC_011252	AT	4	8	10212	10219	50 %	50 %	0 %	0 %	203288369
19	NC_011252	AT	3	6	11898	11903	50 %	50 %	0 %	0 %	203288370
20	NC_011252	CT	3	6	12147	12152	0 %	50 %	0 %	50 %	203288370
21	NC_011252	AT	3	6	12161	12166	50 %	50 %	0 %	0 %	203288370
22	NC_011252	CA	3	6	12426	12431	50 %	0 %	0 %	50 %	203288370
23	NC_011252	AT	3	6	13495	13500	50 %	50 %	0 %	0 %	203288372
24	NC_011252	AT	3	6	14068	14073	50 %	50 %	0 %	0 %	203288373
25	NC_011252	AT	3	6	14697	14702	50 %	50 %	0 %	0 %	203288373
26	NC_011252	AT	3	6	14858	14863	50 %	50 %	0 %	0 %	203288373
27	NC_011252	TC	3	6	15032	15037	0 %	50 %	0 %	50 %	203288374
28	NC_011252	TA	3	6	16780	16785	50 %	50 %	0 %	0 %	203288375
29	NC_011252	AT	3	6	16882	16887	50 %	50 %	0 %	0 %	203288376
30	NC_011252	AT	4	8	17624	17631	50 %	50 %	0 %	0 %	203288377
31	NC_011252	AT	3	6	17738	17743	50 %	50 %	0 %	0 %	203288377
32	NC_011252	TA	3	6	17779	17784	50 %	50 %	0 %	0 %	203288377
33	NC_011252	AG	3	6	18068	18073	50 %	0 %	50 %	0 %	203288377
34	NC_011252	TA	4	8	18502	18509	50 %	50 %	0 %	0 %	203288378
35	NC_011252	AT	3	6	18511	18516	50 %	50 %	0 %	0 %	203288378
36	NC_011252	AG	3	6	18673	18678	50 %	0 %	50 %	0 %	203288378
37	NC_011252	GT	3	6	19235	19240	0 %	50 %	50 %	0 %	203288379
38	NC_011252	AT	3	6	19250	19255	50 %	50 %	0 %	0 %	203288379
39	NC_011252	TA	3	6	19356	19361	50 %	50 %	0 %	0 %	203288379
40	NC_011252	GT	3	6	19544	19549	0 %	50 %	50 %	0 %	203288379
41	NC_011252	AG	3	6	20299	20304	50 %	0 %	50 %	0 %	203288380
42	NC_011252	GA	3	6	20404	20409	50 %	0 %	50 %	0 %	203288380

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.