MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl41

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011251	TTCT	2	8	361	368	0 %	75 %	0 %	25 %	203288702
2	NC_011251	TAAA	2	8	790	797	75 %	25 %	0 %	0 %	203288702
3	NC_011251	TTTA	2	8	885	892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011251	AAAT	2	8	1064	1071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011251	TATT	2	8	1253	1260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011251	ACTG	2	8	1288	1295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011251	AATG	2	8	1792	1799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011251	GGAA	2	8	1830	1837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011251	AATG	2	8	2015	2022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011251	TGAA	2	8	2030	2037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011251	TACA	2	8	2104	2111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011251	TCTT	2	8	2188	2195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011251	TAAA	2	8	2278	2285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011251	ATTT	2	8	2334	2341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011251	TTTA	2	8	2347	2354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011251	ATTA	2	8	2398	2405	50 %	50 %	0 %	0 %	203288703
17	NC_011251	TTAT	2	8	2451	2458	25 %	75 %	0 %	0 %	203288703
18	NC_011251	CTTA	2	8	2516	2523	25 %	50 %	0 %	25 %	203288703
19	NC_011251	TCTT	2	8	2643	2650	0 %	75 %	0 %	25 %	203288703
20	NC_011251	ACTG	2	8	2795	2802	25 %	25 %	25 %	25 %	203288703
21	NC_011251	CTTC	2	8	3178	3185	0 %	50 %	0 %	50 %	203288703
22	NC_011251	TTTA	2	8	3484	3491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011251	CAAA	2	8	3497	3504	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011251	TAAA	2	8	3562	3569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011251	ATTA	2	8	3649	3656	50 %	50 %	0 %	0 %	203288704
26	NC_011251	TTAT	2	8	3702	3709	25 %	75 %	0 %	0 %	203288704
27	NC_011251	CTTT	2	8	4176	4183	0 %	75 %	0 %	25 %	203288704
28	NC_011251	TAGT	2	8	4877	4884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011251	ACTA	2	8	4901	4908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011251	TTCA	2	8	4990	4997	25 %	50 %	0 %	25 %	203288705
31	NC_011251	TCTT	2	8	5156	5163	0 %	75 %	0 %	25 %	203288705
32	NC_011251	ATTC	2	8	5956	5963	25 %	50 %	0 %	25 %	203288705
33	NC_011251	TTAT	2	8	6220	6227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011251	CTTA	2	8	6285	6292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011251	TTCC	2	8	6392	6399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011251	ATTT	2	8	6933	6940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011251	CATT	2	8	7270	7277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011251	ATAA	2	8	7391	7398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011251	CTAA	2	8	7442	7449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011251	CTTT	2	8	7837	7844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011251	TTGC	2	8	7856	7863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011251	CTTC	2	8	8319	8326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011251	AATA	2	8	8585	8592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011251	CTAA	2	8	8625	8632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011251	TTAC	2	8	8740	8747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011251	CTGT	2	8	8799	8806	0 %	50 %	25 %	25 %	203288706
47	NC_011251	TTTA	2	8	8860	8867	25 %	75 %	0 %	0 %	203288706
48	NC_011251	TTGC	2	8	9450	9457	0 %	50 %	25 %	25 %	203288706
49	NC_011251	TGCT	2	8	9501	9508	0 %	50 %	25 %	25 %	203288706
50	NC_011251	TATT	2	8	9992	9999	25 %	75 %	0 %	0 %	203288706
51	NC_011251	AATA	2	8	10153	10160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011251	TAGA	2	8	10240	10247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011251	TATC	2	8	10364	10371	25 %	50 %	0 %	25 %	203288707
54	NC_011251	AATA	2	8	10876	10883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011251	ATAA	2	8	11864	11871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011251	ATTT	2	8	12299	12306	25 %	75 %	0 %	0 %	203288708
57	NC_011251	TTAC	2	8	12540	12547	25 %	50 %	0 %	25 %	203288708
58	NC_011251	AATT	2	8	12692	12699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011251	AACA	2	8	13083	13090	75 %	0 %	0 %	25 %	203288709
60	NC_011251	ATTT	2	8	13157	13164	25 %	75 %	0 %	0 %	203288709
61	NC_011251	ATTG	2	8	13296	13303	25 %	50 %	25 %	0 %	203288709
62	NC_011251	GTAA	2	8	13489	13496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011251	GAAG	2	8	13524	13531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011251	AAAG	2	8	13571	13578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011251	AAAG	2	8	13745	13752	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011251	TGAA	2	8	13890	13897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011251	AAAT	2	8	14225	14232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011251	AATA	2	8	14246	14253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011251	TAAA	2	8	14254	14261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011251	AATG	2	8	14567	14574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011251	CAAT	2	8	14630	14637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011251	TATT	2	8	14869	14876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011251	TTCT	2	8	15212	15219	0 %	75 %	0 %	25 %	203288710
74	NC_011251	AACC	2	8	15743	15750	50 %	0 %	0 %	50 %	203288710
75	NC_011251	TTTA	2	8	15889	15896	25 %	75 %	0 %	0 %	203288711
76	NC_011251	ATTT	2	8	16318	16325	25 %	75 %	0 %	0 %	203288711
77	NC_011251	ATCA	2	8	16453	16460	50 %	25 %	0 %	25 %	203288711
78	NC_011251	TTGA	2	8	16532	16539	25 %	50 %	25 %	0 %	203288711
79	NC_011251	ATTT	2	8	16574	16581	25 %	75 %	0 %	0 %	203288711
80	NC_011251	TCCG	2	8	16590	16597	0 %	25 %	25 %	50 %	203288712
81	NC_011251	TACC	2	8	16676	16683	25 %	25 %	0 %	50 %	203288712
82	NC_011251	AAAT	2	8	16884	16891	75 %	25 %	0 %	0 %	203288712
83	NC_011251	ATAC	2	8	16973	16980	50 %	25 %	0 %	25 %	203288712
84	NC_011251	TCTT	2	8	17595	17602	0 %	75 %	0 %	25 %	203288713
85	NC_011251	TTCT	2	8	17757	17764	0 %	75 %	0 %	25 %	203288713
86	NC_011251	TGTT	2	8	17847	17854	0 %	75 %	25 %	0 %	203288713
87	NC_011251	TCTT	2	8	17883	17890	0 %	75 %	0 %	25 %	203288713
88	NC_011251	AATT	2	8	18174	18181	50 %	50 %	0 %	0 %	203288713
89	NC_011251	TATT	2	8	18190	18197	25 %	75 %	0 %	0 %	203288713
90	NC_011251	GAAT	2	8	18585	18592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011251	AATT	2	8	18701	18708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011251	TATT	2	8	18817	18824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011251	TGGT	2	8	18934	18941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011251	ATAG	2	8	19469	19476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011251	AGAT	2	8	19645	19652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011251	ATTT	2	8	20521	20528	25 %	75 %	0 %	0 %	203288714
97	NC_011251	AATG	2	8	20939	20946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011251	TTTA	2	8	20947	20954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011251	ATTA	2	8	21008	21015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011251	TTTA	2	8	21121	21128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011251	TGTA	2	8	21353	21360	25 %	50 %	25 %	0 %	203288715
102	NC_011251	CTTG	2	8	21512	21519	0 %	50 %	25 %	25 %	203288715
103	NC_011251	CTTT	2	8	21652	21659	0 %	75 %	0 %	25 %	203288715
104	NC_011251	ATGT	2	8	22116	22123	25 %	50 %	25 %	0 %	203288716
105	NC_011251	TTAT	2	8	22800	22807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011251	AATT	2	8	22996	23003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011251	AGAT	2	8	24072	24079	50 %	25 %	25 %	0 %	203288717
108	NC_011251	ATAA	2	8	24458	24465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011251	AAGG	2	8	24482	24489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011251	TAAT	2	8	24511	24518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011251	AGAA	2	8	24691	24698	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011251	AGGA	2	8	24857	24864	50 %	0 %	50 %	0 %	203288718
113	NC_011251	AGTA	2	8	24918	24925	50 %	25 %	25 %	0 %	203288718
114	NC_011251	AAAG	2	8	25263	25270	75 %	0 %	25 %	0 %	203288718
115	NC_011251	TAGA	2	8	25274	25281	50 %	25 %	25 %	0 %	203288718
116	NC_011251	CGAT	2	8	25337	25344	25 %	25 %	25 %	25 %	203288718
117	NC_011251	AATA	2	8	25468	25475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011251	TTAT	2	8	25857	25864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011251	AATA	2	8	26120	26127	75 %	25 %	0 %	0 %	203288719
120	NC_011251	GTAA	2	8	26147	26154	50 %	25 %	25 %	0 %	203288719
121	NC_011251	ATAA	2	8	27109	27116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011251	TGAG	2	8	27295	27302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011251	GAAG	2	8	27440	27447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011251	TAAG	2	8	27460	27467	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011251	GAAA	2	8	27500	27507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011251	TAAG	2	8	27532	27539	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011251	TTTA	2	8	27991	27998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011251	ATTA	2	8	28051	28058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011251	ATTT	2	8	28208	28215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011251	CTTT	2	8	28268	28275	0 %	75 %	0 %	25 %	203288720
131	NC_011251	TTAT	2	8	28328	28335	25 %	75 %	0 %	0 %	203288720
132	NC_011251	ATGT	2	8	29178	29185	25 %	50 %	25 %	0 %	203288721
133	NC_011251	TTAT	2	8	29862	29869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011251	AATT	2	8	30058	30065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011251	AGAT	2	8	31080	31087	50 %	25 %	25 %	0 %	203288722
136	NC_011251	AGAT	2	8	31254	31261	50 %	25 %	25 %	0 %	203288722
137	NC_011251	ATAA	2	8	31639	31646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011251	AAGG	2	8	31663	31670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011251	TAAT	2	8	31692	31699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011251	TGTT	2	8	31804	31811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011251	ATTT	2	8	31824	31831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011251	GTAA	2	8	32028	32035	50 %	25 %	25 %	0 %	203288723
143	NC_011251	GAAG	2	8	32195	32202	50 %	0 %	50 %	0 %	203288723
144	NC_011251	AATT	2	8	32323	32330	50 %	50 %	0 %	0 %	203288723
145	NC_011251	AATT	2	8	32930	32937	50 %	50 %	0 %	0 %	203288723
146	NC_011251	ATAA	2	8	33030	33037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011251	AAAT	2	8	33096	33103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011251	ATTT	2	8	33122	33129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011251	TTTG	2	8	33141	33148	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_011251	AAAT	2	8	33443	33450	75 %	25 %	0 %	0 %	203288724
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.