MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl36

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011249	TATT	2	8	186	193	25 %	75 %	0 %	0 %	203288662
2	NC_011249	GTAA	2	8	388	395	50 %	25 %	25 %	0 %	203288662
3	NC_011249	TTAT	2	8	556	563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011249	ATCA	2	8	858	865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011249	CCTC	2	8	893	900	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_011249	AGAA	2	8	909	916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011249	TATT	2	8	1055	1062	25 %	75 %	0 %	0 %	203288663
8	NC_011249	TTTA	2	8	1187	1194	25 %	75 %	0 %	0 %	203288663
9	NC_011249	GATT	2	8	1490	1497	25 %	50 %	25 %	0 %	203288663
10	NC_011249	CTTT	2	8	2204	2211	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011249	ATTA	2	8	2245	2252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011249	TTAT	2	8	2293	2300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011249	CTTC	2	8	2452	2459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011249	TTTA	2	8	2503	2510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011249	ACTT	2	8	2535	2542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011249	TTAT	2	8	2648	2655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011249	ATTT	2	8	2676	2683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011249	ATTA	2	8	2839	2846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011249	ATTT	2	8	3629	3636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011249	ACTT	2	8	4231	4238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011249	TAAT	2	8	4243	4250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011249	TATT	2	8	4428	4435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011249	TTTA	2	8	4437	4444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011249	ATCA	2	8	4825	4832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011249	TAGT	2	8	5010	5017	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011249	ATTT	2	8	5431	5438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011249	TAAT	2	8	5586	5593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011249	TTTA	2	8	5848	5855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011249	ATTT	2	8	5974	5981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011249	TTTA	2	8	6102	6109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011249	TCTT	2	8	6430	6437	0 %	75 %	0 %	25 %	203288664
32	NC_011249	CTTC	2	8	6926	6933	0 %	50 %	0 %	50 %	203288664
33	NC_011249	ATTC	2	8	7182	7189	25 %	50 %	0 %	25 %	203288664
34	NC_011249	TAAT	2	8	7325	7332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011249	CTTA	2	8	7484	7491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011249	CCCT	2	8	7894	7901	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_011249	CTTA	2	8	8060	8067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011249	TTTA	2	8	8492	8499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011249	AATA	2	8	8551	8558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011249	ATCT	2	8	8970	8977	25 %	50 %	0 %	25 %	203288665
41	NC_011249	CTTT	2	8	9021	9028	0 %	75 %	0 %	25 %	203288665
42	NC_011249	TTTA	2	8	9088	9095	25 %	75 %	0 %	0 %	203288665
43	NC_011249	TCCT	2	8	9310	9317	0 %	50 %	0 %	50 %	203288665
44	NC_011249	CACT	2	8	9351	9358	25 %	25 %	0 %	50 %	203288665
45	NC_011249	ATTC	2	8	10045	10052	25 %	50 %	0 %	25 %	203288665
46	NC_011249	TTTA	2	8	10075	10082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011249	TTTA	2	8	10099	10106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011249	CAAA	2	8	10112	10119	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011249	ATTA	2	8	10262	10269	50 %	50 %	0 %	0 %	203288666
50	NC_011249	TTAT	2	8	10315	10322	25 %	75 %	0 %	0 %	203288666
51	NC_011249	TCTT	2	8	10510	10517	0 %	75 %	0 %	25 %	203288666
52	NC_011249	CACT	2	8	10655	10662	25 %	25 %	0 %	50 %	203288666
53	NC_011249	TTTC	2	8	11343	11350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011249	TAAA	2	8	11456	11463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011249	TCTA	2	8	11499	11506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011249	TTTA	2	8	11642	11649	25 %	75 %	0 %	0 %	203288667
57	NC_011249	TTCC	2	8	12508	12515	0 %	50 %	0 %	50 %	203288667
58	NC_011249	TTAT	2	8	12603	12610	25 %	75 %	0 %	0 %	203288667
59	NC_011249	CAAA	2	8	12758	12765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011249	AACA	2	8	12773	12780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011249	AAAT	2	8	12782	12789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011249	CATA	2	8	12863	12870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011249	TATT	2	8	13006	13013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011249	TTAC	2	8	13039	13046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011249	CTTA	2	8	13172	13179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011249	TTTC	2	8	13807	13814	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011249	CTTC	2	8	13926	13933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011249	CTAT	2	8	13991	13998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011249	ACAA	2	8	14231	14238	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011249	AATT	2	8	14293	14300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011249	ATCA	2	8	14610	14617	50 %	25 %	0 %	25 %	203288668
72	NC_011249	ATAA	2	8	15130	15137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011249	TAAT	2	8	15218	15225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011249	TATC	2	8	15277	15284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011249	ATTT	2	8	15498	15505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011249	AATA	2	8	15684	15691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011249	AATT	2	8	15743	15750	50 %	50 %	0 %	0 %	203288669
78	NC_011249	AATA	2	8	16009	16016	75 %	25 %	0 %	0 %	203288669
79	NC_011249	AAAG	2	8	16272	16279	75 %	0 %	25 %	0 %	203288669
80	NC_011249	AGGA	2	8	16382	16389	50 %	0 %	50 %	0 %	203288669
81	NC_011249	TAAA	2	8	16649	16656	75 %	25 %	0 %	0 %	203288669
82	NC_011249	AATG	2	8	16902	16909	50 %	25 %	25 %	0 %	203288670
83	NC_011249	GATA	2	8	17435	17442	50 %	25 %	25 %	0 %	203288671
84	NC_011249	GATA	2	8	17702	17709	50 %	25 %	25 %	0 %	203288671
85	NC_011249	ATTT	2	8	17809	17816	25 %	75 %	0 %	0 %	203288671
86	NC_011249	TAAA	2	8	17962	17969	75 %	25 %	0 %	0 %	203288671
87	NC_011249	AAGA	2	8	18607	18614	75 %	0 %	25 %	0 %	203288672
88	NC_011249	ATTA	2	8	18662	18669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011249	ATTC	2	8	18759	18766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011249	TATT	2	8	19118	19125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011249	TATT	2	8	19490	19497	25 %	75 %	0 %	0 %	203288673
92	NC_011249	ATGT	2	8	20575	20582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011249	AAAT	2	8	20908	20915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011249	AAAT	2	8	21152	21159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011249	AAAT	2	8	21337	21344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011249	GTTT	2	8	21810	21817	0 %	75 %	25 %	0 %	203288674
97	NC_011249	AAAT	2	8	22008	22015	75 %	25 %	0 %	0 %	203288674
98	NC_011249	TAAT	2	8	22236	22243	50 %	50 %	0 %	0 %	203288674
99	NC_011249	TAAT	2	8	22505	22512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011249	ATTA	2	8	22524	22531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011249	TATT	2	8	23150	23157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011249	CCTT	2	8	23276	23283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011249	ACTT	2	8	23299	23306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011249	ATTA	2	8	23486	23493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011249	ATTT	2	8	23705	23712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011249	AGAT	2	8	24482	24489	50 %	25 %	25 %	0 %	203288675
107	NC_011249	GTTC	2	8	24532	24539	0 %	50 %	25 %	25 %	203288675
108	NC_011249	GCAT	2	8	24705	24712	25 %	25 %	25 %	25 %	203288675
109	NC_011249	TGTT	2	8	25052	25059	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011249	ATAA	2	8	25159	25166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011249	ATTT	2	8	25192	25199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011249	TGTT	2	8	25245	25252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011249	AAAT	2	8	25778	25785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011249	TTTG	2	8	25820	25827	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011249	ATTA	2	8	26067	26074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011249	TAAG	2	8	26727	26734	50 %	25 %	25 %	0 %	203288676
117	NC_011249	AGAT	2	8	26756	26763	50 %	25 %	25 %	0 %	203288676
118	NC_011249	TACA	2	8	26969	26976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011249	CATT	2	8	27178	27185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011249	GTTT	2	8	27200	27207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011249	CTTT	2	8	27216	27223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011249	GTTG	2	8	27448	27455	0 %	50 %	50 %	0 %	203288677
123	NC_011249	AAAG	2	8	27724	27731	75 %	0 %	25 %	0 %	203288677
124	NC_011249	TAGA	2	8	27735	27742	50 %	25 %	25 %	0 %	203288677
125	NC_011249	CGAT	2	8	27798	27805	25 %	25 %	25 %	25 %	203288677
126	NC_011249	AATA	2	8	27929	27936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011249	TTTA	2	8	28047	28054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011249	ACAA	2	8	28096	28103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011249	TAAA	3	12	28414	28425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011249	AGGA	2	8	28521	28528	50 %	0 %	50 %	0 %	203288678
131	NC_011249	AATA	2	8	28532	28539	75 %	25 %	0 %	0 %	203288678
132	NC_011249	GTAA	2	8	28559	28566	50 %	25 %	25 %	0 %	203288678
133	NC_011249	GAAG	2	8	28726	28733	50 %	0 %	50 %	0 %	203288678
134	NC_011249	AATT	2	8	29826	29833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011249	CATT	2	8	29883	29890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011249	GGAA	2	8	30012	30019	50 %	0 %	50 %	0 %	203288679
137	NC_011249	GAAA	2	8	30027	30034	75 %	0 %	25 %	0 %	203288679
138	NC_011249	TGAG	2	8	30165	30172	25 %	25 %	50 %	0 %	203288679
139	NC_011249	AGCA	2	8	30346	30353	50 %	0 %	25 %	25 %	203288679
140	NC_011249	ATAA	2	8	31303	31310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011249	GAAG	2	8	31459	31466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011249	AATA	2	8	31481	31488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011249	AAGA	2	8	32165	32172	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011249	TAAT	2	8	32271	32278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011249	TGAG	2	8	32521	32528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011249	TAGG	2	8	32628	32635	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011249	AAAG	2	8	33071	33078	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011249	AAAG	2	8	33098	33105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011249	TAAA	2	8	33220	33227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011249	ATAA	2	8	33285	33292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011249	AACA	2	8	33787	33794	75 %	0 %	0 %	25 %	203288680
152	NC_011249	AAAG	2	8	33920	33927	75 %	0 %	25 %	0 %	203288680
153	NC_011249	ATAG	2	8	33930	33937	50 %	25 %	25 %	0 %	203288680
154	NC_011249	TAAA	2	8	33985	33992	75 %	25 %	0 %	0 %	203288680
155	NC_011249	GTAA	2	8	34142	34149	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011249	ATAG	2	8	34459	34466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011249	TAAT	2	8	35201	35208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011249	TATT	2	8	35229	35236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011249	TAAT	2	8	35247	35254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.