MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	T	6	6	132	137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011252	T	9	9	212	220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011252	A	6	6	603	608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011252	T	6	6	719	724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011252	T	7	7	726	732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011252	T	6	6	1059	1064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011252	T	7	7	1237	1243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011252	A	7	7	1370	1376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011252	A	7	7	1423	1429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011252	T	7	7	1539	1545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011252	A	7	7	2330	2336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011252	C	6	6	2664	2669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_011252	T	6	6	3517	3522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011252	A	6	6	3854	3859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011252	A	6	6	4120	4125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011252	T	6	6	4537	4542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011252	A	6	6	4585	4590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011252	A	7	7	4815	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011252	A	7	7	4935	4941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011252	A	7	7	5004	5010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011252	A	6	6	5115	5120	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
22	NC_011252	A	6	6	5195	5200	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
23	NC_011252	A	6	6	5260	5265	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
24	NC_011252	T	6	6	5302	5307	0 %	100 %	0 %	0 %	203288365
25	NC_011252	A	6	6	5322	5327	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
26	NC_011252	A	6	6	5388	5393	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
27	NC_011252	A	6	6	5743	5748	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
28	NC_011252	A	6	6	6171	6176	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
29	NC_011252	A	6	6	6517	6522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011252	A	9	9	6524	6532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011252	A	6	6	6612	6617	100 %	0 %	0 %	0 %	203288366
32	NC_011252	A	6	6	6655	6660	100 %	0 %	0 %	0 %	203288366
33	NC_011252	T	7	7	6661	6667	0 %	100 %	0 %	0 %	203288366
34	NC_011252	A	7	7	6718	6724	100 %	0 %	0 %	0 %	203288366
35	NC_011252	A	7	7	6971	6977	100 %	0 %	0 %	0 %	203288366
36	NC_011252	T	6	6	7488	7493	0 %	100 %	0 %	0 %	203288367
37	NC_011252	A	10	10	7529	7538	100 %	0 %	0 %	0 %	203288367
38	NC_011252	A	9	9	7549	7557	100 %	0 %	0 %	0 %	203288367
39	NC_011252	A	8	8	7763	7770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011252	A	6	6	7804	7809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011252	A	6	6	8048	8053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011252	A	8	8	8150	8157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011252	A	7	7	8223	8229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011252	A	6	6	8249	8254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011252	A	7	7	8280	8286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011252	A	6	6	8329	8334	100 %	0 %	0 %	0 %	203288368
47	NC_011252	A	6	6	8403	8408	100 %	0 %	0 %	0 %	203288368
48	NC_011252	T	6	6	8717	8722	0 %	100 %	0 %	0 %	203288368
49	NC_011252	A	6	6	8778	8783	100 %	0 %	0 %	0 %	203288368
50	NC_011252	A	8	8	8835	8842	100 %	0 %	0 %	0 %	203288368
51	NC_011252	A	7	7	8871	8877	100 %	0 %	0 %	0 %	203288368
52	NC_011252	A	6	6	9095	9100	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
53	NC_011252	T	6	6	9106	9111	0 %	100 %	0 %	0 %	203288369
54	NC_011252	T	8	8	9132	9139	0 %	100 %	0 %	0 %	203288369
55	NC_011252	T	6	6	9214	9219	0 %	100 %	0 %	0 %	203288369
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57	NC_011252	A	6	6	9354	9359	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
58	NC_011252	A	8	8	9383	9390	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
59	NC_011252	A	7	7	9849	9855	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
60	NC_011252	A	7	7	10156	10162	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
61	NC_011252	A	8	8	10329	10336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011252	A	6	6	10451	10456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011252	A	8	8	10666	10673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011252	A	6	6	10856	10861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_011252	T	6	6	11621	11626	0 %	100 %	0 %	0 %	203288370
68	NC_011252	T	7	7	11962	11968	0 %	100 %	0 %	0 %	203288370
69	NC_011252	A	6	6	12047	12052	100 %	0 %	0 %	0 %	203288370
70	NC_011252	A	6	6	12599	12604	100 %	0 %	0 %	0 %	203288370
71	NC_011252	A	6	6	12688	12693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011252	T	6	6	12748	12753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011252	A	8	8	12845	12852	100 %	0 %	0 %	0 %	203288371
74	NC_011252	A	7	7	12953	12959	100 %	0 %	0 %	0 %	203288371
75	NC_011252	A	9	9	12991	12999	100 %	0 %	0 %	0 %	203288371
76	NC_011252	A	7	7	13156	13162	100 %	0 %	0 %	0 %	203288372
77	NC_011252	A	6	6	13209	13214	100 %	0 %	0 %	0 %	203288372
78	NC_011252	A	6	6	13271	13276	100 %	0 %	0 %	0 %	203288372
79	NC_011252	A	7	7	13321	13327	100 %	0 %	0 %	0 %	203288372
80	NC_011252	A	7	7	13459	13465	100 %	0 %	0 %	0 %	203288372
81	NC_011252	A	7	7	13526	13532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85	NC_011252	T	6	6	14763	14768	0 %	100 %	0 %	0 %	203288373
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90	NC_011252	A	6	6	15327	15332	100 %	0 %	0 %	0 %	203288374
91	NC_011252	A	6	6	15581	15586	100 %	0 %	0 %	0 %	203288374
92	NC_011252	A	9	9	15613	15621	100 %	0 %	0 %	0 %	203288374
93	NC_011252	A	8	8	15636	15643	100 %	0 %	0 %	0 %	203288374
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98	NC_011252	A	6	6	16182	16187	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
99	NC_011252	A	7	7	16271	16277	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
100	NC_011252	A	6	6	16387	16392	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
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112	NC_011252	A	7	7	17614	17620	100 %	0 %	0 %	0 %	203288377
113	NC_011252	A	6	6	17641	17646	100 %	0 %	0 %	0 %	203288377
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116	NC_011252	T	6	6	18092	18097	0 %	100 %	0 %	0 %	203288377
117	NC_011252	A	7	7	18257	18263	100 %	0 %	0 %	0 %	203288378
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121	NC_011252	T	6	6	19080	19085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_011252	A	7	7	20273	20279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_011252	T	8	8	21990	21997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_011252	T	7	7	22840	22846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_011252	T	6	6	22882	22887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011252	A	7	7	22904	22910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.