MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl41

Total Repeats: 734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011251	TAA	2	6	22	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
2	NC_011251	TCC	2	6	130	135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288702
3	NC_011251	TTC	2	6	158	163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288702
4	NC_011251	CAA	2	6	190	195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
5	NC_011251	CTA	3	9	268	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
6	NC_011251	TAT	2	6	316	321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
7	NC_011251	AGA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288702
8	NC_011251	AAT	2	6	393	398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
9	NC_011251	TAT	2	6	412	417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
10	NC_011251	CAT	2	6	418	423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
11	NC_011251	TAT	2	6	436	441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
12	NC_011251	TCC	2	6	495	500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288702
13	NC_011251	CAT	2	6	547	552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
14	NC_011251	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
15	NC_011251	AAC	2	6	635	640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
16	NC_011251	TCT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288702
17	NC_011251	TCA	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
18	NC_011251	ATT	2	6	671	676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
19	NC_011251	ACA	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
20	NC_011251	ATT	2	6	692	697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
21	NC_011251	ACA	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
22	NC_011251	TAT	2	6	733	738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
23	NC_011251	AAT	2	6	741	746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
24	NC_011251	TAA	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
25	NC_011251	CTT	2	6	819	824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011251	TAA	2	6	832	837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011251	ATT	2	6	860	865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011251	TAA	2	6	869	874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011251	TTA	2	6	954	959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011251	TAT	2	6	1156	1161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011251	TAT	2	6	1200	1205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011251	CAG	2	6	1323	1328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011251	TTC	2	6	1413	1418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011251	TTA	2	6	1553	1558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011251	CTG	2	6	1622	1627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011251	CTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011251	AGT	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011251	GTA	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011251	TAA	3	9	1762	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011251	AGG	2	6	1779	1784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011251	AGA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011251	GAA	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011251	GAG	2	6	1838	1843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011251	TGA	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011251	ATG	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011251	TAT	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011251	ATG	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011251	AAC	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011251	TTA	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011251	TTG	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288703
51	NC_011251	CTA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
52	NC_011251	GCT	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288703
53	NC_011251	GCA	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288703
54	NC_011251	TGC	2	6	2717	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288703
55	NC_011251	TAT	2	6	2737	2742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288703
56	NC_011251	GCC	2	6	2826	2831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	203288703
57	NC_011251	TCA	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
58	NC_011251	CTT	2	6	2858	2863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
59	NC_011251	ATT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288703
60	NC_011251	CTT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
61	NC_011251	AGC	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288703
62	NC_011251	CTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
63	NC_011251	CCA	2	6	3213	3218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288703
64	NC_011251	CAT	2	6	3371	3376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
65	NC_011251	CAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
66	NC_011251	TAT	2	6	3386	3391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288703
67	NC_011251	TTC	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
68	NC_011251	CCT	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011251	TTA	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011251	ACG	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011251	ATT	2	6	3534	3539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011251	ACA	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011251	TAA	2	6	3609	3614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011251	CTA	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288704
75	NC_011251	ATA	2	6	3803	3808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288704
76	NC_011251	ATC	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288704
77	NC_011251	CTG	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288704
78	NC_011251	TTC	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288704
79	NC_011251	CTG	2	6	3952	3957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288704
80	NC_011251	TAG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288704
81	NC_011251	GCC	2	6	4074	4079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	203288704
82	NC_011251	CAA	2	6	4195	4200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288704
83	NC_011251	CAG	2	6	4243	4248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288704
84	NC_011251	TAA	2	6	4351	4356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288704
85	NC_011251	CTC	2	6	4358	4363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288704
86	NC_011251	AAC	2	6	4364	4369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288704
87	NC_011251	TAG	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288704
88	NC_011251	TTC	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288704
89	NC_011251	CAT	3	9	4628	4636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288704
90	NC_011251	TAA	2	6	4654	4659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011251	CTT	2	6	4671	4676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011251	CTT	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011251	CCT	2	6	4743	4748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011251	TAT	2	6	4759	4764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011251	CTG	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288705
96	NC_011251	CTT	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288705
97	NC_011251	TCT	2	6	5351	5356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288705
98	NC_011251	ATC	2	6	5410	5415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288705
99	NC_011251	TAG	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288705
100	NC_011251	AAT	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288705
101	NC_011251	TTA	2	6	5490	5495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288705
102	NC_011251	AGC	2	6	5518	5523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288705
103	NC_011251	CAC	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288705
104	NC_011251	CTT	2	6	5598	5603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288705
105	NC_011251	TAA	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288705
106	NC_011251	GCA	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288705
107	NC_011251	ATT	2	6	5665	5670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288705
108	NC_011251	TTG	2	6	5697	5702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288705
109	NC_011251	CAT	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288705
110	NC_011251	CAT	4	12	5902	5913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288705
111	NC_011251	AAT	2	6	5915	5920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288705
112	NC_011251	CCT	2	6	5970	5975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_011251	TAA	2	6	6002	6007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011251	AAT	2	6	6041	6046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011251	CTA	2	6	6302	6307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011251	ATC	3	9	6445	6453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011251	AGC	3	9	6460	6468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011251	CTT	2	6	6489	6494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011251	ATT	2	6	6508	6513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011251	AGC	2	6	6514	6519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011251	CAT	2	6	6609	6614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011251	TAG	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011251	GCA	2	6	6758	6763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011251	CAC	2	6	6789	6794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011251	ATC	2	6	6802	6807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011251	TGC	2	6	6823	6828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011251	TAA	2	6	6867	6872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011251	CAA	2	6	6879	6884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011251	TTC	2	6	6911	6916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011251	TTG	3	9	6954	6962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011251	CAT	3	9	7147	7155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011251	ATT	2	6	7160	7165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011251	CTT	2	6	7182	7187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011251	TCT	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011251	TTC	2	6	7235	7240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011251	CTA	2	6	7255	7260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011251	TTC	2	6	7278	7283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011251	CAT	2	6	7285	7290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011251	TTA	2	6	7295	7300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011251	AGA	2	6	7336	7341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011251	ATT	2	6	7432	7437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011251	CAT	2	6	7646	7651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011251	ATT	2	6	7656	7661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011251	CCT	2	6	7678	7683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_011251	TCC	2	6	7707	7712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_011251	ATT	2	6	7758	7763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011251	CTG	2	6	7787	7792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011251	TGC	2	6	7800	7805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011251	TGC	4	12	7896	7907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011251	TAT	2	6	7931	7936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011251	GGT	2	6	7941	7946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011251	CTG	2	6	8081	8086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011251	CCA	2	6	8134	8139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_011251	GCT	2	6	8152	8157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_011251	CCA	2	6	8191	8196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_011251	CTC	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_011251	TTC	2	6	8239	8244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_011251	CAT	2	6	8476	8481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_011251	CTA	2	6	8496	8501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_011251	TTC	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_011251	TCC	2	6	8511	8516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_011251	GAT	2	6	8545	8550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011251	TAT	2	6	8646	8651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011251	TTA	2	6	8732	8737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011251	TAA	2	6	8785	8790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288706
166	NC_011251	TAT	2	6	8824	8829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288706
167	NC_011251	TAA	2	6	8854	8859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288706
168	NC_011251	TGC	2	6	8911	8916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288706
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183	NC_011251	TTA	2	6	9621	9626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288706
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