MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl36

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011249	GTATT	2	10	2223	2232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011249	CTATC	2	10	2870	2879	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011249	AAATC	2	10	3958	3967	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011249	TTATA	2	10	5599	5608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011249	GTAAA	2	10	8592	8601	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011249	AAATC	2	10	8722	8731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011249	TTGCT	2	10	9729	9738	0 %	60 %	20 %	20 %	203288665
8	NC_011249	CCTTT	2	10	12732	12741	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011249	AAAAT	2	10	12904	12913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011249	ACAAG	2	10	14765	14774	60 %	0 %	20 %	20 %	203288668
11	NC_011249	TAAAA	2	10	15036	15045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011249	CAAAA	2	10	15052	15061	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011249	AGTTA	2	10	15323	15332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011249	CTCTA	2	10	15351	15360	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011249	TCATA	2	10	16060	16069	40 %	40 %	0 %	20 %	203288669
16	NC_011249	TAAAA	2	10	16248	16257	80 %	20 %	0 %	0 %	203288669
17	NC_011249	TTTGA	2	10	17991	18000	20 %	60 %	20 %	0 %	203288671
18	NC_011249	AAAAG	2	10	18204	18213	80 %	0 %	20 %	0 %	203288672
19	NC_011249	TTTTG	2	10	18780	18789	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011249	ATCTA	2	10	19722	19731	40 %	40 %	0 %	20 %	203288673
21	NC_011249	TCTAT	2	10	20110	20119	20 %	60 %	0 %	20 %	203288673
22	NC_011249	TAATT	2	10	21080	21089	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011249	TATAT	2	10	21786	21795	40 %	60 %	0 %	0 %	203288674
24	NC_011249	TTTGC	2	10	22971	22980	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011249	ATATT	2	10	23419	23428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011249	TTTAT	2	10	26952	26961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011249	GGGAA	2	10	27321	27330	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011249	AGGAG	2	10	27351	27360	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011249	TTTTA	2	10	27980	27989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011249	AAATA	2	10	28426	28435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011249	AGATA	2	10	28795	28804	60 %	20 %	20 %	0 %	203288678
32	NC_011249	TTTTA	2	10	29502	29511	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011249	GGAAG	2	10	30045	30054	40 %	0 %	60 %	0 %	203288679
34	NC_011249	GAGAG	2	10	30748	30757	40 %	0 %	60 %	0 %	203288679
35	NC_011249	GGAAG	2	10	31471	31480	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011249	AGATA	2	10	31743	31752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011249	ATAAG	2	10	33352	33361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011249	TTTTA	2	10	34767	34776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011249	TATAT	2	10	35132	35141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011249	AAAAG	2	10	35709	35718	80 %	0 %	20 %	0 %	203288681

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.