MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	A	6	6	5115	5120	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
2	NC_011252	A	6	6	5195	5200	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
3	NC_011252	A	6	6	5260	5265	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
4	NC_011252	T	6	6	5302	5307	0 %	100 %	0 %	0 %	203288365
5	NC_011252	A	6	6	5322	5327	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
6	NC_011252	A	6	6	5388	5393	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
7	NC_011252	A	6	6	5743	5748	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
8	NC_011252	A	6	6	6171	6176	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
9	NC_011252	A	6	6	6612	6617	100 %	0 %	0 %	0 %	203288366
10	NC_011252	A	6	6	6655	6660	100 %	0 %	0 %	0 %	203288366
11	NC_011252	T	7	7	6661	6667	0 %	100 %	0 %	0 %	203288366
12	NC_011252	A	7	7	6718	6724	100 %	0 %	0 %	0 %	203288366
13	NC_011252	A	7	7	6971	6977	100 %	0 %	0 %	0 %	203288366
14	NC_011252	T	6	6	7488	7493	0 %	100 %	0 %	0 %	203288367
15	NC_011252	A	10	10	7529	7538	100 %	0 %	0 %	0 %	203288367
16	NC_011252	A	9	9	7549	7557	100 %	0 %	0 %	0 %	203288367
17	NC_011252	A	6	6	8329	8334	100 %	0 %	0 %	0 %	203288368
18	NC_011252	A	6	6	8403	8408	100 %	0 %	0 %	0 %	203288368
19	NC_011252	T	6	6	8717	8722	0 %	100 %	0 %	0 %	203288368
20	NC_011252	A	6	6	8778	8783	100 %	0 %	0 %	0 %	203288368
21	NC_011252	A	8	8	8835	8842	100 %	0 %	0 %	0 %	203288368
22	NC_011252	A	7	7	8871	8877	100 %	0 %	0 %	0 %	203288368
23	NC_011252	A	6	6	9095	9100	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
24	NC_011252	T	6	6	9106	9111	0 %	100 %	0 %	0 %	203288369
25	NC_011252	T	8	8	9132	9139	0 %	100 %	0 %	0 %	203288369
26	NC_011252	T	6	6	9214	9219	0 %	100 %	0 %	0 %	203288369
27	NC_011252	A	7	7	9250	9256	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
28	NC_011252	A	6	6	9354	9359	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
29	NC_011252	A	8	8	9383	9390	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
30	NC_011252	A	7	7	9849	9855	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
31	NC_011252	A	7	7	10156	10162	100 %	0 %	0 %	0 %	203288369
32	NC_011252	A	6	6	11220	11225	100 %	0 %	0 %	0 %	203288370
33	NC_011252	T	6	6	11517	11522	0 %	100 %	0 %	0 %	203288370
34	NC_011252	T	6	6	11621	11626	0 %	100 %	0 %	0 %	203288370
35	NC_011252	T	7	7	11962	11968	0 %	100 %	0 %	0 %	203288370
36	NC_011252	A	6	6	12047	12052	100 %	0 %	0 %	0 %	203288370
37	NC_011252	A	6	6	12599	12604	100 %	0 %	0 %	0 %	203288370
38	NC_011252	A	8	8	12845	12852	100 %	0 %	0 %	0 %	203288371
39	NC_011252	A	7	7	12953	12959	100 %	0 %	0 %	0 %	203288371
40	NC_011252	A	9	9	12991	12999	100 %	0 %	0 %	0 %	203288371
41	NC_011252	A	7	7	13156	13162	100 %	0 %	0 %	0 %	203288372
42	NC_011252	A	6	6	13209	13214	100 %	0 %	0 %	0 %	203288372
43	NC_011252	A	6	6	13271	13276	100 %	0 %	0 %	0 %	203288372
44	NC_011252	A	7	7	13321	13327	100 %	0 %	0 %	0 %	203288372
45	NC_011252	A	7	7	13459	13465	100 %	0 %	0 %	0 %	203288372
46	NC_011252	T	6	6	13992	13997	0 %	100 %	0 %	0 %	203288373
47	NC_011252	T	6	6	14377	14382	0 %	100 %	0 %	0 %	203288373
48	NC_011252	A	7	7	14644	14650	100 %	0 %	0 %	0 %	203288373
49	NC_011252	T	6	6	14763	14768	0 %	100 %	0 %	0 %	203288373
50	NC_011252	T	6	6	14874	14879	0 %	100 %	0 %	0 %	203288373
51	NC_011252	T	6	6	14897	14902	0 %	100 %	0 %	0 %	203288373
52	NC_011252	T	6	6	15231	15236	0 %	100 %	0 %	0 %	203288374
53	NC_011252	T	6	6	15269	15274	0 %	100 %	0 %	0 %	203288374
54	NC_011252	A	6	6	15327	15332	100 %	0 %	0 %	0 %	203288374
55	NC_011252	A	6	6	15581	15586	100 %	0 %	0 %	0 %	203288374
56	NC_011252	A	9	9	15613	15621	100 %	0 %	0 %	0 %	203288374
57	NC_011252	A	8	8	15636	15643	100 %	0 %	0 %	0 %	203288374
58	NC_011252	A	6	6	16000	16005	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
59	NC_011252	A	7	7	16030	16036	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
60	NC_011252	A	7	7	16082	16088	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
61	NC_011252	A	6	6	16142	16147	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
62	NC_011252	A	6	6	16182	16187	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
63	NC_011252	A	7	7	16271	16277	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
64	NC_011252	A	6	6	16387	16392	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
65	NC_011252	A	8	8	16432	16439	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
66	NC_011252	A	6	6	16489	16494	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
67	NC_011252	T	8	8	16610	16617	0 %	100 %	0 %	0 %	203288375
68	NC_011252	A	8	8	16630	16637	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
69	NC_011252	A	6	6	16842	16847	100 %	0 %	0 %	0 %	203288375
70	NC_011252	T	7	7	16954	16960	0 %	100 %	0 %	0 %	203288376
71	NC_011252	A	7	7	16985	16991	100 %	0 %	0 %	0 %	203288376
72	NC_011252	A	6	6	17255	17260	100 %	0 %	0 %	0 %	203288376
73	NC_011252	T	6	6	17268	17273	0 %	100 %	0 %	0 %	203288376
74	NC_011252	A	7	7	17319	17325	100 %	0 %	0 %	0 %	203288376
75	NC_011252	T	6	6	17497	17502	0 %	100 %	0 %	0 %	203288377
76	NC_011252	A	7	7	17614	17620	100 %	0 %	0 %	0 %	203288377
77	NC_011252	A	6	6	17641	17646	100 %	0 %	0 %	0 %	203288377
78	NC_011252	A	6	6	18015	18020	100 %	0 %	0 %	0 %	203288377
79	NC_011252	T	6	6	18048	18053	0 %	100 %	0 %	0 %	203288377
80	NC_011252	T	6	6	18092	18097	0 %	100 %	0 %	0 %	203288377
81	NC_011252	A	7	7	18257	18263	100 %	0 %	0 %	0 %	203288378
82	NC_011252	T	8	8	18751	18758	0 %	100 %	0 %	0 %	203288378
83	NC_011252	T	7	7	19213	19219	0 %	100 %	0 %	0 %	203288379
84	NC_011252	T	6	6	19532	19537	0 %	100 %	0 %	0 %	203288379
85	NC_011252	T	6	6	19633	19638	0 %	100 %	0 %	0 %	203288379
86	NC_011252	A	6	6	21014	21019	100 %	0 %	0 %	0 %	203288380
87	NC_011252	T	7	7	22159	22165	0 %	100 %	0 %	0 %	203288381
88	NC_011252	T	6	6	22179	22184	0 %	100 %	0 %	0 %	203288381
89	NC_011252	T	8	8	22243	22250	0 %	100 %	0 %	0 %	203288381
90	NC_011252	A	6	6	22253	22258	100 %	0 %	0 %	0 %	203288381
91	NC_011252	T	6	6	22367	22372	0 %	100 %	0 %	0 %	203288381
92	NC_011252	T	7	7	22415	22421	0 %	100 %	0 %	0 %	203288381
93	NC_011252	T	9	9	22539	22547	0 %	100 %	0 %	0 %	203288381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.