MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl40

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011250	TATT	2	8	18	25	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011250	CTAT	2	8	410	417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011250	ATTA	2	8	529	536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011250	CATT	2	8	573	580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011250	TTGT	2	8	602	609	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011250	TAAA	2	8	1083	1090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011250	AAAT	2	8	1275	1282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011250	TTTA	2	8	1706	1713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011250	AGGA	2	8	2044	2051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011250	GAAG	2	8	2358	2365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011250	AAAT	2	8	2683	2690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011250	TTTC	2	8	4279	4286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011250	CTTT	2	8	4459	4466	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011250	TATC	2	8	4699	4706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011250	CCTT	2	8	4833	4840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011250	ATTT	3	12	5021	5032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011250	GTTT	2	8	5201	5208	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011250	TTAA	2	8	5251	5258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011250	ATCT	2	8	5744	5751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011250	TTTA	2	8	6896	6903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011250	AAAT	2	8	6916	6923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011250	TTAT	2	8	7114	7121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011250	CCTT	2	8	7252	7259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011250	TCTT	2	8	7300	7307	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011250	TTTC	2	8	7325	7332	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011250	CTTA	2	8	7749	7756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011250	TTAT	2	8	9311	9318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011250	TTAT	2	8	9514	9521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011250	TTTC	2	8	9725	9732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011250	ATCT	2	8	10809	10816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011250	AATA	2	8	12021	12028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011250	ATTA	2	8	12168	12175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011250	GATT	2	8	12176	12183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011250	TAGA	2	8	12330	12337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011250	AATA	2	8	12945	12952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011250	ATAA	2	8	13671	13678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011250	AATA	2	8	13930	13937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011250	GTTT	2	8	14027	14034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011250	ATTT	2	8	14174	14181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011250	TACA	2	8	14597	14604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011250	AATT	2	8	14736	14743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011250	CTTA	2	8	15002	15009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011250	ATGA	2	8	15067	15074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011250	GAAG	2	8	17103	17110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011250	AAAG	2	8	17150	17157	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011250	AAAT	2	8	17211	17218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011250	ATTA	2	8	17397	17404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011250	AATA	2	8	17851	17858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011250	AATT	2	8	18229	18236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011250	AACA	2	8	18392	18399	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011250	ATAA	2	8	18591	18598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011250	ATTT	2	8	18923	18930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011250	AGAA	2	8	18958	18965	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011250	AGAT	2	8	19120	19127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011250	TCAT	2	8	19215	19222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011250	TAAG	2	8	19297	19304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011250	AATA	2	8	19333	19340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011250	TAAT	2	8	20365	20372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011250	ACCA	2	8	21088	21095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011250	AAAT	2	8	21203	21210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011250	AATT	2	8	21319	21326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011250	ATTC	2	8	21435	21442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011250	TTAC	2	8	21482	21489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011250	ATTT	3	12	24975	24986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011250	ATTT	2	8	25112	25119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011250	CATT	2	8	25672	25679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011250	ATTT	2	8	26014	26021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011250	TTCA	2	8	26350	26357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011250	TTAA	2	8	26446	26453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011250	AATA	2	8	26567	26574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011250	TCTT	2	8	26685	26692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011250	AATT	2	8	27582	27589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011250	GTAA	2	8	27722	27729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011250	TTAT	2	8	28397	28404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011250	TAAT	2	8	29882	29889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011250	TAAA	2	8	32393	32400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011250	ATAA	2	8	32423	32430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011250	AAAT	2	8	32492	32499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011250	AATA	2	8	32674	32681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011250	AAAT	2	8	33553	33560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011250	TTAT	2	8	33663	33670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011250	TAAA	2	8	33732	33739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011250	GTAA	2	8	33895	33902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011250	GAAG	2	8	34064	34071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011250	AAAT	2	8	34817	34824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011250	TAAG	2	8	34842	34849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011250	TTTG	2	8	35003	35010	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011250	AGGA	2	8	35063	35070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011250	AGGA	2	8	35082	35089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011250	TTGC	2	8	35275	35282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011250	AAAT	2	8	35406	35413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011250	GAAG	2	8	35439	35446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011250	GTAA	2	8	35695	35702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011250	AAAG	2	8	35833	35840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011250	ATAA	2	8	35982	35989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011250	CATT	2	8	36136	36143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011250	GTAA	2	8	36950	36957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011250	AAAG	2	8	37394	37401	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011250	TAAA	2	8	37668	37675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011250	GCAA	2	8	37690	37697	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011250	TAAT	2	8	37884	37891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011250	AGAA	2	8	38040	38047	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011250	AGAT	2	8	39188	39195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011250	GAGG	2	8	39328	39335	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011250	TTGA	2	8	39362	39369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011250	TTTA	2	8	39436	39443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011250	TAAT	2	8	39468	39475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011250	AAAT	2	8	39673	39680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011250	GTAT	2	8	39771	39778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011250	AAAT	2	8	39980	39987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011250	GTAA	2	8	40054	40061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.