MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl35

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011248	ATTA	2	8	1506	1513	50 %	50 %	0 %	0 %	203288642
2	NC_011248	CATT	2	8	1550	1557	25 %	50 %	0 %	25 %	203288642
3	NC_011248	TTCT	2	8	1631	1638	0 %	75 %	0 %	25 %	203288642
4	NC_011248	TAAA	2	8	2060	2067	75 %	25 %	0 %	0 %	203288642
5	NC_011248	CCTT	2	8	3644	3651	0 %	50 %	0 %	50 %	203288643
6	NC_011248	TCCT	2	8	3666	3673	0 %	50 %	0 %	50 %	203288643
7	NC_011248	TATC	2	8	4430	4437	25 %	50 %	0 %	25 %	203288644
8	NC_011248	ATTA	2	8	4713	4720	50 %	50 %	0 %	0 %	203288644
9	NC_011248	TTAG	2	8	4732	4739	25 %	50 %	25 %	0 %	203288644
10	NC_011248	ATTA	2	8	5396	5403	50 %	50 %	0 %	0 %	203288645
11	NC_011248	TTAT	2	8	5449	5456	25 %	75 %	0 %	0 %	203288645
12	NC_011248	TCTT	2	8	5671	5678	0 %	75 %	0 %	25 %	203288645
13	NC_011248	ATTC	2	8	6420	6427	25 %	50 %	0 %	25 %	203288645
14	NC_011248	CTTT	2	8	8147	8154	0 %	75 %	0 %	25 %	203288646
15	NC_011248	CTTC	2	8	8395	8402	0 %	50 %	0 %	50 %	203288646
16	NC_011248	CTTC	2	8	8423	8430	0 %	50 %	0 %	50 %	203288646
17	NC_011248	TTAC	2	8	8680	8687	25 %	50 %	0 %	25 %	203288646
18	NC_011248	CTTA	2	8	9703	9710	25 %	50 %	0 %	25 %	203288647
19	NC_011248	CTTC	2	8	9795	9802	0 %	50 %	0 %	50 %	203288647
20	NC_011248	CTTA	2	8	12825	12832	25 %	50 %	0 %	25 %	203288648
21	NC_011248	TCGC	2	8	12920	12927	0 %	25 %	25 %	50 %	203288648
22	NC_011248	ACTA	2	8	13419	13426	50 %	25 %	0 %	25 %	203288648
23	NC_011248	ATTT	2	8	13667	13674	25 %	75 %	0 %	0 %	203288648
24	NC_011248	TTAT	2	8	14110	14117	25 %	75 %	0 %	0 %	203288649
25	NC_011248	TTTC	2	8	14321	14328	0 %	75 %	0 %	25 %	203288649
26	NC_011248	CTTC	2	8	14411	14418	0 %	50 %	0 %	50 %	203288649
27	NC_011248	TCTT	2	8	14536	14543	0 %	75 %	0 %	25 %	203288649
28	NC_011248	CATA	2	8	21870	21877	50 %	25 %	0 %	25 %	203288651
29	NC_011248	ATTA	2	8	23527	23534	50 %	50 %	0 %	0 %	203288652
30	NC_011248	TTAT	2	8	23586	23593	25 %	75 %	0 %	0 %	203288652
31	NC_011248	CAAT	2	8	23632	23639	50 %	25 %	0 %	25 %	203288652
32	NC_011248	TCTT	2	8	23781	23788	0 %	75 %	0 %	25 %	203288652
33	NC_011248	TCTT	2	8	23886	23893	0 %	75 %	0 %	25 %	203288652
34	NC_011248	ATTC	2	8	24599	24606	25 %	50 %	0 %	25 %	203288652
35	NC_011248	ATTA	2	8	24793	24800	50 %	50 %	0 %	0 %	203288653
36	NC_011248	TTAT	2	8	24846	24853	25 %	75 %	0 %	0 %	203288653
37	NC_011248	TCTT	2	8	25032	25039	0 %	75 %	0 %	25 %	203288653
38	NC_011248	TCTT	2	8	25056	25063	0 %	75 %	0 %	25 %	203288653
39	NC_011248	CTTA	2	8	25481	25488	25 %	50 %	0 %	25 %	203288653
40	NC_011248	TGAT	2	8	25726	25733	25 %	50 %	25 %	0 %	203288653
41	NC_011248	TAAC	2	8	26655	26662	50 %	25 %	0 %	25 %	203288654
42	NC_011248	ACTA	2	8	26791	26798	50 %	25 %	0 %	25 %	203288654
43	NC_011248	CCTT	2	8	28041	28048	0 %	50 %	0 %	50 %	203288655
44	NC_011248	TCTT	2	8	28322	28329	0 %	75 %	0 %	25 %	203288655
45	NC_011248	ATTT	2	8	28457	28464	25 %	75 %	0 %	0 %	203288655
46	NC_011248	TTTA	2	8	28545	28552	25 %	75 %	0 %	0 %	203288656
47	NC_011248	TATT	2	8	28931	28938	25 %	75 %	0 %	0 %	203288656
48	NC_011248	AATA	2	8	29358	29365	75 %	25 %	0 %	0 %	203288657
49	NC_011248	AAAC	2	8	29579	29586	75 %	0 %	0 %	25 %	203288657
50	NC_011248	AAAT	2	8	32289	32296	75 %	25 %	0 %	0 %	203288658
51	NC_011248	CAAT	2	8	32433	32440	50 %	25 %	0 %	25 %	203288658
52	NC_011248	CAAT	2	8	32462	32469	50 %	25 %	0 %	25 %	203288658
53	NC_011248	ATAA	2	8	32930	32937	75 %	25 %	0 %	0 %	203288658
54	NC_011248	AAGA	2	8	33540	33547	75 %	0 %	25 %	0 %	203288658
55	NC_011248	CGCC	2	8	33713	33720	0 %	0 %	25 %	75 %	203288658
56	NC_011248	AGAA	2	8	33822	33829	75 %	0 %	25 %	0 %	203288658
57	NC_011248	GTAT	2	8	34017	34024	25 %	50 %	25 %	0 %	203288659
58	NC_011248	AGAA	2	8	34194	34201	75 %	0 %	25 %	0 %	203288659
59	NC_011248	TCAG	2	8	34404	34411	25 %	25 %	25 %	25 %	203288659
60	NC_011248	TTTA	3	12	34499	34510	25 %	75 %	0 %	0 %	203288660
61	NC_011248	ATCC	2	8	35028	35035	25 %	25 %	0 %	50 %	203288660

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.