MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl36

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011249	TA	3	6	223	228	50 %	50 %	0 %	0 %	203288662
2	NC_011249	AT	3	6	288	293	50 %	50 %	0 %	0 %	203288662
3	NC_011249	AT	3	6	495	500	50 %	50 %	0 %	0 %	203288662
4	NC_011249	TA	3	6	590	595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011249	AT	4	8	664	671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011249	GT	3	6	917	922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011249	GA	3	6	1001	1006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011249	TA	5	10	2147	2156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011249	CT	3	6	2439	2444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011249	AT	3	6	2722	2727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011249	TC	3	6	2755	2760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011249	AT	3	6	3236	3241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011249	TA	3	6	3995	4000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011249	CT	4	8	4044	4051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011249	TA	4	8	4093	4100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011249	TC	3	6	4371	4376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011249	CT	3	6	5414	5419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011249	CT	4	8	5423	5430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011249	CT	3	6	5439	5444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011249	TA	3	6	5548	5553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011249	AT	3	6	5676	5681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011249	TC	3	6	5712	5717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011249	AT	3	6	6019	6024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011249	TA	3	6	6059	6064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011249	AT	3	6	6524	6529	50 %	50 %	0 %	0 %	203288664
26	NC_011249	TA	3	6	7255	7260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011249	AT	3	6	7337	7342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011249	AT	3	6	7750	7755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011249	TC	3	6	8464	8469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011249	TC	3	6	9345	9350	0 %	50 %	0 %	50 %	203288665
31	NC_011249	CT	3	6	9554	9559	0 %	50 %	0 %	50 %	203288665
32	NC_011249	TC	3	6	10301	10306	0 %	50 %	0 %	50 %	203288666
33	NC_011249	TA	3	6	11419	11424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011249	TA	3	6	11435	11440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011249	CT	3	6	12444	12449	0 %	50 %	0 %	50 %	203288667
36	NC_011249	TC	3	6	12579	12584	0 %	50 %	0 %	50 %	203288667
37	NC_011249	TC	3	6	12632	12637	0 %	50 %	0 %	50 %	203288667
38	NC_011249	TC	4	8	12652	12659	0 %	50 %	0 %	50 %	203288667
39	NC_011249	AT	3	6	13729	13734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011249	TG	3	6	14049	14054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011249	AT	3	6	14393	14398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011249	AC	3	6	14508	14513	50 %	0 %	0 %	50 %	203288668
43	NC_011249	AC	4	8	14624	14631	50 %	0 %	0 %	50 %	203288668
44	NC_011249	TA	4	8	15015	15022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011249	TC	3	6	15147	15152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011249	AT	3	6	15271	15276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011249	TA	3	6	15345	15350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011249	TA	3	6	15519	15524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011249	TG	3	6	15574	15579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011249	TA	4	8	16113	16120	50 %	50 %	0 %	0 %	203288669
51	NC_011249	TC	3	6	16212	16217	0 %	50 %	0 %	50 %	203288669
52	NC_011249	AG	3	6	16464	16469	50 %	0 %	50 %	0 %	203288669
53	NC_011249	AT	3	6	16885	16890	50 %	50 %	0 %	0 %	203288670
54	NC_011249	TA	3	6	17134	17139	50 %	50 %	0 %	0 %	203288670
55	NC_011249	TA	3	6	17694	17699	50 %	50 %	0 %	0 %	203288671
56	NC_011249	AT	3	6	17839	17844	50 %	50 %	0 %	0 %	203288671
57	NC_011249	AC	3	6	17887	17892	50 %	0 %	0 %	50 %	203288671
58	NC_011249	AG	3	6	17952	17957	50 %	0 %	50 %	0 %	203288671
59	NC_011249	TA	3	6	18009	18014	50 %	50 %	0 %	0 %	203288671
60	NC_011249	AT	3	6	18050	18055	50 %	50 %	0 %	0 %	203288671
61	NC_011249	AG	3	6	18537	18542	50 %	0 %	50 %	0 %	203288672
62	NC_011249	TG	3	6	18970	18975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011249	AT	3	6	19108	19113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011249	TA	3	6	19154	19159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011249	GA	3	6	19300	19305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011249	TA	3	6	19664	19669	50 %	50 %	0 %	0 %	203288673
67	NC_011249	TA	3	6	20123	20128	50 %	50 %	0 %	0 %	203288673
68	NC_011249	TA	3	6	20371	20376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011249	TA	4	8	20396	20403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011249	AT	3	6	20405	20410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011249	TA	3	6	20842	20847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011249	AT	4	8	21178	21185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011249	AT	3	6	21287	21292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011249	GA	3	6	21567	21572	50 %	0 %	50 %	0 %	203288674
75	NC_011249	TA	4	8	21928	21935	50 %	50 %	0 %	0 %	203288674
76	NC_011249	TA	3	6	22067	22072	50 %	50 %	0 %	0 %	203288674
77	NC_011249	TA	3	6	22077	22082	50 %	50 %	0 %	0 %	203288674
78	NC_011249	TA	3	6	22411	22416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011249	AT	3	6	23096	23101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011249	AG	3	6	23171	23176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011249	AT	4	8	23373	23380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011249	GT	3	6	23740	23745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011249	TG	3	6	24161	24166	0 %	50 %	50 %	0 %	203288675
84	NC_011249	TA	3	6	24268	24273	50 %	50 %	0 %	0 %	203288675
85	NC_011249	AG	3	6	24544	24549	50 %	0 %	50 %	0 %	203288675
86	NC_011249	AT	3	6	24711	24716	50 %	50 %	0 %	0 %	203288675
87	NC_011249	TA	3	6	24893	24898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011249	AT	3	6	24932	24937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011249	TA	3	6	25106	25111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011249	TA	3	6	25446	25451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011249	TA	3	6	25455	25460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011249	GT	3	6	26173	26178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011249	AT	3	6	26187	26192	50 %	50 %	0 %	0 %	203288676
94	NC_011249	AT	3	6	26210	26215	50 %	50 %	0 %	0 %	203288676
95	NC_011249	AT	3	6	27017	27022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011249	AC	3	6	27067	27072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011249	AT	5	10	27073	27082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011249	AG	3	6	27315	27320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011249	AG	3	6	27623	27628	50 %	0 %	50 %	0 %	203288677
100	NC_011249	GT	3	6	27992	27997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011249	AT	3	6	28008	28013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011249	AT	3	6	28145	28150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011249	TG	3	6	28200	28205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011249	TA	3	6	28322	28327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011249	AT	3	6	29139	29144	50 %	50 %	0 %	0 %	203288678
106	NC_011249	AT	3	6	29709	29714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011249	AG	4	8	29985	29992	50 %	0 %	50 %	0 %	203288679
108	NC_011249	AG	3	6	31097	31102	50 %	0 %	50 %	0 %	203288679
109	NC_011249	TA	3	6	31140	31145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011249	AG	3	6	31177	31182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011249	CT	3	6	31191	31196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011249	TA	3	6	31223	31228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011249	TA	3	6	31238	31243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011249	AG	3	6	31362	31367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011249	GA	4	8	31375	31382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011249	AT	3	6	32299	32304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011249	TA	3	6	32318	32323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011249	CT	3	6	32378	32383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011249	TA	3	6	32410	32415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011249	GA	3	6	32813	32818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011249	AT	3	6	32965	32970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011249	GA	3	6	33301	33306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011249	CT	3	6	33438	33443	0 %	50 %	0 %	50 %	203288680
124	NC_011249	TA	3	6	33469	33474	50 %	50 %	0 %	0 %	203288680
125	NC_011249	GA	3	6	33580	33585	50 %	0 %	50 %	0 %	203288680
126	NC_011249	AG	3	6	34173	34178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011249	GT	3	6	34559	34564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011249	AT	3	6	34574	34579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.