MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl36

Total Repeats: 327

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011249	ATT	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011249	AAC	2	6	574	579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011249	TTA	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011249	TTC	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011249	TCT	2	6	791	796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011249	CCT	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011249	TTA	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011249	AAT	2	6	2233	2238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011249	GAT	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011249	TCA	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011249	CCT	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011249	CTT	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011249	TCA	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011249	AGC	3	9	2462	2470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011249	AAT	2	6	2471	2476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011249	TTC	2	6	2492	2497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011249	CTT	2	6	2527	2532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011249	TAA	2	6	2557	2562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011249	TAT	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011249	ATA	2	6	2700	2705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011249	CTT	2	6	2803	2808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011249	TAT	2	6	2825	2830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011249	TAT	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011249	TGC	3	9	2985	2993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011249	ATT	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011249	GCA	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011249	ATT	2	6	3085	3090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011249	TTC	2	6	3108	3113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011249	ATC	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011249	CTG	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011249	CAT	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011249	TCT	2	6	3208	3213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011249	CAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011249	GCT	3	9	3277	3285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011249	ATC	3	9	3303	3311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011249	TAG	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011249	GCA	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011249	CAC	2	6	3485	3490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011249	ATC	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011249	TGC	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011249	TAA	2	6	3563	3568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011249	CAA	2	6	3575	3580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011249	TTC	2	6	3607	3612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011249	TTG	2	6	3650	3655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011249	CTT	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011249	CTA	2	6	3819	3824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011249	CAT	3	9	3842	3850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011249	TCT	3	9	3865	3873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011249	TTA	2	6	3913	3918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011249	TAA	2	6	3936	3941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011249	ACT	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011249	ATA	2	6	4026	4031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011249	TCT	2	6	4040	4045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011249	TAT	2	6	4377	4382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011249	AAG	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011249	TTA	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011249	AAC	2	6	4447	4452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011249	CCA	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011249	ATT	2	6	4562	4567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011249	GCA	2	6	4634	4639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011249	ACC	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011249	GCT	3	9	4685	4693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011249	AGC	4	12	4723	4734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011249	ATT	3	9	4768	4776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011249	AGC	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011249	TAT	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011249	ACC	2	6	4906	4911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011249	CAG	2	6	4917	4922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011249	AGC	2	6	4939	4944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011249	ACC	2	6	4954	4959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011249	CAT	2	6	4986	4991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011249	GTT	2	6	5144	5149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011249	TAT	2	6	5196	5201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011249	TTC	2	6	5312	5317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011249	CTC	2	6	5342	5347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011249	ATC	3	9	5380	5388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011249	ATT	2	6	5395	5400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011249	CCT	2	6	5487	5492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011249	ATT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011249	ATT	2	6	5650	5655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011249	CTA	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011249	TAC	2	6	5919	5924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011249	TAT	2	6	5957	5962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011249	ACA	2	6	6069	6074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011249	CCT	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011249	TAA	2	6	7228	7233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011249	ATT	2	6	7315	7320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011249	TAA	2	6	7412	7417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011249	TTA	2	6	7419	7424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011249	CTA	2	6	7501	7506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011249	CCT	2	6	7593	7598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011249	CTG	2	6	7672	7677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011249	TAT	2	6	7705	7710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011249	TCT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011249	GCT	4	12	7782	7793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011249	AGT	3	9	7826	7834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011249	AAC	2	6	7836	7841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011249	ATC	2	6	7862	7867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011249	AGC	2	6	8033	8038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011249	CTT	2	6	8039	8044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011249	CTT	2	6	8050	8055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011249	ACC	2	6	8350	8355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011249	ATC	2	6	8356	8361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011249	ATT	3	9	8365	8373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011249	TTC	2	6	8384	8389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011249	CTC	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_011249	TTC	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011249	CTT	2	6	8453	8458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011249	CCT	2	6	8483	8488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_011249	ATT	2	6	8570	8575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011249	AAT	2	6	8626	8631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011249	GTA	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011249	TAT	2	6	8711	8716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011249	TAA	2	6	8890	8895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011249	CCT	2	6	10059	10064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011249	ATT	2	6	10149	10154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011249	ACA	2	6	10158	10163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011249	AAT	2	6	10223	10228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011249	CCT	2	6	11355	11360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011249	AGA	2	6	11400	11405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011249	ATT	2	6	11429	11434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011249	ACA	2	6	11447	11452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011249	CTT	2	6	12683	12688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011249	TTA	2	6	12695	12700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011249	CCT	2	6	12724	12729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011249	ATT	3	9	12805	12813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011249	TAA	2	6	12816	12821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011249	TGA	2	6	12922	12927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011249	TCT	2	6	13080	13085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011249	TAT	2	6	13151	13156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011249	AGC	2	6	13235	13240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011249	ACC	2	6	13247	13252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_011249	CTG	2	6	13279	13284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011249	TTA	2	6	13335	13340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011249	CAC	2	6	13429	13434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_011249	CTG	2	6	13520	13525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011249	TAC	2	6	13531	13536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011249	TTA	2	6	13542	13547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011249	TCC	2	6	13566	13571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_011249	ACT	2	6	13575	13580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011249	CAC	2	6	13660	13665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_011249	TAA	2	6	13738	13743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011249	CAA	2	6	13750	13755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011249	CTT	2	6	13865	13870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011249	TCT	2	6	13937	13942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_011249	TAA	2	6	31942	31947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_011249	CTG	3	9	31974	31982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_011249	GGT	2	6	32051	32056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
288	NC_011249	TGC	3	9	32074	32082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_011249	CTG	2	6	32085	32090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_011249	GTT	2	6	32094	32099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011249	TCA	2	6	32253	32258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_011249	TAA	2	6	32264	32269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011249	TAA	2	6	32282	32287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011249	AAT	2	6	32339	32344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_011249	TAT	2	6	32398	32403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_011249	TGG	2	6	32464	32469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
297	NC_011249	TGG	2	6	32476	32481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
298	NC_011249	GTG	2	6	32491	32496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
299	NC_011249	GTG	2	6	32698	32703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_011249	AGT	2	6	34424	34429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
310	NC_011249	GTA	2	6	34477	34482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
311	NC_011249	AAT	2	6	34483	34488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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318	NC_011249	AGA	2	6	34905	34910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_011249	GTT	2	6	35041	35046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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326	NC_011249	AAT	2	6	35164	35169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_011249	TTG	2	6	35211	35216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.